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乳腺癌与DNA修复基因多态性的相关性分析

作　者: 王可人
导　师: 宋燕
学　校: 吉林大学
专　业: 外科学
关键词: 乳腺癌单核苷酸多态性 SNP ATM ATR BRCA1 BRCA2
分类号: R737.9
类　型: 博士论文
年　份: 2008年
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内容摘要

乳腺癌是女性发病率较高的恶性肿瘤之一,严重危害着广大妇女的身体健康。乳腺癌的发病原因与多种因素有关,易感基因对乳腺癌的发生发展有着重要的作用。随着分子生物学技术及人类基因组计划的初步完成,越来越多的易感基因被人们所了解。最近的研究表明参与DNA损伤修复过程的基因与乳腺癌的发生发展密切相关。本实验拟从DNA损伤修复通路中相关联的ATM/ATR/BRCA1/BRCA2基因多态性位点入手,通过病例-对照分析,研究各位点与乳腺癌的相关性,并探索各基因及位点间的互作关系。本研究通过收集乳腺癌患者及正常健康者静脉血样各180例,共计360例血样标本,通过PCR-RFLP方法对上述4基因5个多态性位点进行SNP分型,计算各位点基因型频率。确定符合人群遗传平衡后,计算各位点与乳腺癌风险0R值,并通过多因子降维法及互作图谱分析各基因位点间的互作关系。本研究结果表明,ATM基因rs228593位点A/A基因型和rs611646位点T/T基因型组合提高了乳腺癌患病风险,且在绝经组中更为显著。ATR基因rs13091637位点T/C基因型可显著降低乳腺癌的发病风险。BRCA1基因rs4793191位点等位基因G具有降低乳腺癌发病风险的作用。BRCA2基因rs9567623与乳腺癌易感性无明显关联。多因子降维分析中最佳的模型为上述5位点联合作用模型,ATR基因rs13091637位点在其中具有最高独立主效应熵,而ATM基因rs611646位点具有最高的基因间协同效应。综上所述,本研究结果对于进一步评价和识别DNA损伤修复通路中相关基因在乳腺癌中的相互作用,阐明乳腺癌发生的分子遗传学机制及可能存在的基因-基因交互作用等都具有重要的理论和现实意义。通过本研究发现的与我国人群乳腺癌易感性相关的多态性位点及基因型,验证后可作为分子标志物用于筛选高危人群,对乳腺癌实施有效和目标明确的个体预防、早期诊断等均具有一定的意义。

全文目录

提要  5-8
英文缩写  8-9
前言  9-10
第一章文献综述  10-31
  1. SNP的研究进展  10-20
  2. DNA损伤修复基因与乳腺癌易感性的研究进展  20-31
第二章材料与方法  31-52
  1. 主要仪器与试剂  31-33
  2. 研究对象与样本收集  33
  3. SNP位点的选择及引物设计  33-38
  4. 血液基因组DNA的提取  38-39
  5. PCR扩增目的片段  39-41
  6. 限制性酶切确定基因型  41-42
  7. 数据库的建立  42-43
  8. 数据分析  43-52
第三章实验结果  52-74
  1. 研究对象的一般情况  52-53
  2. 等位基因及基因型频率  53-61
  3. Hardy-weinberg平衡检验  61-62
  4. 单基因多态性位点与乳腺癌的相关分析  62-71
  5. 多基因位点互作分析  71-74
第四章讨论  74-88
  1. SNP检测与乳腺癌  74-76
  2. 候选基因与多态性位点测定方法的选择  76-78
  3. 单基因多态与乳腺癌易感性的关系  78-82
  4. 多基因联合作用与乳腺癌易感性的关系  82-88
结论  88-89
参考文献  89-98
攻博期间发表的学术论文  98-99
摘要  99-103
Abstract  103-106
致谢  106

乳腺癌与DNA修复基因多态性的相关性分析

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