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WO噬菌体的发现及与宿主Wolbachia相互关系的研究
作 者: 于娟娟
导 师: 丛斌
学 校: 沈阳农业大学
专 业: 农业昆虫与害虫防治
关键词: WO噬菌体 orf7基因 wsp基因 Wolbachia 协同进化
分类号: Q939.4
类 型: 博士论文
年 份: 2009年
下 载: 217次
引 用: 1次
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内容摘要
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WO噬菌体的发现及与宿主Wolbachia相互关系的研究噬菌体是以细菌为宿主的病毒,有高度的宿主特异性,是细菌遗传进化重要的推动力,也是细菌水平转移的催化剂,可以往返穿梭于独特的DNA之间进入宿主基因组中。然而,在专性寄生的胞内共生菌中则很少发现噬菌体的存在。Shinjit和Masui(2000)首次在Teleogryllus taiwanemma的Wolbachia基因组中发现了噬菌体的遗传物质,并将其定名为WO噬菌体。WO噬菌体既能以溶原状态插入到Wolbachia染色体中,也可裂解状态自由存在于细胞质中。因此很可能携带重要的基因以原噬菌体的形式插入到Wolbachia基因组中并参与Wolbachia调控宿主生殖方式。本论文的主要内容及取得的初步成果如下:1.本研究利用编码WO噬菌体衣壳蛋白的orf7基因,通过PCR扩增于国际上首次在米蛾体内发现存在WO噬菌体对胞内菌Wolbachia的感染,成功提取获得WO噬菌体的颗粒体,并进行了电镜观察。2.首次研究了WO噬菌体与Wolbachia的侵染关系以及WO噬菌体在不同地理种群和世代间存在的稳定性。结果表明,WO噬菌体不是自由存在于昆虫体内的寄生病毒,WO噬菌体是侵染胞内菌Wolbachia的专性病毒,在不同地理种群和世代间WO噬菌体均可以稳定的对Wolbachia垂直传播。推得:WO噬菌体侵染胞内菌Wolbachia并与之经历了长期、稳定的协同进化,从而形成演化共同体。3.研究了调查了包括膜翅目、鳞翅目、双翅目和半翅目的12种含Wolbachia的昆虫宿主体内WO噬菌体的感染情况。其中8种昆虫宿主体内含有WO噬菌体,该8种昆虫宿主均为作者首次报道;其余4种不含WO噬菌体的均为赤眼蜂种类。研究表明,WO噬菌体对Wolbachia宿主具有很强的侵染力,并很可能与诱导宿主的胞质不亲和表型(CI)相关。4.对稻水象甲(Lissorhoptrus oryzophilus Kuschel))、黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)、麻蝇(Sarcophaga spp.)、麦蛾茧蜂(Bracon hebetor Say)、米蛾(Corcyracephalonica))、寄蝇(Tachinida spp.)、茧蜂(Braconida spp.)等7种昆虫体内Wolbachia所感染WO噬菌体的orf7基因进行克隆测序,得到7个克隆,16个序列,并分别登录到Genebank。进行系统发育分析:WO噬菌体所表现的拓扑结构与其宿主Wolbachia的wsp基因系统树的拓扑结构不一致,说明WO噬菌体与Wolbachia两者的系统发育关系相关性不明显。5.首次利用RT-PCR技术研究了米蛾雌成虫、雄成虫、蛹、幼虫和卵中Wolbachia的wsp和WO噬菌体的orf7基因表达情况,并对这两个基因的表达量进行对比分析。结果表明,在米蛾的蛹、幼虫和雌虫体内,wsp和orf7基因表达效果基本一致,明显表达且表达量显著,而在卵和雄虫体内则几乎不表达,仅以原噬菌体的形式存在。在米蛾的各个生长发育过程中wsp基因的表达量趋于平稳。而orf7基因的表达量差异显著,从蛹期开始其表达量激增。表明,WO噬菌体在米蛾的雄性和雌性个体内的表达是不同的,WO噬菌体与宿主Wolbachia一样均是由母系细胞遗传。6.利用Real-Time PCR方法首次检测米蛾、麦蛾茧蜂、黑腹果蝇的Wolbachia的wsp基因和WO噬菌体的orf7基因进行,研究Wolbachia和WO噬菌体的诱导表达量。结果表明,三种昆虫体内wsp基因表达量及orf7基因表达量是不同的。其中wsp基因表达量差异不大,而orf7基因表达量差异较大
