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公牛HSP基因多态性与精液品质及后裔性能的相关分析

作　者: 廖旭东
导　师: 王根林
学　校: 南京农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 公牛 热应激 精液品质 后裔性能 热休克蛋白(HSP)
分类号: S823
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


本研究目的在于从分子水平上揭示HSP基因与公牛后裔性能之间的相关性,为标记辅助选择抗热应激奶牛提供科学理论依据,进而加速奶牛选育的进程。本研究以142头种公牛为研究对象,采用PCR-SSCP技术对公牛HSP基因(HSPA8和HSPA1A)进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,并分析与其精液品质及后裔测定成绩的相关。研究结果如下：1 HSP基因PCR-SSCP检测分析根据NCBI数据库中登录的牛HSPA8基因外显子部分序列和HSPA1A基因外显子部分序列,利用Primer5.0软件设计两对特异引物,扩增PCR产物。采用PCR-SSCP方法检测HSP基因多态性,并对PCR产物进行克隆测序和序列分析。结果发现：HSPA8存在T3358C转换突变,该突变使缬氨酸(Val)变为异亮氨酸(11e),产生2种基因型AA和AB,频率分别为0.5775和0.4225,λ2检验表明公牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡；HSPA1A发现A6201C和T6202A颠换突变,其中T6202A突变使苯丙氨酸(Phe)变为异亮氨酸(Ile),产生了5种基因型AA、AB、BB、AC和BC,频率分别为0.3451、0.4930、0.0845、0.0352和0.0422,公牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡。2公牛HSP基因多态性与后裔性能采用最小二乘拟合线性模型,分析公牛HSP基因多态性与后裔性能的相关,结果表明：在HSPA8座位AA基因型个体产量育种值显著高于AB型(P<0.05),AA基因型个体305天产奶量显著高于AB型(P<0.05)；在HSPA1A座位BB基因型个体产量育种值显著高于AC型(P<0.05),AB基因型个体蛋白育种值显著高于AC型(P<0.05),AC基因型个体305天产奶量显著高于BB型(P<0.05)。3公牛HSP基因多态性与精液品质选择上海、南京、河南等地2006至2009年的41头种公牛,通过调用SPSS17.0统计软件GLM(General Linear Model)过程,用单因素方差分析确定在不同季节条件下公牛HSP基因多态性与其精液品质各指标的相关,不同处理的比较用最小二乘均值检验。结果表明：夏季热应激期精子活力、顶体完整率均处于最低水平,极显著低于春、秋、冬3个非热应激季节(P<0.01)。热应激对种公牛精子密度的影响差异极显著(P<0.01),其以夏季过后的秋季最低。精子畸形率在夏、秋两季均处于较高水平,与春、冬两季相比差异极显著(P<0.01)。而热应激对采精量影响不大(P>0.05)。在HSPA8,精子密度、精子活力和顶体完整率AA均显著高于AB(P<0.05),而精子畸形率AA显著低于AB(P<0.05)；在HSPA1A,精子密度BC极显著低于AA(P<0.01),精子活力AC极显著低于AB(P<0.01),而精子畸形率AB极显著高于AC(P<0.01)。

全文目录


摘要  7-9ABSTRACT  9-11引言  11-12第一章 文献综述  12-24  1 HSP基本概述  12-17    1.1 HSP家族  12-13    1.2 HSP的分类  13    1.3 HSP基因结构特点  13-14    1.4 HSP的生物学功能  14-16    1.5 HSP的表达调节机制  16-17  2 HSP与动物热应激  17-21    2.1 热应激的定义  17-18    2.2 热应激对精液品质的影响  18-20    2.3 热应激对繁殖机能的影响  20-21  3 本研究的目的意义和内容  21-24    3.1 研究目的和意义  21    3.2 研究内容  21-24第二章 实验研究  24-42  一、公牛HSP基因PCR-SSCP检测分析  24-34    1 材料和方法  24-28      1.1 实验动物及生产记录  24-25      1.2 主要仪器及试剂  25      1.3 精液基因组DNA的提取及检测  25-26      1.4 引物设计和PCR扩增  26      1.5 PCR-SSCP检测  26-27      1.6 克隆测序  27-28      1.7 统计分析  28    2 结果  28-32      2.1 PCR扩增结果  28-29      2.2 PCR-SSCP检测结果  29      2.3 测序结果  29-30      2.4 基因频率、基因型频率、遗传参数分析  30-31      2.5 Hardy-Weinberg平衡检验  31-32    3 讨论  32-34      3.1 公牛群体内遗传参数  32      3.2 HSP基因遗传多态性  32-34  二、公牛HSP基因多态性与后裔性能的关系分析  34-38    1 材料和方法  34-35      1.1 实验材料  34-35      1.2 实验方法  35      1.3 统计分析  35    2 结果  35-36    3 讨论  36-38      3.1 热应激导致产奶量下降的原因分析  36      3.2 热应激对生产性能的影响  36-37      3.3 公牛HSP基因多态性与后裔性能  37-38  三、公牛HSP基因多态性与精液品质的关系分析  38-42    1 材料和方法  38-39      1.1 实验材料  38      1.2 实验方法  38-39      1.3 统计分析  39    2 结果  39-41    3 讨论  41-42      3.1 不同季节对种公牛精液品质的影响  41      3.2 公牛HSP基因多态性与精液品质  41-42参考文献  42-48全文结论  48-50致谢  50

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 牛
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