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酶法生产β-丙氨酸的研究
作 者: 洪敏
导 师: 裘娟萍
学 校: 浙江工业大学
专 业: 微生物学
关键词: 工程菌株 发酵 PanD 纯化 细胞固定化 β-丙氨酸
分类号: TQ922.2
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
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本论文采用PCR扩增基因技术,将工程菌株E. coli BL21 (DE3)/ pET28b(+)-panD的panD基因克隆后连接至pET28c(+)载体上,构建重组质粒pET28c(+)-panD,转化表达宿主菌E. coli BL21(DE3),经卡纳霉素抗性筛选获得了高效表达L-天冬氨酸α-脱羧酶的工程菌株E. coli BL21(DE3)/ pET28c(+)-panD,酶活力为92.52 U/L。将新构建的菌株与原菌株E. coli BL21 (DE3)/ pET28b(+)-panD进行SDS-PAGE分析比较,发现新构建的菌株能正确表达PanD,但同样PanD酶自剪切率低,大部分是未剪切的π’-亚基。以乳糖为诱导剂,对新构建的工程菌株E. coli BL21(DE3)/ pET28c(+)-panD进行培养条件的优化,得到最适培养条件:乳糖诱导时间20 h,乳糖浓度12 g/L,诱导温度为35℃,诱导菌龄为3.5 h,诱导培养基初始pH 5.5。优化后酶活力为186 U/L,与未优化前相比,酶活力提高101%。对新构建的工程菌株E. coli BL21(DE3)/ pET28c(+)-panD超声波破壁后的粗酶液经过硫酸铵分级盐析和Ni-亲和层析两步纯化,PanD酶纯度在95%以上,比活力达到了20.15 U/mg,纯化倍数为6.58,回收率为68.34%。通过对纯酶进行酶学性质的研究,得到最适反应温度为45℃,最适pH为8.0,金属离子对酶活力其几乎无影响。PanD较稳定,高温可提高PanD酶的自剪切效率。以海藻酸钠包埋材料对菌株E. coli BL21 (DE3)/pET28b(+)-panD进行细胞固定化,优化后的条件为:以CaCl2为成型剂,海藻酸钠的浓度为3%,菌体包埋量为10%,以天冬氨酸钾为底物转化24 h,底物摩尔转化率达6.48%。固定化颗粒连续转化至第五个批次时才出现明显的溶解现象。
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全文目录
摘要 5-7 ABSTRACT 7-14 第一章 综述 14-29 1.1 β-丙氨酸简介 14 1.2 丙酮酰基依赖型氨基酸脱羧酶 14-19 1.2.1 L‐组氨酸脱羧酶 15-17 1.2.1.1 Prv-HisDCase 结构 16 1.2.1.2 Prv-HisDCase 酶学性质的研究 16-17 1.2.2 精氨酸脱羧酶 17-18 1.2.2.1 Prv-ArgDC 结构 17 1.2.2.2 Prv-ArgDC 酶学性质的研究 17-18 1.2.3 L-天冬氨酸α-脱羧酶 18-19 1.2.3.1 PanD结构 18-19 1.2.3.2 PanD酶学性质的研究 19 1.3 细胞固定化 19-25 1.3.1 固定化材料应具备的条件 20 1.3.2 常见固定化方法 20-24 1.3.2.1 吸附法 20 1.3.2.2 包埋法 20-22 1.3.2.3 共价结合法 22 1.3.2.4 交联法 22 1.3.2.5 复合载体固定化 22-23 1.3.2.6 无载体固定化 23-24 1.3.3 固定化对微生物生理变化的影响 24-25 1.3.3.1 固定化对微生物生长速率的影响 24 1.3.3.2 固定化对微生物活性的影响 24 1.3.3.3 固定化细胞对有毒抑制物质的耐受性 24-25 1.4 选题背景和目的 25-26 参考文献 26-29 第二章 E. coli BL21 (DE3)/pET28c(+)-panD 工程菌株构建 29-47 2.1 前言 29 2.2 材料与方法 29-32 2.2.1 菌种与质粒 29-30 2.2.2 仪器与 DNA 分析软件 30 