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Pin1基因多态性与喉鳞状细胞癌的相关性研究

作　者: 唐慧玲
导　师: 阮宏莹
学　校: 天津医科大学
专　业: 耳鼻咽喉科学
关键词: 喉肿瘤 单核苷酸多态性 肽基脯氨酰顺反异构酶 外周血
分类号: R739.65
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


目的检测]Pinl (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase 1)启动子区域和内含子区域的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点rs2233678、rs2233679和rs2287838在喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma, LSCC)患者及其对照组人群外周血中的基因型频率和等位基因型频率。比较上述多态性位点基因型频率和等位基因型频率在两组中的差异,分析其分布频率与不同临床参数(如颈部淋巴结转移及临床分期)的关系。旨在寻求具有重要临床意义的诊断指标和治疗靶点,明确它们和LSCC发生发展的关系,为LSCC早期的基因型诊断以及靶向治疗提供科学依据。方法采用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法检测LSCC患者以及非癌症对照组人群外周血中Pin1基因相关的SNP位点,即rs2233678、rs2233679和rs2287838(其中rs2233678和rs2233679两个位点位于Pin1基因的启动子区域,rs2287838位点位于Pin1基因的内含子区域)的单核苷酸多态性在两组中的差异；并比较突变位点的基因型频率以及等位基因型频率与患者颈部淋巴结转移、临床分期间的关系。应用SPSS16.0统计学软件对实验数据进行分析。应用拟合优度χ2检验对对照组基因型频率分布行Hardy-Weinberg平衡分析；病例组与对照组基因型和等位基因型频率分布比较用χ2检验,以比值比(odds ratio, OR)及其95%可信区间(confidence interval, CI)来表示基因型之间的相对风险度。P<0.05作为差异有统计学意义的标准。结果1.对照组人群三个位点分别经过Hardy-Weinberg遗传平衡检验,P>0.05,符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,具有群体代表性。2.rs2233678多态性位点的基因型频率分布在病例组和对照组中差别有明显统计学意义(P=0.004)。对其临床参数分组分别进行统计学分析发现其基因型频率分布在淋巴结转移、TNM临床分期分组中差别无统计学意义。进一步对其基因型进行相对风险度分析,GG基因型发生喉鳞癌的危险性是GC+CC基因型的3.821倍(P=0.001, OR=3.821,95%CI=1.632-8.948); G等位基因突变的喉鳞癌发病风险性是C等位基因型的3.858倍(P=0.001, OR=3.858, 95%CI=1.716-8.673).3.rs2233679多态性位点的基因型频率分布在病例组和对照组中差别无明显统计学意义(P=0.207)。4.rs2287838多态性位点的基因型频率分布在病例组和对照组中差别有明显统计学意义(P=0.000)。对其临床参数分组分别进行统计学分析rs2287838多态性位点的基因型频率分布在淋巴结转移、TNM临床分期分组中差别无统计学意义。进一步对其基因型进行相对风险度分析,以rs2287838 TT基因型为参照,CT基因型发生喉鳞癌的危险性是TT基因型的0.141倍(P=0.000, OR=0.141, 95%CI=0.060-0.330); CC基因型是TT基因型发生喉鳞癌风险性的0.323倍(P=0.012, OR=0.323,95%CI=0.131-0.796)。T等位基因突变的喉鳞癌易感性是C等位基因突变的1.470倍(p=0.059, OR=1.470,95%CI=0.985-2.193),但是差别处于临界值,未达到统计学意义。结论1.rs2233678多态性位点与喉鳞状细胞癌易感性有关。但是rs2233678位点基因型突变不参与喉鳞癌的淋巴结转移以及恶性进展。G等位基因突变与喉癌的发病有关,促进喉鳞癌的发生。2.rs2233679多态性位点与喉鳞状细胞癌易感性无相关性。3.rs2287838多态性位点与喉鳞状细胞癌易感性有关。TT基因型与喉鳞癌的易感性有关,促进喉鳞癌的发生。但是rs2287838位点基因型突变不参与喉鳞癌的淋巴结转移以及恶性进展。

全文目录


中文摘要  4-6
Abstract  6-10
缩略语/符号说明  10-11
前言  11-13
  研究现状、成果  11-12
  研究目的、方法  12-13
1 对象和方法  13-18
  1.1 一般临床资料  13
  1.2 主要仪器  13
  1.3 主要试剂及配制方法  13-14
    1.3.1 PBS缓冲液的配制  14
    1.3.2 EDTA缓冲液的配制  14
    1.3.3 TBE电泳缓冲液的配制  14
  1.4 实验步骤  14-18
    1.4.1 SNP引物设计  14-15
    1.4.2 限制性内切酶的选择  15
    1.4.3 血液基因组DNA提取  15-16
    1.4.4 PCR扩增  16
    1.4.5 酶切分型  16-18
2 结果  18-25
  2.1 血液基因组DNA的提取结果  18-19
  2.2 酶切产物分型结果  19-20
  2.3 统计学处理  20-25
    2.3.1 基因型遗传平衡检验  21-24
    2.3.2 rs2233678位点基因型分析  24
    2.3.3 rs2233679位点基因型分析  24-25
    2.3.4 rs2287838位点基因型分析  25
3 讨论  25-34
结论  34-35
参考文献  35-38
发表论文和参加科研情况说明  38-39
附录  39-40
综述  40-54
  综述参考文献  50-54
致谢  54

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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 耳鼻咽喉肿瘤 > 喉肿瘤
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