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蓝藻信号转导系统的比较基因组学分析及重要基因功能的验证

作　者: 张晓雯
导　师: 秦松
学　校: 中国科学院研究生院（海洋研究所）
专　业: 海洋生物学
关键词: 蓝藻 信号转导 丝氨酸/苏氨酸激酶 二元信号转导系统 比较基因组学
分类号: Q943
类　型: 博士论文
年　份: 2008年
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内容摘要


蓝藻经过漫长的进化,在地球上具有极其广范的分布,而且对环境胁迫具有极强的耐受性,这其中信号转导系统起了至关重要的作用。蓝藻信号转导系统主要包括二元信号转导系统和丝氨酸/苏氨酸激酶。蓝藻全基因组测序工作的完成为蓝藻信号转导系统的研究奠定了基础。目前国外对蓝藻信号转导系统的研究主要集中在对单个蓝藻的单个信号系统的功能研究。本论文首先采用比较基因组学的方法对蓝藻中的两大信号转导系统从分布、结构及进化等角度进行了系统的分析,进而对其中重要信号转导基因的功能进行了验证。通过比较基因组学分析发现蓝藻中的信号转导系统的分布、结构特征与物种的生理、生态特征之间关系密切;蓝藻中丝氨酸/苏氨酸激酶具有与真核型激酶类似的催化方式;在信号转导系统的进化过程中存在着基因复制、缺失、附属功能域的获得及随机重排等复杂的进化现象;且二元信号转导系统中相互作用的组氨酸激酶与反应调控蛋白之间并不是完全同步的进化关系,可能有着不同的进化历程。该研究建立了蓝藻信号转导系统中的基因-结构-功能的框架结构,为其功能的研究奠定了基础。聚球藻PCC7942和集胞藻PCC6803是单细胞的淡水蓝藻,具有天然的外源DNA转化系统,是蓝藻分子遗传学研究的模式生物。通过基因突变的方法对这两株蓝藻中二元信号转导系统的部分重要反应调控蛋白同源基因rre28和syn79420095的功能进行了验证,发现高度保守的同源序列在这两株蓝藻中起着不同的作用,且一个组氨酸激酶可能与不同的反应调控蛋白相互作用,说明同源序列的功能在进化的过程中已经发生了分化。目前对蓝藻信号转导系统中丝氨酸/苏氨酸激酶的功能研究较少。通过基因突变及表达差异分析发现集胞藻PCC6803中的丝氨酸/苏氨酸激酶SpkG参与高盐胁迫的信号传递。通过高盐胁迫条件下SpkG对整个转录图谱影响的研究,发现了60个差异表达基因,涉及转运、能量传递、蛋白加工修饰和信号转导等多个生理过程。该研究首次通过实验验证了蓝藻中的丝氨酸/苏氨酸激酶对环境胁迫的响应,并首次发现由二元信号转导系统和丝氨酸/苏氨酸激酶共同参与的对逆境胁迫的调控网络。蓝藻兼具细菌和植物的特点,蓝藻成熟的转化体系也为真核生物基因功能的研究提供了新的模式宿主。蓝藻信号转导系统中激酶功能的研究为我们进一步研究真核生物激酶的功能提供借鉴,且对蓝藻信号转导的研究将对植物的抗逆胁迫研究提供重要的理论依据。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-10
第一章 前言  10-40
  第一节 蓝藻基因组学研究  10-21
    1 蓝藻结构基因组学研究  11-16
    2 蓝藻比较基因组学研究  16-19
    3 蓝藻功能基因组学研究  19-21
  第二节 蓝藻中的信号转导系统  21-33
    1 二元信号转导系统  22-27
    2 真核型丝氨酸/苏氨酸激酶  27-28
    3 蓝藻中的信号转导系统  28-33
  第三节 蓝藻的遗传操作  33-38
    1 蓝藻载体系统  34-35
    2 蓝藻基因转移系统  35-38
  第四节 本论文研究内容及意义  38-40
第二章 蓝藻丝氨酸/苏氨酸激酶的比较基因组学研究  40-62
  1 材料与方法  40-42
  2 结果与分析  42-58
  3 讨论  58-61
  4 本章小结  61-62
第三章 集胞藻PCC6803 丝氨酸/苏氨酸激酶功能的研究  62-97
  第一节 集胞藻PCC6803 丝氨酸  62-79
    1 材料与方法  62-71
    2 结果与分析  71-78
    3 讨论  78-79
  第二节 集胞藻PCC6803 中五个丝氨酸  79-84
    1 材料与方法  79-82
    2 结果与分析  82-83
    3 讨论  83-84
  第三节 集胞藻PCC6803 中丝氨酸/苏氨酸激酶SpkG在高盐胁迫条件下对其转录图谱的影响  84-97
    1 材料与方法  84-89
    2 结果与分析  89-94
    3 讨论  94-95
    4 本章小结  95-97
第四章 六株聚球藻中二元信号转导系统的比较分析  97-114
  1 材料与方法  97-98
  2 结果与分析  98-111
  3 讨论  111-113
  4 本章小结  113-114
第五章 集胞藻PCC6803 和聚球藻PCC7942 中反应调控蛋白功能的验证  114-140
  第一节 集胞藻PCC6803 反应调控蛋白Rre28 的功能研究  114-125
    1 材料与方法  114-119
    2 结果与分析  119-124
    3 讨论  124-125
  第二节 聚球藻PCC7942 中反应调控蛋白的功能研究  125-140
    1 材料与方法  125-131
    2 结果与分析  131-138
    3 讨论  138-139
    4 本章小结  139-140
结论  140-141
参考文献  141-158
发表及完成文章  158-159
致谢  159

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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学
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