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系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达模式

作　者: 江薇
导　师: 李守新
学　校: 华中科技大学
专　业: 风湿免疫
关键词: 红斑狼疮,系统性基因表达系列分析外周血单个核细胞神经颗粒素
分类号: R593.241
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
下　载: 28次
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内容摘要

第一部分系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的生物信息学分析目的分析已构建的系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库,勾画系统红斑狼疮外周血单个核细胞的基因表达模式。方法利用SAGE 2000V 4.5对已建立的SAGE文库产生的测序文件进行统计分析,上传SLE患者20个高表达基因到http://david.niaid.nih.gov/david/ease.htm,得到基因的功能注释,利用卡方检验筛选表达差异的基因。结果文库测序共1814个SAGE标签(tag),由1286序列不同的tag组成。这些tag中,单拷贝tag占86.6%,仅0.2%tag多于20拷贝。与已知表达序列相配的tag占68.4%,其中41.1%的tag能与多个表达序列匹配;31.6%的tag不能和已知表达序列配对,它们可能代表新基因。20个高表达基因与正常人文库比较发现3个差异表达的基因。结论研究勾画出系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达概貌。通过对比分析正常人和SLE患者的SAGE文库的生物学信息,将有助于我们了解系统性红斑狼疮的发病机制。第二部分RT-PCR验证系统性红斑狼疮外周血单个核细胞SAGE文库中神经颗粒素的差异表达目的测定神经颗粒素在系统性红斑狼疮患者和正常人中的表达情况。方法SAGE生物学分析。RT-PCR的方法验证35例系统性红斑狼疮患者和15例正常人神经颗粒素mRNA表达水平,分析神经颗粒素mRNA表达水平与SLE活动性指数(SLEDAI)相关性。结果比较系统性红斑狼疮患者和正常人SAGE文库筛选出差异表达基因神经颗粒素,活动期SLE神经颗粒素mRNA水平高于缓解期(p<0.05)及正常对照组(p<0.001),缓解期高于正常对照组(p<0.05)。系统性红斑狼疮患者Ng mRNA水平与SLEDAI正相关。结论系统性红斑狼疮外周血单个核细胞神经颗粒素高表达,与SAGE文库结果一致,神经颗粒素可能参与了SLE免疫细胞内异常的信号传导途径

全文目录

中文摘要  5-7
英文摘要  7-9
前言  9-12
  参考文献  11-12
第一部分系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的生物信息学分析  12-22
  方法  12-13
  结果  13-17
  讨论  17-19
  参考文献  19-22
第二部分 RT-PCR 验证系统性红斑狼疮外周血单个核细胞 SAGE 文库中神经颗粒素的差异表达  22-32
  资料与方法  22-27
  结果  27-29
  讨论  29-31
  参考文献  31-32
[综述]系统性红斑狼疮基因表达的研究进展  32-39
  参考文献  37-39
致谢  39

系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达模式

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