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早期B细胞因子相关锌指蛋白基因（OAZ）与人类系统性红斑狼疮发病的相关性研究

作　者: 梁栋
导　师: 黄秀琴；沈南
学　校: 华东师范大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 红斑狼疮 系统性 狼疮肾炎 早期B细胞因子相关锌指蛋白基因基因 单核苷酸多态性 凝胶电泳迁移率改变分析(EMSA) 实时定量RT-PCR 等位基因分型 单倍型
分类号: R593.241
类　型: 硕士论文
年　份: 2005年
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内容摘要


系统性红斑狼疮是典型自身免疫病,被公认为自身免疫病的原型。通过对群体遗传学、双生子发病一致率和疾病家族聚集性等一系列研究均证实遗传因素在SLE发病中的起重要作用。到目前为止,已有3个独立的研究小组在不同的人群中证实染色体16q12区域SLE的发病显著连锁。实验室的预初研究也提示中国人群该区与SLE易感连锁,微卫星标记D16S517与SLE存在传递不平衡(P<0. 0001) ,而且OAZ基因可能是该区域的易感基因。本研究在此基础上,对OAZ基因与SLE的相关性做进一步分析。首先,我们采用测序等方法对OAZ基因内部阳性微卫星D16S517附近的SNPs进行筛选和验证,新发现3个SNPs,分别为rs2292155(第三内含子),rs2292156,rs3803665(第三内含子),其中rs3803665为沉默突变(第四外显子)。为进一步研究SNP的变异与疾病的相关性,我们选择OAZ基因内部阳性微卫星D16S517附近的8个SNP标记,进行Taqman等位基因分型(AllelicDiscrimination AD)。对SNP的等位基因型(allele)、基因型(genotype)及单倍型(haplotype)的分布进行病例对照研究,并应用传递不平衡检验(TDT)的方法进行连锁不平衡分析。病例对照结果显示:发现中国汉族人群中① SNPrs1344531等位基因(T)频率在SLE患者组(47. 0%)和正常对照组(38. 1%)中差异存在统计学意义(P=0. 008) ;CC基因型的频率在SLE患者组(25. 5%)与在正常对照组(38. 1%)中相比显著下降(P=0. 005) 。 ② SNP rs1344531等位基因(T)频率在狼疮肾炎患者组(53. 0%)和正常对照组(38. 1%)中差异存在统计学意义(P=0. 001) ;CC基因型的频率在狼疮肾炎患者组(22. 9%)与在正常对照组(38. 1%)中相比显著下降(P=0. 013) ,TT基因型的频率在狼疮肾炎患者组(28. 9%)与在正常对照组(14. 3%)中相比显著增高(P=0. 003) 。③ rs1420676-rs1344531(C-T)(P=0. 001) , rs3803665-rs1420676-rs1344531(C-C-T)(P=0. 004) ,rs2292155-rs3803665-rs1420676-rs1344531(C-C-C-T)(P=0. 002) 等单倍型频率在狼疮肾炎患者组中显著增高。而rs1344531-rs2080353(C-A)(P=0. 005) ,rs1344531-rs2080353-rs933564(C-A-G)(P=0. 006) 等单倍型的频率在狼疮肾炎患者组中显著下降。此外,传递不平衡检验(TDT)未发现阳性结果,但rs1344531位点显示优势传递的趋势(T等位基因,传递:不传递=107:97,P=0. 4839) 。以上结果提示,阳性SNP位点(rs1344531) 可能参与SLE的发病,也可能与邻近的某个致病位点存在连锁不平衡。有研究发现疾病候选基因的SNPs往往决定基因的表达情况,因此在实验的第二部分我们应用AB17700进行荧光标记实时定量PCR(real time PCR)的方

全文目录


中文摘要  6-8
Abstract  8-12
第一部分 OAZ基因单核苷酸多态性(SNP)与SLE相关性研究  12-51
  一、OAZ基因内部SNP的鉴定与筛选  12-27
    引言  12
    材料和方法  12-20
    结果  20-25
    讨论  25-27
  二、OAZ基因单核苷酸多态性(SNP)与疾病关联分析  27-51
    引言  27-28
    材料和方法  28-34
    结果  34-45
    讨论  45-51
第二部分 OAZ基因的表达研究  51-68
  引言  51
  一、OAZ基因表达与疾病的关联分析  51-63
    材料和方法  51-59
    结果  59-63
  二、OAZ基因内单核苷酸多态性对其mRNA表达的影响  63-68
    材料和方法  63
    结果  63-66
    讨论  66-68
第三部分 用生物信息学的方法分析OAZ基因内部的USF转录因子结合位点  68-80
  引言  68
  材料和方法  68-74
  结果  74-77
  讨论  77-80
附录  80-81
参考文献  81-87
致谢  87

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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 全身性疾病 > 免疫性疾病 > 自身免疫性疾病、结缔组织疾病 > 红斑狼疮 > 系统型红斑狼疮
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