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中国人静止型α-地中海贫血基因单核苷酸变异、单体型及诊断方法研究

作　者: 欧阳鸿
导　师: 徐湘民
学　校: 第一军医大学
专　业: 细胞生物学
关键词: 静止型α-地中海贫血基因缺失 DNA测序同源性分析变性高效液相色谱基因诊断
分类号: R556
类　型: 硕士论文
年　份: 2002年
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内容摘要

背景和目的中国南方是α-地中海贫血的高发地区，静止型α-地中海贫血的-α^3.7、-α^4.2和-α^4.2HbQ基因的序列特征仍未明确，现有针对基因缺失的检测方法较难适应大规模人群筛查及临床诊断的需要。本研究的目的是通过多样本测序获得与中国人静止型α-地中海贫血-α^3.7、-α^4.2和-α^4.2HbQ基因缺失断裂点相关的单核苷酸变异及单体型，为阐明其分子机制提供有价值的信息，并在此基础上设计新的静止型α-地中海贫血快速检测技术。设计和方法针对-α^3.7、-α^4.2和-α^4.2HbQ基因以及相应正常人α-珠蛋白基因同源序列（X2、X1盒和Z2、Z1盒），设计PCR扩增体系，并将PCR产物直接测序以获取其DNA序列。对所测得的8个-α^3.7基因、10个-α^4.2基因（其中1例为以色列人样品）、3例-α^4.2HbQ基因和4例正常同源基因的序列进行同源性比较，寻找与-α^3.7、-α^4.2和-α^4.2HbQ基因缺失断裂点相关的单核苷酸变异及单体型，并在此基础上建立针对这些特征序列的PCR-DHPLC检测技术。结果和解释获得了中国人-α^3.7、-α^4.2HbQ和-α^4.2基因（其中1例来源于以色列人）以及正常人同源片断X2、X1、Z2和Z1盒的序列。对所测序列进行同源性比较和综合分析：（1）上述序列高度保守，仅在-α^3.7基因和Z2盒中发现1个反映中国人种的A／G多态性位点；（2）-α^3.7基因的测序结果验证了Orkin所报道的与-α^3.7缺失断裂点相关的5个序列标记位点，这些位点证明-α^3.7_基因是由Z2盒和Z1盒不等交换构成的嵌合基因；（3）-α^4.2基因的测序结果显示，在-α^4.2HbQ、-α^4.2和以色列人-α^4.2基因中与-α^4.2缺失断裂点相关的单核苷酸标记位点有13个，根据这些特征位点可以推断出这三种基因都是X2和X1盒不等交换构成的嵌合基因，但每种基因的两个X盒所占的比例不同，说明-α^4.2基因缺失断裂点并不是唯一的，存在多种导致-α^4.2缺失的分子机制。此外，我们发现这三种-α^4.2基因彼此之间存在6处单核昔酸变异，构成它们对应的单体型。利用心u基因的这些单核苦酸变异位点，建立了检测。功。。、。u似。、…亚A／。＊和心‘2mqaa等四种基因型的PCR0HPLC分子诊断技术。结论本研究获得了中国人．a刃和．au基因及其正常人同源片段的DNA序列，为阐明中国人静止型a．地中海贫血的咆u缺失的分子机制提供了有价值的信息。利用o＊基因特有的单核昔酸变异和单体型，建立了可以快速筛查aa／aa、．a‘“／aa、．．’‘“／．a‘“和．a‘““‘Q灯a等四种基因型的PCR．DHPLC分子诊断技术。

全文目录

英文缩略词表  4-6
中文摘要  6-8
英文摘要  8-11
引言  11-16
实验材料  16-19
实验方法  19-24
实验结果  24-35
分析与讨论  35-38
小结  38-39
参考文献  39-42
综述  42-54
  参考文献  50-54
附图  54-67
致谢  67-68
附录  68

中国人静止型α-地中海贫血基因单核苷酸变异、单体型及诊断方法研究

内容摘要

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