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HSP70-2基因多态性对北京油鸡精液品质的影响及其抗热应激功能验证
作 者: 刘伟平
导 师: 陈国宏;陈继兰
学 校: 扬州大学
专 业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 北京油鸡 繁殖性能 热应激 HSP70-2基因
分类号: S831
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
本研究以北京油鸡种公鸡为试验材料,以热休克蛋白70-2基因(HSP70-2)为候选基因,分析该基因5’侧翼区和编码区的遗传多态性与北京油鸡公鸡精液品质的相关性,并研究热应激对不同基因型公鸡繁殖性状及HSP70-2基因mRNA表达量的影响。旨在为北京油鸡繁殖力标记辅助育种研究奠定基础。试验一:选用220只北京油鸡成年公鸡为研究对象,检测HSP70-2的多态性,并分析其多态性及基因型(组合)对精液品质性状的影响。试验二:在试验一基础上,按基因型组合选用84只30周龄北京油鸡公鸡,分成热应激组(37℃,10h;30℃,14h)和对照组(23℃;24h),应激10天,测定精液品质、受精率、入孵蛋孵化率、受精蛋孵化率、健雏率及HSP70-2基因mRNA表达量。研究不同基因型及其组合公鸡抗热应激能力的差异。主要研究结果如下:1.采用PCR-SSCP、PCR-RFLP及测序技术对HSP70-2基因进行多态性筛查,结果发现A-68G(P5)、G286C(P7)和A1054G(P8)三个突变。用TFSEARCH软件预测发现,P5位点的突变产生了一个MZF-1调控元件的结合位点,可能对HSP70-2基因的转录产生影响;编码区P7和P8位点发生的突变为沉默突变,未引起氨基酸序列的改变。多态位点基因型与精液品质关联分析表明,5’侧翼区P5位点AG基因型为精子活力、精子活率、精子畸形率的不利基因型,编码区P7位点GG基因型为精子活力和精子畸形率的优势基因型,P8位点AG基因型为精液pH和精子畸形率的不利基因型。2.P5、P7和P8三位点两两组合基因型与精液品质性状关联分析的结果表明,P5P7位点AGCC基因型组合和P5P8位点AGAG基因型组合为精子活力及畸形率的不利基因型。3.选择P5、P8两个位点共五种组合基因型个体进行热应激试验,结果表明,应激后五种基因型组合个体精子活力均出现不同程度下降,畸形率较对照组显著升高(P<0.05)。AGAG型的精液品质受热应激影响下降最严重。五种基因型组合HSP70-2基因mRNA表达检测结果表明,不同处理组相同基因型间表达差异显著(p<0.05),热应激后AAAA型最高,AGGG型最低。不同基因型相同处理组间表达差异显著(p<0.05),AAAA型在应激组中最高,AGAG基因型表达量受热应激影响最大。4.孵化试验结果表明,P5P8热应激期间,P5、P8两个位点组合中突变纯合基因型GGGG型受精率、孵化率和健雏率高于杂合基因型AGAG型。两种基因型热应激期的受精率、孵化率和健雏率显著低于恢复期,应激结束一至两周后恢复正常。AGAG基因型受精率、孵化率和健雏率受温度影响较大。综上所述,HSP70-2基因的突变可能是影响北京油鸡精液品质的重要因素之一,剔除P5P8组合中AGAG不利基因型个体,可能提高北京油鸡的繁殖性能。同时,本试验首次从鸡繁殖性能角度验证了HSP70-2基因抗热应激功能的存在。
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全文目录
中文摘要 8-10 Abstract 10-14 第一章 文献综述 14-25 1. 公畜繁殖性状的研究意义 14-15 2. HSP70-2 基因研究进展 15-17 2.1 HSP70-2 与精子发生 15-17 2.1.1 HSP70-2 与生精细胞的细胞周期 15-16 2.1.2 HSP70-2 与生精细胞联会复合体(SC)的装配 16 2.1.3 HSP70-2 在生精细胞凋亡中的作用 16-17 2.2 HSP70-2 基因结构及定位 17 2.3 HSP70-2 作为鸡繁殖性状分子标记的可行性 17 3. 热应激与繁殖性状 17-20 3.1 热应激 17-18 3.2 热应激对种公畜繁殖机能的影响 18-20 3.2.1 热应激对射精量的影响 18-19 3.2.2 热应激对精子活力的影响 19 3.2.3 热应激对畸形率的影响 19 3.2.4 热应激对精子密度的影响 19-20 4. 遗传标记辅助选择 20-22 4.1 遗传标记 20 4.2 单核苷酸多态性 20-21 4.3 SNPs 的检测方法 21-22 4.3.1 PCR-SSCP 法 21 4.3.2 PCR-RFLP 21-22 4.3.3 高分辨率熔解曲线 22 5. 