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黑龙江省部分地区梅花鹿微卫星遗传多样性的研究

作　者: 孙海涛
导　师: 耿忠诚；李馨
学　校: 黑龙江八一农垦大学
专　业: 动物营养与饲料科学
关键词: 梅花鹿微卫星位点遗传多样性遗传标记
分类号: S825
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
下　载: 93次
引　用: 4次
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内容摘要

本研究利用16个微卫星遗传标记对黑龙江省密山市兴凯湖农场养鹿场(X)、五大连池大庆农场(DN)和大庆市大同区(DT)的3个梅花鹿群体的遗传多样性进行了检测。统计了各群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(Ne)。根据等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、期望杂合度(he)、遗传分化系数(Gst)和多态信息含量(PIC)。对兴凯湖梅花鹿种群个体不同的基因型与其产茸量之间进行了相关性分析。计算了多态位点在兴凯湖梅花鹿种群中的个体识别能力。结果表明:1. 16个受测微卫星位点中,除了T501、C143、C217、T107、C273五个单态位点外,其余的11个位点均表现出不同的多态信息含量。其中高度多态位点5个:T156(0.823)、T123(0.736)、BM1225(0.611)、BM1706(0.549)和BM203(0.642);中度多态位点4个:T530(0.472)、T507(0.484)、C180(0.434)、T108(0.375);低度多态位2个:CERVID14(0.24)、T172(0.119)。在11个多态位点上共检测得到57个等位基因,平均等位基因数与有效等位基因数分别为3.7、2.8,说明各位点等位基因分布不均匀,3个鹿群遗传变异比较丰富。2. 11个位点在3个梅花鹿群体中的总平均多态信息含量(PIC)、遗传杂合度(h)、期望杂合度(he)和有效等位基因数(Ne)分别为0.499、0.553、0.569、2.8,数据表明3个梅花鹿群体的遗传多样性比较丰富。其中兴凯湖梅花鹿的遗传杂合度最高(h=0.636),大庆农场与大同地区的鹿群较低分别为0.568、0.454;兴凯湖群体的平均PIC最高(PIC=0.574),与大庆农场(PIC=0.508)同为高度多态,大同地区的平均PIC最低(PIC=0.414)为中度多态。3.微卫星位点BM1225的BC、CE基因型和T 172的AA基因型可作为兴凯湖梅花鹿种群的鲜茸重经济性状分子遗传标记。4.筛选出T156、T530、T123、BM1225、T507、C180六个微位星位点可用于兴凯湖梅花鹿种群个体识别,累计个体识别能力可达99.996976%。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-7
第一章文献综述  7-17
  1.1 中国梅花鹿品种资源简介  7-9
  1.2 兴凯湖梅花鹿简介  9-10
  1.3 微卫星遗传标记简介  10-12
  1.4 微卫星 DNA 的检测  12-13
  1.5 微卫星标记在鹿遗传育种中的研究进展  13-15
  1.6 研究的目的与意义  15-17
第二章材料与方法  17-24
  2.1 试验材料  17-18
  2.2 试验方法  18-22
  2.3 统计方法  22-24
第三章试验结果  24-35
  3.1 从血样中提取基因组DNA 结果  24
  3.2 PCR 扩增产物琼脂糖凝胶检测  24-25
  3.3 12%聚丙烯酰胺凝胶电泳结果  25-27
  3.4 群体内各位点的等位基因和基因频率  27-29
  3.5 群体内遗传变异的分析  29-31
  3.6 群体间遗传变异检测结果  31-32
  3.7 微卫星位点不同基因型与兴凯湖梅花鹿鲜茸重的相关分析  32-33
  3.8 各微卫星位点在兴凯湖梅花鹿中的个体识别能力  33-35
第四章讨论  35-39
  4.1 关于采样方法和样本含量的问题  35
  4.2 微卫星位点的选择  35-36
  4.3 三个梅花鹿群体遗传多样性评估  36
  4.4 群体间遗传距离  36-37
  4.5 微卫星标记基因型与兴凯湖梅花鹿鲜茸重之间的相关分析  37-38
  4.6 微卫星位点在兴凯湖梅花鹿中的个体识别能力  38-39
第五章结论  39-40
  5.1 结论  39
  5.2 创新点  39
  5.3 有待解决的问题  39-40
参考文献  40-45
致谢  45-46
作者简历  46

黑龙江省部分地区梅花鹿微卫星遗传多样性的研究

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