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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统筛选21-三体综合症羊水标志蛋白
作 者: 郭琳琳
导 师: 朱艳
学 校: 辽宁医学院
专 业: 妇产科学
关键词: 液体蛋白芯片飞行时间质谱 羊水标记物 21-三体综合征 产前诊断
分类号: R714.5
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
下 载: 24次
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内容摘要
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目的应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统(ClinProtTM系统)比较分析孕中期(17-22周)21-三体综合征和正常对照组的羊水蛋白质表达谱,筛选羊水中21-三体综合征的标志蛋白,用于产前快速诊断方法的研究。方法将30例21-三体综合征胎儿羊水(17-22孕周分别收集2例、3例、6例、13例、4例及2例)和180例正常胎儿羊水(17-22孕周分别收集30例)分别按照对应的孕周等体积进行混匀,分别记为21三体组与正常对照组,每组内又分为六个孕周组(17-22W)。12组羊水标本采用真空旋干法分别浓缩10倍,应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统的弱阳离子磁珠(WCX)分离系统对12组羊水样本进行纯化、俘获特异蛋白或多肽,液体蛋白芯片飞行时间质谱仪(Microflex II)检测,FlexAnalysis3.0软件的生物信息学方法研究羊水蛋白表达谱,应用遗传算法对差异蛋白的敏感性和特异性进行初步评价,建立判别模型。结果1.12组羊水样本经3次独立重复实验产生的谱图峰形具有很高的一致性。2.以孕22周为例,于谱图中高、中、低分子量区段内随机挑选质荷比(mass charge ratio, m/z)分别为867,1450,3000,4210,6175和7174 Da的6个蛋白峰用于两组羊水样本的变异性分析,变异系数(CV)均值为0.501,表明液体蛋白芯片飞行时间质谱系统具有良好的稳定性。3.经FlexAnalysis 3.0软件分析,共发现44个差异有统计学意义的蛋白峰(P<0.05)。其中m/z为3763Da和862Da的蛋白为组间最大差异蛋白,能够很好的区分21-三体组和正常对照组。应用遗传算法(GA),系统筛选出一个由m/z分别为3762.68,7988.89,3911.26,3709.99和1450.5Da的5个特征蛋白峰组成的诊断模型。该模型对正常组与21三体组的识别率均为100%结论1.液体蛋白芯片飞行时间质谱系统具有良好的稳定性和敏感性,可以用于21三体综合征胎儿羊水蛋白质表达谱的研究。2.筛选到的m/z为862Da和3763Da的蛋白可能为潜在的能够对21三体综合征做出快速产前诊断的羊水标记物。
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全文目录
摘要 4-6 英文摘要 6-8 英文缩略语表 8-9 前言 9-10 实验材料与方法 10-12 实验结果 12-15 讨论 15-17 结论 17-18 附图 18-22 本研究创新性的自我评价 22-23 参考文献 23-26 综述 26-33 参考文献 31-33 在学期间科研成绩 33-34 致谢 34-35 个人简介 35
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中图分类: > 医药、卫生 > 妇产科学 > 产科学 > 胎儿
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