实时荧光定量 PCR 分析技术 22-25 5.1 实时荧光定量PCR 的原理 23 5.2 实时荧光定量PCR 的定量方法 23-25 5.2.1 标准曲线法的相对定量 24 5.2.2 标准曲线法的绝对定量 24 5.2.3 比较Ct 法的相对定量 24-25 第二章 北京油鸡 HSP70-2 基因多态性与鸡精液品质性状的相关性研究 25-44 1. 材料 25-26 1.1 试验动物与饲养 25 1.2 样品的采集 25 1.3 主要试剂 25-26 1.3.1 精液品质检测 25 1.3.2 基因组DNA 提取 25-26 1.3.3 PCR-SSCP 26 1.3.4 酶切 26 2. 试验方法 26-31 2.1 精液品质测定 26-28 2.1.1 精液量 26-27 2.1.2 精液pH 27 2.1.3 精子活率 27 2.1.4 精子活力 27 2.1.5 精子畸形率 27 2.1.6 精子密度 27-28 2.2 鸡基因组DNA 提取 28 2.3 引物设计及扩增 28-30 2.3.1 引物设计 28-29 2.3.2 目的片段的扩增 29-30 2.4 测序 30 2.5 PCR-SSCP 30-31 2.5.1 非变性聚丙烯酞胺凝胶的制备 30 2.5.2 硝酸银染色 30-31 2.6 酶切 31 2.7 数据统计和分析 31 3. 结果 31-36 3.1 北京油鸡基因组DNA 和PCR 产物结果 31-32 3.1.1 基因组DNA 提取结果 31-32 3.1.2 PCR 产物结果 32 3.2 北京油鸡HSP70-2 基因多态性分析结果 32-35 3.2.1 HSP70-2 基因P1、P2、P3 位点测序分析图 33-34 3.2.2 P5 位点多态性分析 34 3.2.3 P7 位点多态性分析 34 3.2.4 P8 位点多态性分析 34-35 3.3 HSP70-2 基因多态性与精液品质相关性状最小二乘分析 35-36 3.3.1 HSP70-2 基因单位点不同基因型与精液品质性状关联分析 35 3.3.2 HSP70-2 基因两位点组合基因型与精液品质性状关联分析 35-36 4. 讨论 36-42 4.1 基因组DNA 的提取及检测 36-39 4.2 关于影响PCR 扩增反应的因素 39 4.3 PCR-SSCP 法的优化 39-40 4.4 PCR-RFLP 法 40 4.5 HSP70-2 基因单核苷酸多态分析 40-42 4.5.1 单位点单核苷酸多态性与精液品质性状分析 40-41 4.5.2 双位点组合基因型与精液品质性状分析 41-42 5. 结论 42-44 第三章 热应激对 HSP70-2 基因不同组合基因型公鸡繁殖性能的影响 44-64 1. 试验材料 44-45 1.1 试验动物与饲养 44 1.2 样品的采集 44-45 1.3 主要试剂 45 2. 试验方法 45-50 2.1 精液品质测定 45-46 2.2 受精率、孵化率及健雏率 46 2.3 实时荧光定量PCR 引物设计 46 2.4 总 RNA 提取及 cDNA 第一链合成、检测 46-48 2.4.1 总RNA 提取 46-47 2.4.2 总RNA 检测 47 2.4.3 cDNA 第一链合成 47 2.4.4 cDNA 第一链合成检测 47-48 2.5 荧光定量PCR 48 2.5.1 荧光定量PCR 反应体系 48 2.5.2 荧光定量PCR 扩增程序 48 2.6 统计分析 48-50 2.6.1 荧光定量计算方法 48-49 2.6.2 引物扩增效率计算 49-50 2.6.3 数据整理与统计 50 3. 结果 50-60 3.1 短期热应激对北京油鸡种公鸡精液品质的影响 50-54 3.1.1 热应激对HSP70-2 基因单位点不同基因型精液品质性状关联分析 50-53 3.1.2 热应激对HSP70-2 基因两位点不同基因型组合精液品质性状关联分析 53-54 3.2 热应激对不同基因型组合受精率、孵化率及健雏率的影响 54-56 3.3 RNA 及反转录检测 56-60 3.3.1 常规PCR 及测序结果 57 3.3.2 Real-time 荧光定量检测 57-59 3.3.3 候选基因mRNA 表达结果 59-60 4. 讨论 60-63 4.1 短期热应激对北京油鸡HSP70-2 基因不同基因型精液品质影响 60-61 4.2 短期热应激对北京油鸡HSP70-2 基因不同基因型种蛋受精率、孵化率和健雏率的影响 61 4.3 HSP70-2 基因不同基因型表达分析 61-63 5. 结论 63-64 第四章 全文结论 64-65 参考文献 65-73 致谢 73-75 攻读学位期间发表学术论文目录 75
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家禽 > 鸡
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