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我国部分地区岩黄芪、百脉根根瘤菌的多相分类研究

作　者: 刘洋
导　师: 隋新华
学　校: 中国农业大学
专　业: 微生物学
关键词: 岩黄芪百脉根根瘤菌多相分类
分类号: Q939
类　型: 硕士论文
年　份: 2005年
下　载: 83次
引　用: 1次
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内容摘要

本论文综述了根瘤菌分类和系统发育研究进展及有关研究方法;采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP分析、BOX-PCR指纹图谱分析、16S rDNA序列分析、DNA G+C mol%测定和DNA-DNA同源性分析等多相分类技术,对分离自我国5个省岩黄芪9个不同种的30株根瘤菌和分离自安徽、四川百脉根2个不同种的12株根瘤菌进行了系统的多相分类研究。数值分类的结果表明,供试未知菌株在83%的相似性水平上可为6个表观群。群1～4为快生菌群,群1、群2、群4分别与Sinorhizobium、Agrobacterium和Rhizobium参比菌株聚在一起,群3中没有所选参比菌株;群5为慢生菌群,与Bradyrhizobium参比菌株聚在一起;群6为中慢生菌群,其中没有所选参比菌株。 16s rDNA PCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的聚类结果与数值分类的聚类结果总体上比较一致,BOX-PCR指纹图谱分析聚群的总体相似性水平较低,更适合用于种内菌株的遗传多样性研究。对数值分类中群6中心菌株CCBAU 61009进行了16S rDNA全序列分析,结果表明:这群菌株与Mesorhizobium amorphae的系统发育关系最近。DNA G+C mol%和DNA-DNA同源性分析结果表明,群1属于Sinorhizobium fredii,群6属于Mesorhizobium amorphae。数值分类的研究结果表明,我国中西部地区岩黄芪根瘤菌对碳源、氮源的利用范围很广,具有很强的抗逆性。这些表型和遗传型多样性丰富的菌株为我国西部大开发中更好的利用豆科植物提供了种质资源和理论依据。

全文目录

第一章文献综述  9-23
  1.1 引言  9
  1.2 根瘤菌分类的历史  9-11
  1.3 根瘤菌分类的现状  11-15
  1.4 根瘤菌的系统发育地位  15-17
  1.5 用于根瘤菌多相分类研究的方法  17-22
  1.6 小结  22-23
第二章宿主植物岩黄芪、百脉根及其共生根瘤菌  23-32
  2.1 宿主植物岩黄芪、百脉根概述  23-30
  2.2 岩黄芪、百脉根根瘤菌的国内外研究进展  30-31
  2.3 本论文的研究方案和目的意义  31-32
第三章表型性状分析和数值分类  32-45
  3.1 材料与方法  32-37
  3.2 实验结果处理  37-38
  3.3 结果与分析  38-44
  3.4 小结  44-45
第四章 16S rDNA PCR-RFLP分析  45-50
  4.1 材料与方法  45-47
  4.2 结果与分析  47-49
  4.3 16S rDNA PCR-RFLP与数值分类结果比较分析  49-50
第五章 BOX-PCR指纹图谱分析  50-55
  5.1 材料与方法  50-52
  5.2 结果与分析  52-54
  5.3 BOX-PCR与16S rDNA PCR-RFLP、数值分类结果比较分析  54-55
第六章 16S rDNA全序列测定及系统发育学分析  55-57
  6.1 材料与方法  55
  6.2 结果与分析  55-57
第七章 G+C％含量测定和DNA-DNA杂交  57-63
  7.1 材料与方法  57-60
  7.2 结果与分析  60-63
第八章结论  63-64
参考文献  64-74
致谢  74-75
附录  75-83
作者简介  83

我国部分地区岩黄芪、百脉根根瘤菌的多相分类研究

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