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新疆维吾尔族长寿老人肠道菌多样性分析

作 者: 于涛
导 师: 德里夏提·依米提
学 校: 新疆医科大学
专 业: 病原生物学
关键词: 肠道菌群 维吾尔族 16SrDNA DGGE指纹
分类号: R450
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 36次
引 用: 0次
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内容摘要


目的:新疆和田地区维吾尔族百岁老人数量和人口相对比率都明显高于全国平均水平,国际自然医学会将和田地区列为世界四大长寿地区之一。利用PCR-DGGE基因指纹技术,建立一种新的肠道细菌鉴定方法。分析新疆维吾尔族长寿老人肠道菌群多样性,比较肠道微生物种群的差异,寻找肠内某些与健康有重要关系的有益菌。方法:直接从粪便样本中提取细菌总DNA,依此为模板在16S rDNA的可变序列区间设计一对细菌通用引物,用于引导16S rDNA第6至第8可变区的PCR扩增反应,得到反映肠道菌群结构特征的DNA指纹图谱,采用不依赖分离培养的16S rDNA的PCR-DGGE基因指纹技术,结合条带回收、克隆、序列测定等方法对新疆维吾尔族长寿老人肠道细菌种群多样性进行探讨。结果:根据DGGE指纹图的聚类分析发现新疆维吾尔族长寿老人不同个体样本的细菌组成差异性非常大,每个体内细菌都有着丰富的多样性,优势菌也不尽相同,有些代表细菌种类的条带是某一个样品所特有的。结论:采用该技术首次研究了新疆和田维吾尔族长寿老人肠道细菌群体的结构特征,并结合相似性分析比较长寿老人个体间细菌群体多样性。首次建立基于16S rDNA的PCR-DGGE基因指纹图谱分析新疆维吾尔族老人肠道细菌组成,对于今后探讨肠道菌群谱的结构组成具有重要意义。

全文目录


摘要  6-7
ABSTRACT  7-8
前言  8-11
材料和方法  11-19
  1. 实验材料  11-15
  2. 实验方法  15-19
    2.1 实验样本采集研究对象  15
    2.2 肠道菌群基因组总 DNA 的提取  15-16
    2.3 基因组DNA 的PCR 的扩增  16
    2.4 修复PCR扩增  16
    2.5 DGGE 电泳步骤  16-17
    2.6 DGGE 胶的染色  17-18
    2.7 条带的回收测序  18-19
结果  19-23
讨论  23-27
小结  27-28
致谢  28-29
参考文献  29-33
附录  33-70
综述  70-77
硕士研究生在读期间发表文章  77-78
导师评阅表  78

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中图分类: > 医药、卫生 > 临床医学 > 治疗学
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