2.2.3 主要药品与试剂 30-31 2.2.3.1 菌株构建相关药品试剂 30-31 2.2.3.2 试剂 31 2.2.4 培养基 31 2.2.4.1 活化培养基 31 2.2.4.2 液体培养基 31 2.2.5 引物 31-32 2.3 实验方法 32-40 2.3.1 E. coli BL21(DE3)/pET28 c(+)-panD 菌株构建 32-33 2.3.1.1 菌株构建实验流程 32-33 2.3.2 pET28c(+)质粒的克隆 33-34 2.3.2.1 E. coli DH5α感受态细胞的制备 33 2.3.2.2 pET28c(+)质粒转化 33-34 2.3.3 SDS 碱裂解法制备质粒pET28c(+)(中量制备) 34-35 2.3.3.1 SDS 碱裂解法制备质粒DNA 34 2.3.3.2 聚乙二醇沉淀法纯化质粒pET28c(+) 34-35 2.3.4 SDS 碱裂解法制备质粒pET28b-panD(小量制备) 35 2.3.5 琼脂糖凝胶电泳 35 2.3.6 用PCR 技术扩增panD 基因 35-36 2.3.6.1 PCR 扩增体系 35-36 2.3.6.2 PCR 扩增条件 36 2.3.6.3 PCR 扩增产物的纯化 36 2.3.7 PCR 产物和pET28c(+)质粒的双酶切 36-37 2.3.7.1 酶切体系 36-37 2.3.7.2 切胶回收 37 2.3.8 连接与转化 37-38 2.3.8.1 连接体系 37-38 2.3.8.2 E. coli DH5α感受态细胞的制备及转化 38 2.3.9 质粒pET28 c(+)-panD 鉴定 38-39 2.3.9.1 PCR 鉴定 38-39 2.3.9.2 碱基序列测定 39 2.3.10 E. coli BL21(DE3)/ pET28 c(+)-panD 菌株构建及酶活力鉴定 39-40 2.3.10.1 E. coli BL21(DE3)/ pET28 c(+)-panD 菌株构建 39 2.3.10.2 酶活力测定 39-40 2.3.10.3 重组菌株的 SDS-PAGE 检测 40 2.4 实验结果 40-46 2.4.1 重组表达质粒pET28c(+)-panD 构建 40-41 2.4.2 重组质粒pET28 c(+)-panD 鉴定 41-43 2.4.2.1 PCR 鉴定 41-42 2.4.2.2 碱基序列测定 42-43 2.4.3 重组菌株 E. coli BL21(DE3)/ pET28 c(+)-panD 酶活力检测 43-44 2.4.4 重组菌株的SDS-PAGE 检测 44-46 2.5 实验小结 46 参考文献 46-47 第三章 菌株培养条件的初步研究 47-56 3.1 前言 47 3.2 材料与方法 47-48 3.2.1 菌株 47 3.2.2 主要仪器设备 47-48 3.2.3 主要药品与试剂 48 3.2.4 培养基 48 3.3 试验方法 48-50 3.3.1 菌种斜面活化 48 3.3.2 菌种接种子培养基 48-49 3.3.3 摇瓶发酵条件的优化 49-50 3.3.3.1 诱导时间对重组菌株产酶活力的影响 49 3.3.3.2 不同乳糖浓度对重组菌株产酶活力的影响 49 3.3.3.3 诱导温度对重组菌株产酶活力的影响 49 3.3.3.4 不同菌龄对重组菌株产酶活力的影响 49-50 3.3.3.5 诱导初始pH 值对重组菌株产酶活力的影响 50 3.3.4 酶活定义 50 3.4 结果与讨论 50-55 3.4.1 诱导时间对重组菌株产酶活力的影响 50-51 3.4.2 不同乳糖浓度对重组菌株产酶活力的影响 51-52 3.4.3 诱导温度对重组菌株产酶活力的影响 52-53 3.4.4 不同菌龄对重组菌株产酶活力的影响 53-54 3.4.5 诱导初始pH 值对重组菌株产酶活力的影响 54-55 3.5 实验小结 55 参考文献 55-56 第四章 PanD 的分离纯化及酶学性质研究 56-76 4.1 前言 56 4.2 材料与方法 56-58 4.2.1 菌株 56 4.2.2 主要仪器设备 56-57 4.2.3 主要药品与试剂 57-58 4.2.3.1 主要药品 57 4.2.3.2 试剂 57-58 4.2.4 培养基 58 4.2.4.1 