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细胞自噬与稻瘟病菌Magnaporthe grisea生长、发育和致病性的关系
作 者: 刘小红
导 师: 闵航;林福呈
学 校: 浙江大学
专 业: 微生物学
关键词: 细胞自噬 稻瘟病菌 MgATG1 MgATG5 附着胞膨压 致病性
分类号: S435.111.41
类 型: 博士论文
年 份: 2007年
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内容摘要
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细胞自噬是真核生物中广泛存在的、保守的过程,是一个细胞内长寿命蛋白或细胞器降解和再利用的过程。细胞自噬过程的主要标志是产生双层膜的自噬泡,自噬泡包裹着将要被降解的物质,随后液泡与溶酶体结合。许多年来,真核生物在分化和发育的过程中,细胞自噬过程被认为与细胞的形态建成相关,在细胞器和蛋白质周转的过程中发挥重要作用。遗传数据分析,在酵母(Saccharomyces cerevisiae)、粘菌(Dictyostelium discoideum)和线虫(Caenorhabdiitis elegans)中,尤其是在低等真核生物中,外界环境的变化,可以诱导细胞自噬发生。稻瘟病是一种毁灭性病害,给全世界的水稻生产带来巨大威胁,稻瘟病是由稻瘟病菌引起的。稻瘟病菌是子囊菌,具有典型的生活史和侵染循环,被认为是是丝状真菌分子生物学和致病机理研究的模式。稻瘟病菌能够形成具有精巧结构的附着胞,一种典型的侵入机构。附着胞细胞壁出现黑色素沉积,最终形成黑色素层。黑色素层允许水分子自由通过,但溶解于水的物质不能自由通过,从而让附着胞建立并维持一个很大的胞内膨压,产生达8.0Mpa的巨大压力,这个压力使稻瘟病菌穿透寄主叶片表皮,侵染寄生。巨大膨压的来源主要是大量脂类、糖原、海藻糖和甘露醇积累的结果。本文主要目的是研究和阐明细胞自噬过程与稻瘟病菌生长、发育和致病性之间的关系。获得的主要研究结果如下:1)在稻瘟病菌附着胞的差减文库中,找到了细胞自噬相关基因的EST(expressed sequence tags),进而找到基因,定名为MgATG1,该基因编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。将稻瘟病菌MgATG1基因,互补到酵母ATG1基因缺失突变体中,能够恢复酵母的细胞自噬过程;对MgATG1进行细胞定位,该基因在细胞质中均匀表达;通过构建MgATG1基因置换载体,得到基因MgATG1缺失突变体Δmgatg1。2)Δmgatg1突变体在CM或者MM培养基上的菌落形态发生变化,菌丝稀疏;产孢量显著下降,仅为野生型Guy11的1/15;分生孢子的萌发延迟;分生孢子中,脂质体含量下降;Δmgatg1突变体附着胞膨压显著下降,在完整的水稻或者大麦叶片上不能形成可见病斑,致病性丧失;在有磨损的大麦叶片上只能产生微弱的病斑;突变子在OMA培养基上与2539菌株交配,不能产生子囊壳,育性受到影响;基因MgATG1缺失,细胞自噬过程中断,在液泡和细胞质中,没有自噬泡的积累。3)通过同源序列比对,PCR的方法,得到细胞自噬相关基因MgATG5;利用类似于MgATG1的研究方法分析了MgATG5的功能。稻瘟病菌MgATG5基因,可以恢复酵母ATG5基因缺失突变的功能,使细胞自噬过程恢复;基因在细胞内定位于孢子,菌丝和附着胞的细胞质中,在细胞核中的表达更强。4)基因缺失突变体Δmgatg5,细胞自噬过程中断;菌落形态改变,菌丝稀疏;孢子产量显著下降,分生孢子中脂质体含量下降;与2539菌株的交配,不能形成子囊壳;孢子萌发和附着胞形成滞后;附着胞膨压显著下降;在大麦和水稻上的致病性丧失。细胞自噬过程是真核生物中非常保守的过程,此过程在植物病原真菌中的研究很少,在稻瘟病菌中的研究国内尚属首次,本研究选题新颖;同时,稻瘟病菌作为植物病原菌的研究模式,研究过程中应用的方法对其它病原真菌的研究起到借鉴作用。
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全文目录
摘要 6-8 Abstract 8-15 第一章 文献综述 15-44 1 细胞自噬 15-24 1.1 细胞自噬的类型 15-16 1.2 细胞自噬的分子机制 16-21 1.2.1 细胞自噬的诱导以及物质的选择和包装 17-19 1.2.2 自噬体的形成 19-21 1.3 细胞自噬的信号调控 21-23 1.3.1 Tor信号途径 22 1.3.2 Class Ⅰ PI3K/PKB途径 22 1.3.3 Gαi3蛋白 22-23 1.4 细胞自噬的形态学观察 23-24 1.4.1 显微镜观察 23 1.4.2 Monodansylcadaverine(MDC)染色 23-24 1.4.3 GFP-LC3定位 24 2 稻瘟病与稻瘟病菌 24-44 2.1 稻瘟病菌的侵染循环 25-26 2.2 稻瘟病菌附着胞形成 26-27 2.3 稻瘟病菌附着胞形成过程中的相关基因 27-33 2.3.1 参与表面识别的基因 27-29 2.3.1.1 疏水蛋白 27-28 2.3.1.2 跨膜蛋白 28-29 2.3.2 甘油合成相关基因 29-30 2.3.3 黑色素相关基因 30-31 2.3.4 产孢相关基因 31-33 2.4 稻瘟病菌信号传导途径 33-39 2.4.1 环化腺苷酸(cAMP)信号途径 33-34 