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小分子CCR4拮抗剂的设计、合成与筛选

作 者: 孙薇
导 师: 杨晓虹
学 校: 吉林大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 趋化因子受体 CCR4 拮抗剂 同源模建 Me Too策略 合成 绝对构型 构效关系
分类号: R96
类 型: 博士论文
年 份: 2009年
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内容摘要


CCR4(chemokine receptor 4)属于CC类趋化因子受体(CCR)家族成员之一,在自身免疫性疾病、过敏性炎症、血栓性疾病等过程中发挥重要作用。研究选择性的活性小分子化合物不仅有利于研究CCR4的生物功能,而且还可为以CCR4作为潜在的药物靶标发展新型药物进行有益的探索,尤其是在抗哮喘药物方面,具有广阔的研究、开发与应用前景。本课题基于同源模建方法构建了CCR4的三维结构,分析其结构特征及与配体的相互作用特点,采用Me Too的策略,利用计算机药物辅助设计的手段,设计并合成了30个全新结构化合物,建立了化合物绝对构型的确证方法。在活性筛选中,通过毛细管电泳结果表明有9个化合物与CCR4受体N端有较强的结合作用;其中有6个化合物有较强的抑制MDC介导CCR4转染的HEK293细胞的趋化运动。化合物N8的趋化抑制作用与阳性对照化合物的趋化抑制作用相当,具有进一步的研究价值。在所合成的酯类化合物中,化合物N29表现出良好的抑制MDC介导CCR4转染的HEK293细胞的趋化运动作用,说明酯类化合物有进一步研究与开发的价值。MTT法实验结果表明,优选化合物的细胞毒性低于阳性对照化合物或与之相当。根据得到的活性数据对已合成的化合物进行了构效关系的分析,为下一步的工作提供了理论依据。

全文目录


提要  4-8
第1章 前言  8-22
  1.1 趋化因子受体4(CCR4)及其天然配体  9
  1.2 CCR4 与疾病  9-15
    1.2.1 CCR4 与自身免疫性疾病  10-12
    1.2.2 CCR4 与血栓性疾病  12
    1.2.3 CCR4 与过敏性炎症  12-15
  1.3 小分子CCR4 拮抗剂的研究进展  15-22
    1.3.1 噻唑烷酮类化合物  15-16
    1.3.2 内酰胺类化合物  16-17
    1.3.3 2-氨基噻唑类化合物  17-18
    1.3.4 芳基磺酰胺类化合物  18-19
    1.3.5 二氨基嘧啶类化合物  19-20
    1.3.6 2,4-二氨基喹唑啉类化合物  20
    1.3.7 环胺类化合物  20-22
第2章 靶蛋白CCR4 的同源模建及化合物设计  22-32
  2.1 靶蛋白CCR4 的同源模建  22-27
    2.1.1 人类CCR4 受体功能域氨基酸序列  22-23
    2.1.2 靶蛋白CCR4 的同源模建  23-24
    2.1.3 模建蛋白的结构优化  24
    2.1.4 模建蛋白的三维结构评估及活性位点分析  24
    2.1.5 结果和讨论  24-27
  2.2 小分子化合物与靶蛋白分子对接及结合位点的分析  27-29
    2.2.1 对接参数的设定  28
    2.2.2 结果与讨论  28-29
  2.3 小分子化合物的设计  29-32
第3章 目标化合物的合成  32-68
  3.1 合成路线  32-41
    3.1.1 酰胺类化合物的合成  32-36
    3.1.2 酯类化合物的合成  36
    3.1.3 小结  36-41
  3.2 目标化合物的结构确证  41-48
    3.2.1 实验方法  42
    3.2.2 结果与讨论  42-48
    3.2.3 小结  48
  3.3 合成实验部分  48-68
    3.3.1 中间体的合成  49-56
    3.3.2 目标化合物的合成  56-68
第4章 目标化合物的生物活性评价  68-75
  4.1 毛细管电泳法对化合物与受体N 端结合能力的评价  68-70
    4.1.1 实验原理和方法  68-69
    4.1.2 实验结果  69-70
  4.2 小分子化合物对 MDC 介导 CCR4 转染 HEK293 细胞趋化运动的抑制作用  70-73
    4.2.1 实验原理和方法  70-72
    4.2.2 实验结果  72-73
  4.3 优选化合物的细胞毒性实验  73-75
    4.3.1 实验方法  73
    4.3.2 实验结果  73-75
第5章 目标化合物的构效关系研究  75-81
  5.1 第一组构效关系研究  75-76
  5.2 第二组构效关系研究  76-77
  5.3 第三组构效关系研究  77-78
  5.4 第四组构效关系研究  78-81
结论  81-83
参考文献  83-92
附图  92-124
致谢  124-126
博士学位学习期间发表的文章和申请的专利  126-127
摘要  127-129
Abstract  129-130

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中图分类: > 医药、卫生 > 药学 > 药理学
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