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主基因—多基因性状与微效多基因性状的综合选择指数研究

作　者: 陈小蕾
导　师: 郭满才；袁志发
学　校: 西北农林科技大学
专　业: 应用数学
关键词: 数量性状主基因-多基因混合 EM算法参数估计 AIC准则综合选择指数
分类号: Q75
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 33次
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内容摘要

经典数量遗传学中,综合选择指数是以微效多基因遗传体系来分析的。现代数量遗传学已将微效多基因遗传体系发展为主基因-多基因遗传体系。因而对主基因-多基因性状与微效多基因性状混合综合选择指数进行研究探讨,是势在必行的,以便对动-植物育种的选择有更好的指导和参考作用。微效多基因的数量性状的表型服从正态分布,但是主基因-多基因性状却表现为偏态或多峰。所以需要先对主基因-多基因性状进行混合正态分布的分离分析。本研究采用混合正态分布的EM算法,借助于不分离世代的实验结果,分别估计各性状的表型方差、主基因遗传方差、多基因遗传方差和环境方差等参数,并在经典综合选择指数理论的基础上进一步给出主基因-多基因性状与微效多基因性状的综合选择指数模型,并给主基因的QTL定位提供信息。其具体方法如下:第一,利用不分离世代的数据估计环境方差;第二,利用各个性状所确定的频数分布来确定所研究性状属于主基因-多基因性状或者是微效多基因性状。如果是微效多基因性状则按经典数量遗传体系的方法估计有关参数;如果性状为主基因-多基因性状,则利用混合正态分布的分离分析的方法,估计各个成分分布的数字特征及有关的遗传方差;第三,在以上两点的基础上,建立主基因-多基因性状与微效多基因性状综合选择指数的数学模型,同时判断主基因对遗传方差的贡献。如果主基因所占比例很大,则需对主基因的QTL定位,通过控制主基因座达到控制表型性状提高选择效率的目的。此外,本研究以一个主基因-多基因性状与一个微效多基因性状混合为例来进行研究,这种方法可以推广多个主基因-多基因性状与多个微效多基因性状混合的情形。

全文目录

摘要  5-6
ABSTRACT  6-10
第一章文献综述  10-23
  1.1 数量遗传学的发展  10-13
    1.1.1 质量性状和数量性状  10
    1.1.2 数量性状的多基因学说  10-11
    1.1.3 遗传学的发展  11-12
    1.1.4 数量性状遗传数学模型的发展  12-13
  1.2 选择指数的发展概况  13-16
    1.2.1 选择指数的基本概念  13-15
    1.2.2 选择指数的研究进展  15-16
    1.2.3 选择指数(Selection index)与综合选择(Combined selection)  16
  1.3 综合选择指数理论  16-23
    1.3.1 综合选择指数的数学模型  16-18
    1.3.2 影响综合选择指数的因素  18-20
    1.3.3 综合选择指数在育种应用及存在问题  20-23
第二章混合正态分布分析的一般理论  23-30
  2.1 混合分布的基本概念  23
  2.2 混合正态分布参数的极大似然估计  23-25
  2.3 混合正态分布参数似然估计的 EM 算法  25-27
  2.4 AIC 准则  27-28
  2.5 似然统计量的检验(Likelihood-ratio test)  28
  2.6 本文研究思路  28-30
第三章主基因-多基因性状与微效多基因性状综合选择指数的构建  30-35
  3.1 经典综合选择指数理论  30-31
  3.2 F2 代主基因-多基因遗传体系的混合正态分布模型  31-33
    3.2.1 主基因为主部显化的混合正态分布  31-32
    3.2.2 主基因为加性(无显性)的混合正态分布  32
    3.2.3 正向完全显性的混合正态分布  32-33
    3.2.4 负向完全显性的混合正态分布  33
  3.3 主基因-多基因性状与微效多基因性状综合选择指数的构建  33-35
第四章实例分析  35-39
  4.1 样本协方差阵的估计  35
  4.2 x1 和x2 遗传体系的分离分析  35-37
  4.3 主基因-多基因性状与微效多基因性状综合选择指数的建立与分析  37-39
第五章结论与讨论  39-41
参考文献  41-45
致谢  45-46
作者简介  46

主基因—多基因性状与微效多基因性状的综合选择指数研究

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