学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

甘薯抗茎线虫病亲本的聚类分析

作　者: 黄文静
导　师: 王钰
学　校: 安徽大学
专　业: 细胞生物学
关键词: 甘薯 SRAP SSR RGA 聚类分析
分类号: S531
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 34次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

甘薯(Iponoea batatas(Lam))是一种重要的粮食、饲料、工业原料及新型能源用块根作物,广泛种植于全球100多个国家,在世界粮食生产中总产列第七位[1]。我国是世界上最大的甘薯生产国。自1937年以来,甘薯茎线虫病从日本传入我国,我国的甘薯产量受到茎线虫的严重危害,一般的发病田块减产20%-50%,重病田块甚至绝产无收。目前解决甘薯茎线虫病的根本方式是将常规育种和分子育种相结合。传统育种在甘薯抗病育种中受到一定的限制：甘薯遗传背景十分复杂；杂交育种时经常表现为自交不亲和性等多重障碍,导致难以获得F1代种子；培育时间太长等缺点。分子育种作为常规育种的辅助手段,包括抗病基因(候选基因)的克隆、分子标记的筛选等。以DNA多态性为基础的分子标记,是DNA水平上的遗传多态性的直接反映,是一种新的遗传标记,可以辅助甘薯抗病育种,进行甘薯的抗病遗传多样性分析,加快抗病育种的步伐。本研究以高抗甘薯茎线虫病品种徐781和高感茎线虫病品种徐18及实验室保存的50种甘薯材料为亲本材料,通过SRAP、SSR及RGA分子标记方法筛选引物,以期在实验材料中获得甘薯材料间的亲缘关系,为甘薯的亲本选配和后续育种研究奠定了一定的基础。通过实验所得的主要结论如下：一、SRAP-RGA实验结果：1、SRAP-RGA扩增产物的多态性分析结果11对带型清晰、多态性较好的引物组合对50份供试甘薯材料进行扩增,所扩增条带的大小一般在250-2000bp之间,每对引物组合产生9-18条谱带,共产生谱带137条,其中多态性条带为121条,占总带数的88.32%。不同的引物对产生的多态率明显不同。最高是EM4-S2-A07-F引物对的多态率为100%,最低是EM8-S1-F03-F引物对的多态率为63.6%。2、SRAP-RGA扩增产物聚类分析结果应用UPGMA法对50个品种进行聚类分析,结果如下：在相似系数为0.51时,将50个品种划分为3大类群。第一类包括30个品种：南薯88、皖702、川山紫、黄、199029-1、美Ⅰ、徐55-2、559、广菜2号、青农2号等；第二类包括10个品种：水果甘薯、美国红薯、44104、宁紫1号、C-30、徐紫13-4、徐23、浙78、济薯18、徐781等；第三类包括10个品种：金山1225、徐22、44057、59、福薯11号、徐18。3、SRAP-RGA扩增产物遗传多样性分析结果根据多态性条带统计结果,采用NTSYS软件计算出甘薯种质间的相似系数,结果表明,50份材料间的相似系数范围较广,在0.1818-0.9091之间。在所有材料中,豫薯12(31)和皖702(1)、2004-28(11)和浙6025(13)的遗传相似性系数最小,为0.1818,说明他们之间的遗传距离较远,而199029-1(3)和南薯88(5)、559(4)的遗传相似性系数较大,为0.9091,说明他们之间的遗传距离较近。二、SSR实验结果：以徐18和徐781为亲本材料,经SSR反应体系PCR扩增后,用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,总72对引物中筛选出21对多态性引物,分别是第4对、第14对、第24对、第28对、第29对、第30对、第31对、第33对、第35对、第36对、第39对、第40对、第42对、第44对、第45对、第46对、第48对、第49对、第50对、第52对、第60对。

