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口蹄疫病毒AF/72株结构蛋白VP1的H-2d限制性T细胞表位筛选与鉴定
作 者: 刘新生
导 师: 王永录
学 校: 中国农业科学院
专 业: 预防兽医学
关键词: FMDV 结构蛋白VP1 T细胞表位 H2-d限制性 表位预测
分类号: S852.65
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
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表位肽疫苗作为一种新型疫苗,已成为口蹄疫(Foot-and-Mouth Disease,FMD)疫苗研究的热点之一。由于细胞免疫在口蹄疫病毒(Foot-and-Mouth Disease Virus,FMDV)的免疫应答中发挥着重要作用,而结构蛋白VP1内又包含着FMDV的主要抗原位点。因此,筛选和鉴定VP1蛋白有效的H-2Ld限制性T细胞抗原表位,不仅可为进一步研究针对FMDV自然宿主的T细胞抗原表位提供方法和依据,也可为进一步研制FMDV表位肽疫苗奠定基础。本研究通过扩增并测序,获得了完整的FMDV AF/72株VP1序列。采用密码子优化表达方法,在大肠杆菌中高效表达了该VP1蛋白。经过SDS-PAGE电泳及Western Blotting检测,其分子量与预期大小相符合,并且保持了良好的免疫原性。与此同时,利用相关生物信息学软件对VP1中潜在的H-2Dd、H-2Kd、H-2Ld限制性T细胞表位进行了预测分析,初步筛选并合成了30个10肽片段作为候选表位肽段。将VP1蛋白免疫BALB/c小鼠,制备经VP1蛋白致敏的脾淋巴细胞,与30个候选表位肽段分别进行体外共培养刺激,经淋巴细胞增殖实验和γ干扰素ELISPOT实验,鉴定出2个H-2d限制性T细胞表位,即H-2Kd限制性T细胞表位pK1(AYHKGPFTRL)和H-2Dd限制性T细胞表位pD7(TGESADPVTT)。本研究筛选并鉴定了FMDV AF/72株结构蛋白VP1中的H-2d限制性T细胞表位,为FMDV T细胞表位的研究提供方法和依据,为进一步研制FMDV表位肽疫苗奠定了基础。此外,通过鉴定小鼠这一FMDV研究中常用动物模型的CTL T细胞表位,也有利于了解细胞毒性淋巴细胞在抗FMDV方面的作用。
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全文目录
摘要 5-6 Abstract 6-12 第一章 绪论 12-22 1.1 口蹄疫 T 细胞表位研究进展 12-15 1.1.1 口蹄疫病毒结构蛋白 T 细胞表位 13-14 1.1.2 口蹄疫病毒非结构蛋白 T 细胞表位 14-15 1.1.3 FMDV 表位疫苗概述 15 1.2 细胞免疫检测方法 15-21 1.2.1 体内功能检测 16 1.2.2 体外表型检测 16-18 1.2.3 体外功能检测 18-21 1.3 研究的目的和意义 21-22 第二章 FMDV AF/72 株结构蛋白VP1 的扩增测序及T 细胞表位预测 22-30 2.1 材料 22-23 2.1.1 毒株 22 2.1.2 主要试剂 22-23 2.1.3 引物设计 23 2.2 方法 23-25 2.2.1 病毒 RNA 提取 23 2.2.2 反转录 23 2.2.3 VP1 基因扩增 23-24 2.2.4 目的片段的回收与纯化 24 2.2.5 测序 24 2.2.6 VP1 的结构分析及 T 细胞表位的预测 24-25 2.3 结果 25-28 2.3.1 VP1 基因的扩增 25 2.3.2 VP1 基因序列测定及分析 25 2.3.3 VP1 基因结构分析 25-27 2.3.4 VP1 蛋白 T 细胞表位预测 27-28 2.4 讨论 28-30 第三章 FMDV AF/72 株结构蛋白 VP1 的合成、密码子优化表达及小鼠致敏淋巴细胞的制备 30-40 3.1 材料 30-31 3.1.1 实验动物 30 3.1.2 菌种及质粒 30-31 3.1.3 主要试剂及器皿 31 3.2 方法 31-33 3.2.1 VP1 基因的密码子优化及合成 31 3.2.2 原核表达载体的构建 31 3.2.3 重组基因的诱导表达 31-32 3.2.4 表达蛋白的纯化 32 3.2.5 表达蛋白的SDS-PAGE 分析 32 3.2.6 表达蛋白的Western blot 分析 32-33 3.2.7 小鼠免疫 33 3.2.8 致敏淋巴细胞的分离 33 3.3 结果 33-38 3.3.1 VP1 的优化及合成 33-34 3.3.2 表达载体的构建与鉴定 34 3.3.3 VP1 基因的表达 34-36 3.3.4 VP1 表达蛋白的 Western blot 鉴定 36 3.3.5 小鼠淋巴细胞的收集、培养及活力测定 36-38 3.4 讨论 38-40 第四章 FMDV AF/72 株结构蛋白VP1 H-2D 限制性T 细胞表位的鉴定 40-45 4.1 材料 40 4.2 方法 40-41 4.2.1 T 细胞增殖试验 40-41 4.2.2 INF-γ ELISPOT 试验 41 4.3 结果 41-43 4.3.1 淋巴细胞体外增殖实验鉴定 CD8+T 细胞表位 41 4.3.2 INF-γ ELISPOT 实验确认增殖实验的结果 41-43 4.4 讨论 43-45 第五章 全文结论 45-46 参考文献 46-53 致谢 53-54 作者简历 54
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学
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