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大豆产量、品质性状与SSR标记的关联分析

作　者: 高中杰
导　师: 喻德跃
学　校: 南京农业大学
专　业: 作物遗传育种
关键词: 大豆 产量性状 蛋白含量 油脂含量 关联分析
分类号: S565.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


产量、品质是大豆育种中的重要目标性状,并且都是数量性状,其遗传受环境影响较大。本研究选择了源自全国不同生态类型的204份大豆代表性地方品种、采用2年2个小生态环境的田间试验设计,在与先前研究结果反复比较的基础上,进一步探究了产量(以单株粒重为指标)、蛋白含量、油脂含量与单株荚数、单株粒数、百粒重、花期、熟期性状之间的相关程度。随后,从大豆基因组中筛选了135个SSR标记,分析了材料的群体结构,结合上述各个性状的表型数据,进行了标记与性状的关联分析,旨在发掘2年2个小生态环境下与产量、蛋白含量、油脂含量相关且能被重复关联到的位点。主要结果如下：1.大豆单株粒重、蛋白含量、油脂含量与5个农艺性状的相关分析结果表明：单株粒重与单株荚数、单株粒数、百粒重、花期、熟期性状均呈显著或极显著的正相关；蛋白含量与单株粒重、百粒重呈负相关,油脂含量与单株粒重、百粒重却呈显著或极显著的正相关,蛋白含量与油脂含量存在极显著的负相关,两者与单株荚数、单株粒数相关性均不明显,与花期负相关,蛋白含量与熟期负相关,而油脂含量与熟期却是正相关的关系。2.SSR等位变异丰富,总计有2544个等位变异,各位点等位变异的数目2～43个,平均等位变异数为19个；各位点多态性信息量变化幅度0.095～0.968,平均多态性信息含量为0.828。本研究所采用的204份材料来自全国不同省份不同地理区域,材料来源广、地理差异大,由此积累的材料间变异是SSR标记变异如此丰富的主要原因。3.标记位点间的LD分布结果表明：在大豆公共图谱上,不论是共线性SSR位点组合,还是非共线性的SSR位点组合之间,都有一定程度的LD存在,但是在统计概率P<0.01时,发生连锁不平衡的位点组合比例就大大减少了。4.2009年网室、大田2个小生态环境下,百粒重、花期和熟期都能被关联到的位点个数分别为6个、6个、7个,其中多个位点同时与不同性状关联。本研究所有关联到的位点中,只有位于N连锁群上的satt387位点在2年份、2个小生态环境下被重复地被关联到,是与油脂含量相关的位点,其表型变异解释率依次为0.139、0.151和0.169,此位点跟陈庆山等(2007)检测到的2个油脂含量QTL在公共图谱上相距较近,初步推测此位点是与油脂含量相关且稳定性较高的位点,还有待于后续工作的验证。

全文目录


摘要  6-8ABSTRACT  8-10第一部分 文献综述  10-26  第一章 大豆产量、品质性状研究  11-26    1 大豆的重要地位及进口量逐年增加的现状  11    2 大豆产量的现状及研究进展  11-16      2.1 大豆产量育种研究近况  12-15      2.2 大豆栽培模式的研究进展  15-16    3 大豆蛋白含量、油脂含量的研究进展  16-19      3.1 大豆蛋白含量、油脂含量研究近况  16-18      3.2 大豆蛋白含量、油脂含量的遗传模式  18      3.3 大豆蛋白含量、油脂含量与产量、环境和栽培条件之间的关系  18-19    4 关联分析-大豆分子育种的新途径  19-25      4.1 连锁不平衡(LD)的意义  21-22      4.2 影响关联分析的因素  22      4.3 关联分析的两种基本途径  22-25    5 本研究的目的意义  25-26第二部分 研究报告  26-57  第二章 试验设计与数据分析方法  27-33    1 材料与方法  27-29      1.1 试验材料  27      1.2 田间设计与性状调查  27      1.3 SSR标记全基因组扫描  27-28      1.4 实验涉及到的主要仪器  28-29    2 数据的分析方法  29-33      2.1 田间数据的分析方法  29      2.2 SSR数据的处理方法  29-33  第三章 结果分析  33-53    1 田间性状的结果分析  33-41      1.1 表型数据的描述统计与方差分析  33-38      1.2 大豆产量、蛋白含量、油脂含量的相关分析  38-41      1.3 大田与网室的差异比较  41    2 大豆产量、蛋白含量、油脂含量的关联分析  41-53      2.1 群体遗传多样性分析  41-43      2.2 群体结构分析  43-44      2.3 SSR位点间的连锁不平衡分布及衰减  44-45      2.4 SSR位点与产量、蛋白含量、油脂含量的关联  45-53  第四章 全文讨论、结论以及创新之处  53-57    1 全文讨论  53-56      1.1 大豆产量、品质性状关联分析的必要性  53      1.2 大豆连锁不平衡研究分析  53-54      1.3 大豆群体结构分析  54      1.4 关联到的产量、品质位点讨论  54-55      1.5 研究展望  55-56    2 全文结论  56    3 本文创新之处  56-57参考文献  57-65附录  65-71致谢  71

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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 油料作物 > 大豆
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