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hURAT1基因启动子区-87C/T SNP与原发性痛风的关联及功能研究
作 者: 于清
导 师: 李长贵
学 校: 青岛大学
专 业: 内科学
关键词: 人尿酸盐转运蛋白1 痛风 糖皮质激素受体 启动子区
分类号: R589.7
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
下 载: 53次
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内容摘要
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目的人尿酸盐转运蛋白1(hURAT1)是维持血尿酸水平的关键离子通道,是导致原发性高尿酸血症的重要侯选基因。根据前期工作基础,我们发现hURAT1基因启动子区-87C/T SNP与原发性高尿酸血症相关,且该SNP可导致基因转录活性改变。由于高尿酸血症与痛风遗传因素并不完全相同,本研究拟进一步在山东汉族男性痛风人群中进一步筛查该点,明确该SNP是否与原发性痛风相关;同时拟进一步开展机制研究,探讨该SNP转录活性差异是否由不同转录因子介导。方法收集山东汉族男性痛风病人335例,正常男性对照376例,提取全血基因组DNA,进行PCR扩增,进而测序分析,χ2检验比较不同组别基因型及等位基因频率,明确该SNP位点与痛风的相关性。应用Transfac6.0及Alibaba2.1软件就该位点不同等位基因型转录因子结合情况进行预测;抽提OK细胞核蛋白,标记包含-87C/T SNP不同等位基因型的探针,设立空白对照,运用EMSA实验观察两种等位基因型探针蛋白结合情况。根据生物信息预测结果,设计CREB, USF, GR共有序列及包含-87C/T SNP不同等位基因型的非标记探针,运用冷竞争实验来初步明确-87C/T SNP不同等位基因型引发转录活性差异涉及的转录因子。结果1.hURAT1基因启动子区-87C/T SNP与山东汉族男性痛风发病相关(P=0.004)。等位基因频率结果显示:C基因型发病风险为T基因型的1.43倍;基因型频率结果显示:CC基因型发病风险为TT基因型的2倍。2.生物学信息预测结果:Transfac6.0提示:-87C等位基因型较T等位基因型可能多USF结合位点,少GR结合位点,或是两者结合活性存在差异;Alibaba2.1提示:-87C等位基因型较T等位基因型可能多CREB结合位点或结合活性存在差异。3.EMSA结果显示-87C/T两种等位基因型均与核蛋白结合形成两条特异性条带,但其中一条条带T等位基因型较C等位基因型增强;冷竞争实验结果显示GR及CREB可竞争掉特异性条带,但USF不参与上述的特异性竞争过程。结论hURAT1基因启动子区-87C/T SNP与山东汉族男性痛风相关;该SNP转录活性存在差异,是致病位点,该差异可能由GR转录因子通过CREB介导完成。
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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 代谢病 > 嘌呤(Purine)代谢障碍
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