全文目录

摘要  3-5
Abstract  5-9
目录  9-12
第一章绪论  12-28
  1. 甘薯起源及在国民经济中的地位  12
  2. 甘薯茎线虫病病源简介及为害现状  12-14
    2.1 甘薯茎线虫病病源  13
    2.2 甘薯茎线虫病为害现状  13-14
  3 甘薯茎线虫病发病因素分析  14
    3.1 种薯种苗带病  14
    3.2 不合理的耕作制度会使病害加重  14
    3.3 农民的农业科学知识技能较少  14
    3.4 防治药剂及技术缺乏  14
  4 甘薯茎线虫病的防治措施  14-17
    4.1 加强检疫  14-15
    4.2 农业生产上的措施  15-17
      4.2.1 建立无病留种基地  15
      4.2.2 选育无病壮苗  15
      4.2.3 轮作倒茬种植  15
      4.2.4 加强栽培管理,提高甘薯自身的抗病能力  15-16
      4.2.5 土壤处理  16
      4.2.6 选用抗病品种  16-17
  5 甘薯抗病育种  17-18
    5.1 常规育种研究  17-18
    5.2 分子育种  18
  6 分子标记介绍及其在植物育种中的应用  18-24
    6.1 SSR分子标记介绍  18-19
    6.2 SRAP分子标记介绍  19-20
    6.3 分子标记技术在植物育种中的应用  20-22
      6.3.1 遗传图谱的建立  20
      6.3.2 基因定位  20-21
      6.3.3 亲缘关系和遗传多样性的研究  21
      6.3.4 品种间遗传关系分析  21-22
      6.3.5 分子标记辅助育种(MAS)  22
    6.4 分子标记技术在甘薯遗传育种中的应用  22-24
      6.4.1 我国甘薯育种现状  22-23
      6.4.2 甘薯遗传多样性分析  23
      6.4.3 甘薯聚类分析和遗传连锁图谱构建  23-24
        6.4.3.1 聚类分析  23-24
        6.4.3.2 遗传连锁图谱构建  24
  7 抗病基因同源序列(RGA)  24-26
    7.1 植物中抗病基因同源序列的应用  25-26
      7.1.1 定位和克隆R基因  25
      7.1.2 分子标记辅助育种  25
      7.1.3 种质资源多样性研究  25-26
    7.2 甘薯中抗病基因同源序列的应用及研究进展  26
  8 本课题的研究目的和意义  26-28
第二章甘薯抗茎线虫病亲本的SRAP-RGA分析  28-42
  1 材料与方法  28-36
    1.1 植物材料  29-30
    1.2 甘薯总DNA的提取  30-31
    1.3 SRAP-RGA引物设计及合成  31-32
    1.4 SRAP-RGA技术的PCR反应体系及程序  32-33
    1.5 6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测  33-34
    1.6 数据分析  34
    1.7 实验所用试剂、溶液配方及仪器  34-36
      1.7.1 实验用试剂  34-35
      1.7.2 溶液及培养基配方  35-36
      1.7.3 实验仪器  36
  2 结果与分析  36-42
    2.1 甘薯总DNA提取结果  36-37
    2.2 SRAP-RGA扩增产物的多态性分析  37-39
    2.3 聚类分析结果  39
    2.4 SRAP-RGA扩增产物的遗传多样性分析  39-40
    2.5 讨论  40-42
      2.5.1 甘薯种质资源间的抗茎线虫病遗传多样性  40-41
      2.5.2 SRAP和RGA分子标记技术可有效地应用于甘薯抗茎线虫病遗传多样性研究  41-42
第三章甘薯抗茎线虫病SSR体系的优化及引物筛选  42-50
  1 材料与方法  42-46
    1.1 植物材料  42
    1.2 甘薯总DNA提取  42-43
    1.3 SSR-PCR体系优化  43
    1.4 SSR引物设计及合成  43
    1.5 SSR引物筛选  43-44
    1.6 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(银染)检测  44
    1.7 实验所用试剂及仪器  44-46
      1.7.1 实验所用试剂  44-45
      1.7.2 溶液配方  45-46
      1.7.3 实验仪器  46
  2 结果与分析  46-48
  3 讨论  48-50
第四章结论与展望  50-53
  1 结论与讨论  50-51
    1.1 基因组DNA的提取质量对SRAP-RGA和SSR标记实验的影响  50
    1.2 PCR反应对SRAP-RGA和SSR标记实验的影响  50
    1.3 SRAP-RGA标记技术在甘薯种质资源抗病遗传多样性研究中的可行性及聚类分析结果  50-51
    1.4 SSR-PCR标记技术为甘薯的后续育种研究奠定基础  51
  2 展望  51-53
参考文献  53-58
致谢  58-59
攻读硕士学位期间发表的论文  59

甘薯抗茎线虫病亲本的聚类分析

内容摘要

全文目录

相似论文