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电喷雾质谱法研究鸟嘌呤四链DNA的结构性质

作　者: 王晓录
导　师: 国新华
学　校: 吉林大学
专　业: 分析化学
关键词: 电喷雾质谱 DNA鸟嘌呤四链结构 抗艾滋病毒整合酶 CD光谱
分类号: O629.7
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 29次
引　用: 1次
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内容摘要


电喷雾是软的离子化技术,稳定分子的非共价相互作用在离子从液体相转移到气体相的过程中可以不被破坏；而且电喷雾质谱具有分析速度快,灵敏度高等优点。因此在测定分子间相互作用和化学计量方面都显示出特殊的优势。电喷雾质谱的方法已经被用于蛋白和核酸结构性质的分析,能够提供其他分析方法不能提供的结构信息。本论文主要运用电喷雾质谱技术,结合圆二色谱技术从以下两个方面研究了由不同的富含鸟嘌呤的寡聚脱氧核糖核酸(DNA)序列形成的四链结构方面的性质：1.利用电喷雾质谱结合圆二色谱技术,对T30175与T30923序列以及在其基础上设计而得到的九条序列在醋酸铵溶液中形成的三维结构进行研究。有报道指出,T30175和T30923两条序列与93delDNA序列一样折叠成四链结构后,均具有纳摩尔级的抗艾滋病毒整合酶的活性。由T30175和T30923衍生得到的其他九条序列与他们相比,则显示不同的热力学稳定性和抗艾滋病毒整合酶的活性。我们的质谱与圆二色谱测定的结果显示,除T30677序列以外,其他序列也都能够形成DNA鸟嘌呤四链结构。同时指出其形成的双分子四链结构与93del形成的鸟嘌呤四链结构相似。进一步,我们将测定结果与报道的IC50或EC50值进行对比,初步归纳了DNA鸟嘌呤四链结构与抗区滋病毒整合酶的活性之间的关系。2.运用电喷雾质谱对互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构进行研究。在一定浓度的醋酸铵溶液中,对16条DNA序列进行研究。将测定结果与93del序列形成的互锁结构的结果进行比较。结果表明,如果在序列5’端具有由四个连续鸟嘌呤组成的结构单元,则其具有形成互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构的能力；而当此序列单元位于序列中间时,则没有此种趋势。同时,短的胸腺嘧啶环(一个或两个胸腺嘧啶单元),不影响互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构的形成。本研究为从DNA序列出发预计可能形成的双分子互锁的DNA空间结构提供了有价值的信息。

全文目录


摘要  4-5
ABSTRACT  5-10
第一章 前言  10-26
  1.1 前言  10
  1.2 DNA的结构  10-21
    1.2.1 DNA的一级结构  10-12
    1.2.2 DNA的高级结构  12-21
      1.2.2.1 双螺旋结构  12-14
      1.2.2.2 鸟嘌呤DNA四链(G-Quadruplex)结构  14-21
  1.3 电喷雾质谱(ESI-MS)技术  21-24
    1.3.1 质谱技术简介  21-23
    1.3.2 电喷雾质谱技术  23-24
  1.4 其他研究DNA结构的技术与方法  24-25
  1.5 本论文的研究思路  25-26
第二章 具有抗艾滋病病毒整合酶活性的鸟嘌呤四链DNA结构性质的ESI-MS研究  26-51
  2.1 引言  26-28
  2.2 实验部分  28-29
    2.2.1 样品准备  28
    2.2.2 实验仪器  28-29
  2.3 结果与讨论  29-50
    2.3.1 质谱分析仪器条件的优化  29-31
    2.3.2 溶液条件的选择  31-32
    2.3.3 与T30923相关序列测定结果  32-43
      2.3.3.1 质谱测定结果  32-40
      2.3.3.2 圆二色谱测定结果  40-43
    2.3.4 与T30175相关序列的测定结果  43-50
      2.3.4.1 质谱测定结果  43-47
      2.3.4.2 圆二色谱测定结果  47-50
  2.4 结论  50-51
第三章 电喷雾质谱法研究互锁式双分子四链DNA的结构  51-67
  3.1 引言  51-53
  3.2 实验部分  53-54
    3.2.1 样品准备  53
    3.2.2 实验仪器与方法  53-54
  3.3 结果与讨论  54-66
    3.3.1 鸟嘌呤数目与位置对互锁式双分子鸟嘌呤四链结构的影响  55-64
    3.3.2 胸腺嘧啶的位置对互锁式双分子鸟嘌呤四链结构的影响  64-66
  3.4 结论  66-67
参考文献  67-84
攻读硕士期间发表的学术论文及取得的科研成果  84-85
  发表文章  84
  参与科研项目  84-85
致谢  85

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中图分类: > 数理科学和化学 > 化学 > 有机化学 > 天然化合物 > α-氨基酸、肽类、蛋白质、核酸
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