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高邮鸭Ghrelin基因多态性及与生产性能的相关分析

作　者: 高燕
导　师: 李昂；陈宽维
学　校: 福建农林大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 高邮鸭 Ghrelin基因生产性能相关分析
分类号: S834.8
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要

本研究以高邮鸭及连城白鸭、莆田黑鸭、金定鸭、绍兴鸭、攸县麻鸭、北京鸭、建昌鸭八个国家级保护鸭品种为试验材料,以生长素(Ghrelin)基因的多态性为研究内容,同时对Ghrelin基因的多态性与高邮鸭的生长发育及繁殖性状进行相关分析,结果表明:1本试验根据鸭Ghrelin基因(GenBank登陆号:EF613552)序列设计的引物中有GE1、GE2及GE3三对引物检测到多态,且三对引物分别检测到三种基因型。2结果表明,引物GE1检测出在DNA序列167bp处有“TCAAGTCAG”9bp的缺失。引物GE2检测出在431bp处发生了T→C的突变。引物GE3检测出在DNA序列909bp处发生了A→G的突变。3高邮鸭Ghrelin基因三对引物检测到的多态位点均处Hardy-Weinberg平衡状态。4分析表明:在内含子1基因座上,北京鸭为肉用型鸭,其等位基因A频率显著高于其他品种;在内含子2基因座上,绍兴鸭等位基因C频率显著高于其他品种,且基因型分布与北京鸭差异显著(P<0.05),与其他鸭种间差异极显著(P<0.01);在外显子3基因座上,连城白鸭等位基因F频率显著高于其他品种,且基因型分布与莆田黑鸭差异显著(P<0.05),与其他鸭种差异极显著(P<0.01)。5 Ghrelin基因检测到的内含子1的一个多态位点,9bp的缺失已在高邮鸭各性状中验证,证明该缺失对高邮鸭产蛋数的选择具有显著影响(P<0.05)。Ghrelin基因检测到的内含子2的一个多态位点,T→C的突变对高邮鸭开产体重的选择具有显著影响(P<0.05)。Ghrelin基因检测到的外显子3的一个多态位点检测到的多态位点:A→G的突变使得53位氨基酸(ABR12605)处发生了苏氨酸→丙氨酸变化,对高邮鸭的最大连产天数具有显著影响(P<0.05)。

