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小分子CCR4拮抗剂的设计、合成与筛选
作 者: 孙薇
导 师: 杨晓虹
学 校: 吉林大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 趋化因子受体 CCR4 拮抗剂 同源模建 Me Too策略 合成 绝对构型 构效关系
分类号: R96
类 型: 博士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
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CCR4(chemokine receptor 4)属于CC类趋化因子受体(CCR)家族成员之一,在自身免疫性疾病、过敏性炎症、血栓性疾病等过程中发挥重要作用。研究选择性的活性小分子化合物不仅有利于研究CCR4的生物功能,而且还可为以CCR4作为潜在的药物靶标发展新型药物进行有益的探索,尤其是在抗哮喘药物方面,具有广阔的研究、开发与应用前景。本课题基于同源模建方法构建了CCR4的三维结构,分析其结构特征及与配体的相互作用特点,采用Me Too的策略,利用计算机药物辅助设计的手段,设计并合成了30个全新结构化合物,建立了化合物绝对构型的确证方法。在活性筛选中,通过毛细管电泳结果表明有9个化合物与CCR4受体N端有较强的结合作用;其中有6个化合物有较强的抑制MDC介导CCR4转染的HEK293细胞的趋化运动。化合物N8的趋化抑制作用与阳性对照化合物的趋化抑制作用相当,具有进一步的研究价值。在所合成的酯类化合物中,化合物N29表现出良好的抑制MDC介导CCR4转染的HEK293细胞的趋化运动作用,说明酯类化合物有进一步研究与开发的价值。MTT法实验结果表明,优选化合物的细胞毒性低于阳性对照化合物或与之相当。根据得到的活性数据对已合成的化合物进行了构效关系的分析,为下一步的工作提供了理论依据。
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全文目录
提要 4-8 第1章 前言 8-22 1.1 趋化因子受体4(CCR4)及其天然配体 9 1.2 CCR4 与疾病 9-15 1.2.1 CCR4 与自身免疫性疾病 10-12 1.2.2 CCR4 与血栓性疾病 12 1.2.3 CCR4 与过敏性炎症 12-15 1.3 小分子CCR4 拮抗剂的研究进展 15-22 1.3.1 噻唑烷酮类化合物 15-16 1.3.2 内酰胺类化合物 16-17 1.3.3 2-氨基噻唑类化合物 17-18 1.3.4 芳基磺酰胺类化合物 18-19 1.3.5 二氨基嘧啶类化合物 19-20 1.3.6 2,4-二氨基喹唑啉类化合物 20 1.3.7 环胺类化合物 20-22 第2章 靶蛋白CCR4 的同源模建及化合物设计 22-32 2.1 靶蛋白CCR4 的同源模建 22-27 2.1.1 人类CCR4 受体功能域氨基酸序列 22-23 2.1.2 靶蛋白CCR4 的同源模建 23-24 2.1.3 模建蛋白的结构优化 24 2.1.4 模建蛋白的三维结构评估及活性位点分析 24 2.1.5 结果和讨论 24-27 2.2 小分子化合物与靶蛋白分子对接及结合位点的分析 27-29 2.2.1 对接参数的设定 28 2.2.2 结果与讨论 28-29 2.3 小分子化合物的设计 29-32 第3章 目标化合物的合成 32-68 3.1 合成路线 32-41 3.1.1 酰胺类化合物的合成 32-36 3.1.2 酯类化合物的合成 36 3.1.3 小结 36-41 3.2 目标化合物的结构确证 41-48 3.2.1 实验方法 42 3.2.2 结果与讨论 42-48 3.2.3 小结 48 3.3 合成实验部分 48-68 3.3.1 中间体的合成 49-56 3.3.2 目标化合物的合成 56-68 第4章 目标化合物的生物活性评价 68-75 4.1 毛细管电泳法对化合物与受体N 端结合能力的评价 68-70 4.1.1 实验原理和方法 68-69 4.1.2 实验结果 69-70 4.2 小分子化合物对 MDC 介导 CCR4 转染 HEK293 细胞趋化运动的抑制作用 70-73 4.2.1 实验原理和方法 70-72 4.2.2 实验结果 72-73 4.3 优选化合物的细胞毒性实验 73-75 4.3.1 实验方法 73 4.3.2 实验结果 73-75 第5章 目标化合物的构效关系研究 75-81 5.1 第一组构效关系研究 75-76 5.2 第二组构效关系研究 76-77 5.3 第三组构效关系研究 77-78 5.4 第四组构效关系研究 78-81 结论 81-83 参考文献 83-92 附图 92-124 致谢 124-126 博士学位学习期间发表的文章和申请的专利 126-127 摘要 127-129 Abstract 129-130
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中图分类: > 医药、卫生 > 药学 > 药理学
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