2.4.2 MAPK(Mitogen-activated protein kinase)信号传导途径 34-37 2.4.3 Ca~(2+)离子途径 37-38 2.4.4 G蛋白途径 38-39 2.5 其它致病性相关的基因 39-44 第二章 材料与方法 44-62 1 试验菌株 44 2 稻瘟病菌的培养基 44-46 3 大肠杆菌的培养 46 4 酵母分析 46-48 4.1 培养酵母的培养基 46 4.2 酵母菌落PCR 46-47 4.3 酵母的高效转化 47-48 5 PCR 48 5.1 常规PCR:PCR反应体系(50μl) 48 5.2 LD-PCR(长距离PCR):PCR反应体系(50μl): 48 6 DNA分析 48-51 7 质粒提取 51-52 8 稻瘟病菌基因组DNA的提取 52-53 9 稻瘟病菌产孢培养、孢子收集和附着胞诱导培养 53 10 稻瘟病菌RNA提取和分析 53-55 11 稻瘟病菌原生质体的制备与转化 55-56 11.1 原生质体的制备 55 11.2 转化 55-56 12 稻瘟病菌基因组DNA Southern杂交(DIG) 56-58 12.1 DIG-DNA标记 56 12.2 基因组DNA的消化、电泳及变性 56-57 12.3 DNA转膜 57 12.4 Southern杂交过程 57-58 12.5 免疫显色 58 13 稻瘟病菌附着胞的诱导 58-59 14 水稻(大麦)离体接种 59 15 水稻(大麦)苗喷雾接种 59 16 稻瘟病菌的有性杂交 59 17 稻瘟菌菌侵染过程的组织病理学观察 59-60 18 稻瘟病菌染色观察 60 18.1 脂质体的观察 60 18.2 糖原染色 60 19 细胞自噬现象的观察 60 20 荧光表达的观察 60-61 21 菌落生长速度以及产孢量 61 22 附着胞形成 61 23 透射电镜样品制备方法 61-62 第三章 稻瘟病菌细胞自噬基因MgATG1功能的研究 62-93 1 MgATG1基因的分离和克隆 62-65 2 MgATG1基因同源性分析 65-67 3 MgATG1基因的细胞定位 67-70 3.1 通用载体pBSHPH1的构建 67 3.2 GFP-MgATG1融合载体的构建 67-69 3.3 荧光观察 69-70 4 MgATG1基因缺失突变体的获得 70-75 4.1 MgATG1基因敲除载体的构建 70 4.2 Δmgatg1突变体的获得 70-72 4.3 互补载体的构建 72-73 4.4 qRT-PCR和RT-PCR 73-75 5 突变体Δmgatg1的细胞自噬过程中断 75-77 6 突变体表型分析 77-85 6.1 突变体Δmgatg1的菌落形态 77 6.2 突变体Δmgatg1的产孢量下降 77-79 6.3 交配试验 79 6.4 孢子萌发和附着胞形成 79-80 6.5 脂质体含量减少 80-83 6.6 糖原的移动 83 6.7 附着胞膨压下降 83-85 7 突变体Δmgatg1致病性丧失 85-88 7.1 离体接种 85 7.2 喷雾接种 85-88 7.3 病斑数统计和分级 88 8 Δmgatg1致病机丧失的细胞学观察 88-91 9 本章小结 91-92 附:研究稻瘟病菌MgATG1基因试验中的引物 92-93 第四章 稻瘟病菌细胞自噬基因MgATG5功能的研究 93-112 1 MgATG5基因的分离和克隆 93-94 2 MgATG5基因同源性分析 94-95 3 基因缺失突变体和恢复突变体的获得 95-100 3.1 MgATG5基因置换载体的构建 95 3.2 基因缺失突变体Δmgatg5的获得 95-97 3.3 互补载体的构建 97-98 3.3.1 载体pBAR-ATG5 97 3.3.2 载体pNGA5B 97-98 3.3.3 载体pNA5GB 98 3.4 互补突变体的获得 98-99 3.5 反转录PCR 99-100 4 MgATG5基因细胞内GFP定位 100-101 5 突变体Δmgatg5表型分析 101-104 5.1 菌落形态的变化 101-102 5.2 产孢量下降 102 5.3 孢子萌发和附着胞形成延迟 102 5.4 附着胞膨压显著下降 102-103 5.5 突变体Δmgatg5不能形成子囊壳 103-104 6 突变体Δmgatg5细胞自噬过程被阻断 104-106 6.1 细胞自噬过程中断 104 6.2 突变体Δmgatg5对饥饿敏感 104-106 7 致病性分析 106-108 7.1 离体接种 106 7.2 喷雾接种 106-108 8 Δmgatg5致病性丧失的细胞学观察 108-110 9 本章小结 110-111 附:研究稻瘟病菌MgATG5基因试验中的引物 111-112 第五章 全文讨论与今后的工作 112-119 1 全文讨论 112-115 1.1 细胞自噬过程是进化上保守的过程 112-113 1.2 细胞自噬过程是真菌发育所必须的过程 113 1.3 细胞自噬是物质周转所必须的过程 113-114 1.4 细胞自噬是稻瘟病菌致病所必须的过程 114-115 2 本研究的创新点 115 3 今后的研究工作 115-119 参考文献 119-127
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 禾谷类作物病虫害 > 稻病虫害 > 病害 > 侵(传)染性病害 > 稻瘟病
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