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全文目录
摘要 10-12 Abstract 12-14 第一章 文献综述 14-34 第一节 噬菌体编码的毒力基因和多样性 14-16 第二节 Wolbachia基因组及调控宿主生殖方式 16-22 第三节 WO噬菌体国内外研究的现状 22-29 第四节 实时荧光定量PCR技术概述 29-31 第五节 研究内容及创新点 31-33 第六节 技术路线 33-34 第二章 WO噬菌体的发现 34-43 第一节 WO噬菌体在昆虫纲主要类群中的发现 34-40 1 材料与方法 34-36 2 结果与分析 36-39 3 结论与讨论 39-40 第二节 WO噬菌体颗粒的提取与显微观察 40-43 1 材料与方法 40-41 2 结果与分析 41 3 结论与讨论 41-43 第三章 WO噬菌体与宿主Wolbachia的协同进化关系 43-67 1 材料和方法 43-50 2 结果与分析 50-61 2.1 DNA的提取结果 50-51 2.2 orf7基因片段PCR扩增结果 51 2.3 转化子的筛选和鉴定 51-52 2.4 测序结果 52-57 2.5 稻水象甲体内orf7基因序列分析 57-58 2.6 麦蛾茧蜂体内orf7基因序列分析 58-60 2.7 基于orf7基因序列各昆虫体内WO噬菌体的序列分析 60-61 2.8 基于wsp基因建立的昆虫Wolbachia序列分析 61 3 结论与与讨论 61-67 3.1 标识基因 61-62 3.2 序列命名、排序和分析 62 3.3 WO噬菌体的多样性分析 62 3.4 WO噬菌体的系统发育分析 62-67 第四章 Wolbachia和WO噬菌体的侵染关系及稳定性的研究 67-75 1 材料与方法 67-68 2 结果与分析 68-73 2.1 抗生素处理结果 68 2.2 连续饲养的米蛾和黑腹果蝇中WO噬菌体存在的稳定性 68-69 2.3 wsp基因检测结果 69 2.4 4个地区的黑腹果蝇体内WO噬菌体存在的稳定性 69-73 3 结论与讨论 73-75 第五章 WO噬菌体orf7基因表达及实时荧光定量研究 75-101 第一节 米蛾体内WO噬菌体orf7基因与Wolbachia的wsp基因表达情况 76-84 1 材料与方法 76-80 2 结果与分析 80-83 2.1 总RNA的提取结果 80-81 2.2 总RNA的OD值检测 81 2.3 RT-PCR扩增结果检测 81 2.4 cDNA扩增测序结果 81-83 3 结论与讨论 83-84 第二节 Real-Time PCR方法检测米蛾不同发育时期wsp和orf7基因的相对表达量 84-91 1 材料与方法 84-86 2 结果与分析 86-90 2.1 经过Real-time荧光定量PCR仪分析得到Ct值与荧光强度关系图及溶解曲线图 86-88 2.2 数据分析 88-90 3 结论与讨论 90-91 第三节 Real-Time PCR方法检测三种昆虫体内wsp基因和orf7基因的相对表达量 91-101 1 材料与方法 91-92 2 结果与分析 92-99 2.1 米蛾、黑腹果蝇、麦蛾茧蜂总RNA的提取结果 92 2.2 三种昆虫总RNA的Real-time PCR凝胶电泳检测结果 92-94 2.3 标准曲线的制定 94-97 2.4 wsp和orf7基因定量结果及相对表达量的计算 97-99 3 结论与讨论 99-101 第六章 结论与讨论 101-106 1 主要结论 101-102 2 讨论 102-106 参考文献 106-120 致谢 120-121 附录1:本论文常用缩写词及英汉对照 121-122 附录2:转化子的蓝白筛选 122
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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物分类学(系统微生物学) > 病毒(滤过性病毒)
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