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利用SNPs进行唐氏综合征无创性产前诊断的可行性研究

作　者: 卫小静
导　师: 郑梅玲
学　校: 山西医科大学
专　业: 妇产科学
关键词: 唐氏综合征单碱基多态性（SNP）变性高效液相色谱（DHPLC）胎儿游离DNA（cffDNA）胎儿游离RNA（cffRNA）多重连接依赖探针扩增技术（MLPA）无创产前诊断（NIPD）
分类号: R714.5
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

为了探讨利用21号染色体上SNP（单碱基多态性，single-nucleotidepolymorphism SNP）位点进行唐氏综合征产前诊断的可行性,建立一种快速、准确、简便并适于推广至临床的唐氏综合征无创产前诊断方法。我们用不同的实验方法对21号染色体上的多个SNP位点进行研究，以达到诊断唐氏综合征的目的，本研究包括以下两部分：第一部分：运用基于异源双链生成的单管PCR-DHPLC技术检测21号染色体数目的研究目的：建立一种基于异源双链生成的单管PCR-DHPLC（变性高效液相色谱denaturing high performance liquid chromatography DHPLC）技术,用于检测21号染色体的数目。方法：根据所研究靶SNPs位点上下的碱基序列设计PCR引物，优化PCR反应及DHPLC的检测条件，根据DHPLC的色谱图对21号染色体的数目进行检测，分析DHPLC色谱图中的四个峰高度之比若为1:1:1:1即为二倍体；四个峰高度之比为2:2:4:1或2:2:1:4即为三倍体。结果：对27例已知基因型的DNA标本（14例正常人标本，13例唐氏综合征标本）运用PCR-DHPLC技术对21号染色体的数目做出检测。除3例唐氏综合征标本的靶SNPs位点为纯合子不能做出诊断外，其余标本均与已知的基因型相吻合。结论：运用基于异源双链生成的单管PCR-DHPLC技术分析色谱图中的峰高比可用来检测21号染色体的数目，此方法准确，简便，快速，重复性好，但对于靶SNP位点为纯合子的标本则不能做出诊断，尚存在有局限性。第二部分：运用MLPA—AB3130技术检测21号染色体上PLAC4-SNPs的杂合度探讨其用于产前检测唐氏综合征的可行性。目的：应用多重连接依赖探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probeamplification,MLPA)联合AB3130（高压毛细管电泳仪）检测21号染色体上PLAC4基因上的多个SNPs，研究其多态性，探讨应用PLAC4-SNPs检测唐氏综合征的可行性。方法：检索出PLAC4基因上的94个SNPs碱基序列，从中选出13个SNPs，根据SNPs上下的碱基序列合成探针，选用100例染色体核型分析结果正常的DNA标本，应用MLPA—AB3130技术进行实验，研究其多态性情况。对于每个靶SNP位点而言，电泳图谱中若出现双峰即为杂合子，出现单峰则为纯合子。结果：应用上述方法对100例正常DNA标本做了检测，13个SNPs中Rs4818219，Rs8130833，Rs59066201，Rs9977003，Rs3804026的杂合度较高，分别为0.43；0.41；0.38；0.29；0.18。可进一步用于CffmRNA→cDNA→MLPA→AB3130检测唐氏综合征。结论：虽然本研究中所选用的正常DNA标本存在有地域性，且样本量较少，但我们的研究结果为进一步利用CffmRNA-SNPs进行无创产前诊断提供了依据，奠定了基础。因为按Lo等的理论，如果这5个SNPs同时做为靶位点，其中只要有一个为杂合子即可对21三体的标本做出诊断。故将孕妇血中PLAC4基因胎盘特异表达的mRNA先反转录为cDNA，再应用MLPA—AB3130技术检测SNPs进行唐氏综合征产前诊断具有可行性和应用前景。

全文目录

中文摘要  5-7
英文摘要  7-10
前言  10-12
第一部分  12-23
  引言  12
  1 .材料与方法  12-20
  2. 结果  20-21
  3. 讨论  21-23
第二部分  23-35
  引言  23
  1 .材料与方法  23-33
  2. 结果  33
  3. 讨论  33-35
小结  35-36
参考文献  36-38
综述  38-43
  参考文献  41-43
个人简历  43-44
致谢  44

利用SNPs进行唐氏综合征无创性产前诊断的可行性研究

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