活化培养基 58 4.2.4.2 种子培养基 58 4.2.4.3 发酵培养基 58 4.2.5 PanD 酶活力测定 58 4.3 实验方法 58-63 4.3.1 菌株培养 59 4.3.1.1 菌种斜面活化 59 4.3.1.2 菌种接种子培养基 59 4.3.1.3 摇瓶发酵 59 4.3.2 PanD的纯化 59-61 4.3.2.1 菌悬液的制备 59 4.3.2.2 超声波破碎条件的选择 59-60 4.3.2.3 PanD的硫酸铵盐析 60-61 4.3.2.4 脱盐 61 4.3.2.5 Ni-亲和层析纯化 61 4.3.2.6 脱盐 61 4.3.3 PanD 酶学性质的研究 61-63 4.3.3.1 酶的最适反应温度的选择 61-62 4.3.3.2 酶的最适反应pH的选择 62 4.3.3.3 酶的热稳定性 62 4.3.3.4 酶的pH 耐受性 62 4.3.3.5 金属离子对酶活力的影响 62-63 4.3.4 温度对PanD自剪切的影响 63 4.3.5 SDS-PAGE检测PanD 63 4.4 结果与讨论 63-74 4.4.1 超声波破壁条件的研究 63-65 4.4.2 硫酸铵饱和度的选择 65-66 4.4.3 PanD的分离纯化 66-68 4.4.3.1 硫酸铵分步盐析 66 4.4.3.2 脱盐 66 4.4.3.3 Ni-亲和层析 66-67 4.4.3.4 PanD纯化 67-68 4.4.4 PanD 学性质的研究 68-72 4.4.4.1 酶的最适反应温度的选择 68-69 4.4.4.2 酶的最适反应pH 的选择 69-70 4.4.4.3 酶的热稳定性 70 4.4.4.4 酶的pH 耐受性 70-71 4.4.4.5 金属离子对酶活力的影响 71-72 4.4.5 温度对PanD自剪切的影响 72-74 4.5 实验小结 74-75 参考文献 75-76 第五章 E.coli BL21(DE3)/pET28b(+)-panD细胞固定化条件的研究 76-92 5.1 前言 76 5.2 材料与方法 76-78 5.2.1 菌株 76-77 5.2.2 主要仪器设备 77 5.2.3 主要药品与试剂 77 5.2.4 培养基 77-78 5.2.4.1 活化培养基 77 5.2.4.2 种子培养基 77 5.2.4.3 发酵培养基 77-78 5.3 实验方法 78-82 5.3.1 菌株培养 78 5.3.1.1 菌种斜面活化 78 5.3.1.2 菌种接种子培养基 78 5.3.1.3 摇瓶发酵 78 5.3.1.4 菌体制备 78 5.3.2 固定化细胞性能的评价 78-79 5.3.2.1 固定化颗粒的机械强度考察 78-79 5.3.2.2 固定化颗粒包埋效果的考察 79 5.3.2.3 固定化颗粒粘附程度的考察 79 5.3.2.4 固定化操作难易程度的考察 79 5.3.3 细胞固定化 79-81 5.3.3.1 PVA 包埋法 79-80 5.3.3.2 海藻酸钠包埋法 80-81 5.3.4 固定化细胞转化 81 5.3.4.1 固定化细胞分批转化 81 5.3.4.2 固定化细胞连续转化 81 5.3.5 相关公式计算 81-82 5.4 实验结果 82-89 5.4.1 PVA 不同包埋法比较 82-83 5.4.2 海藻酸钠包埋法 83-88 5.4.2.1 不同成型剂的选择 84-85 5.4.2.2 海藻酸钠浓度的选择 85-86 5.4.2.3 菌体包埋量的选择 86-87 5.4.2.4 不同天冬氨酸盐的选择 87-88 5.4.3 固定化细胞连续转化 88-89 5.5 实验小结 89-90 参考文献 90-92 第六章 总结与展望 92-94 致谢 94-95 附录 1. 高效液相色谱检测β-丙氨酸 95-97 附录2:考马斯亮蓝G-250法测定蛋白质含量 97-99 附录 3 SDS-PAGE 99-102 攻读学位期间发表的学术论文目录 102
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中图分类: > 工业技术 > 化学工业 > 其他化学工业 > 发酵工业 > 发酵法制氨基酸 > 丙氨酸
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