全文目录

中文摘要  8-9
Abstract  9-11
第一章文献综述  11-19
  1 生长素(Ghrelin)基因的研究进展  11-13
    1.1 生长素(Ghrelin)的发现、结构、特点及分布  11-12
    1.2 生长素（Ghrelin）受体  12-13
    1.3 生长素（Ghrelin）的作用机制  13
  2 生长素（Ghrelin）的生理功能  13-16
    2.1 特异性的刺激垂体前叶生长激素(GH)的释放  13-14
    2.2 增加食欲,调节能量代谢平衡  14
    2.3 促进胃酸分泌及胃肠发育,增强胃肠道功能  14-15
    2.4 改善心血管功能  15
    2.5 其他  15-16
  3 生长素（Ghrelin）基因的多态性研究进展  16
  4 PCR-SSCP 技术  16-17
  5 研究的目的和意义  17-19
第二章八个国家级保护鸭品种生长素（Ghrelin）基因多态性研究  19-36
  1 试验材料  19-21
    1.1 试验鸭来源及采样方法  19
    1.2 主要仪器设备  19-20
    1.3 主要溶液的配制  20-21
    1.4 分析工具及软件  21
  2 试验方法  21-25
    2.1 鸭血液基因组DNA 的小量提取  21-22
      2.1.1 提取方法  21-22
      2.1.2 DNA 琼脂糖凝胶电泳的检测  22
      2.1.3 紫外光分光光度计检测 DNA 浓度和纯度  22
    2.2 PCR 引物设计与合成  22-23
      2.2.1 引物的合成与稀释  22-23
    2.3 最佳PCR 条件的建立  23
    2.4 PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳检测  23
    2.5 PCR-SSCP 检测  23-25
      2.5.1 不同浓度聚丙烯酰胺凝胶的配制  23-24
      2.5.2 PAGE 胶的灌制  24
      2.5.3 PCR 产物的变性及电泳  24
      2.5.4 聚丙烯酰胺凝胶染色  24-25
      2.5.5 基因型判定  25
    2.6 PCR 产物的序列测定  25
    2.7 DNA 序列比对  25
  3 统计分析方法  25-27
    3.1 基因频率和等位基因频率的计算  25-26
    3.2 Hardy-weinberg 检验  26
    3.3 群体内遗传变异的度量指标——杂合度及纯合度  26
    3.4 有效等位基因数(Effective number of alleles)  26-27
    3.5 多态信息含量(Polymorphism Information Content，PIC)  27
  4 结果与分析  27-34
    4.1 Ghrelin 基因三对引物的PCR 扩增产物1.596的琼脂糖检测结果  27-28
    4.2 Ghrelin 基因多态性分析  28-30
      4.2.1 引物GE1,GE2,GE3 的PCR 扩增产物的SSCP 检测结果  28-29
      4.2.2 序列分析  29-30
    4.3 Ghrelin 基因三个基因座的基因型和基因频率分析  30-32
      4.3.1 八个鸭种Ghrelin 基因内含子1 基因型和基因频率分析  30-31
      4.3.2 八个鸭种Ghrelin 基因内含子2 基因型和基因频率分析  31
      4.3.3 八个鸭种Ghrelin 基因外显子3 基因型和基因频率分析  31-32
    4.4 Ghrelin 基因三个基因座的基因型分布差异检验  32-34
      4.4.1 不同鸭种Ghrelin 基因内含子1 的基因型分布差异检验  32
      4.4.2 不同鸭种Ghrelin 基因内含子2 的基因型分布差异检验  32-33
      4.4.3 不同鸭种Ghrelin 基因外显子3 的基因型分布差异检验  33-34
  5 讨论  34-36
    5.1 测序结果分析  34
    5.2 Ghrelin 基因多态性讨论  34
    5.3 Ghrelin 基因三个基因座的基因型、基因频率及基因型分布分析  34-36
第三章高邮鸭生长素基因的多态性与生产性能的相关分析  36-45
  1 试验材料  36
    1.1 试验鸭来源及采样方法  36
    1.2 主要仪器设备与试剂  36
  2 试验方法  36
    2.1 鸭血基因组DNA 的小量提取  36
    2.2 PCR 引物设计与合成  36
    2.3 最佳PCR 条件的建立  36
    2.4 PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳检测  36
    2.5 PCR 产物的SSCP 检测  36
    2.6 PCR 产物的序列测定  36
    2.7 DNA 序列比对  36
  3 统计分析方法  36
  4 结果与分析  36-42
    4.1 鸭血液DNA 提取结果  36-37
    4.2 Ghrelin 基因三对引物PCR 扩增产物1.596的琼脂糖检测结果  37-38
    4.3 Ghrelin 基因多态性分析  38-40
      4.3.1 引物GE1,GE2,GE3 的PCR 扩增产物的SSCP 检测结果  38
      4.3.2 序列分析  38-40
    4.4 高邮鸭Ghrelin 基因SSCP 分析及其与生产性能关系的研究  40-42
      4.4.1 高邮鸭产蛋性状间的相关性分析  40
      4.4.2 高邮鸭Ghrelin 基因遗传特性分析  40-41
      4.4.3 Ghrelin 基因多态性位点的基因频率和基因型频率及适合性检验  41
      4.4.4 Ghrelin 基因多态与高邮鸭生产性能相关分析  41-42
  5 讨论  42-43
    5.1 电泳方法  42
    5.2 血液基因组DNA 的琼脂糖凝胶检测  42
    5.3 测序结果分析  42
    5.4 Ghrelin 基因多态性讨论  42-43
  5.5 高邮鸭 Ghrelin 基因多态位点与其生产性能关系分析  43-45
    5.5.1 高邮鸭产蛋性状间的相关性分析  43
    5.5.2 高邮鸭 Ghrelin 基因遗传特性的分析  43
    5.5.3 高邮鸭 Ghrelin 基因多态位点与各性状关系分析  43-45
第四章结论  45-46
参考文献  46-50
致谢  50

高邮鸭Ghrelin基因多态性及与生产性能的相关分析

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