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微卫星标记多态性与丝羽乌骨鸡屠宰性能的相关分析

作　者: 周艳
导　师: 朱庆
学　校: 四川农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 丝羽乌骨鸡屠宰性能微卫星标记相关分析多重PCR
分类号: S831.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2004年
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内容摘要

本试验以丝羽乌骨鸡为材料，在鸡1号染色体和Z染色体上分别选取15对和5对微卫星标记，应用多重PCR技术进行扩增后，产物在：ABI3100-Avant遗传分析仪上全自动检测。采用Cervus2.0分析各标记位点的等位基因数、杂合度、多态信息含量以及等位基因频率；运用SAS6.12进行分子标记与13个屠宰性状(包括宰前活重、全净膛重、半净膛重、肌胃等)非均衡数据方差分析和多重比较。还进行了多重PCR条件的优化和引物配套组合的筛选。结果表明： (1)经过对多重PCR条件和引物组合的反复优化，最终成功筛选了可用3个泳道检测的5套多重PCR组合(3个四微卫星组合和2个三微卫星组合)。用ABI3100-Avant遗传分析仪检测，结果表明本次多重PCR组合试验比较成功。 (2)所选用的20对微卫星引物中，除MCW0101和MCW0181因扩增效果不理想而剔除外，其余18对标记均表现出丰富的多态性。平均检测到6.83个等位基因(5-8个)，平均杂合度和多态信息含量分别为0.833和0.805。 (3)通过GLM分析，筛选出13个多态性位点与所选用的丝羽乌骨鸡的13个屠宰性状存在显著相关。 LEI0146与宰前活重相关显著；MCW0154、LEI0134和LEI0146与半净膛重相关显著，其中LEI0146与半净膛重相关极显著；LEI0146与脚重呈显著相关；LEI0146和MCE0036分别与心重相关显著和极显著；LEI0146和MCW0200均与肝重相关极显著；MCW0313、LEI0134、MCW0331与肌胃相关极显著；MCW0254和LEI0134与胸肌重、腿肌重相关显著，其中MCW0254与腿肌重相关极显著；MCW0154、LEI0134和LEI0146与全净膛重相关显著，其中LEI0146与全净膛重相关极显著；MCW0168、MCW0258、MCW0331、LEI0106、LEI0146、MCW0112均与全净膛率显著相关，其中MCW0258和LEI0146与全净膛率相关极显著；LEI0134、MCW0331、LEI0106、LEI0146、MCW0112与半净膛率相关显著，其中MCW0258和LEI0146与半净膛率相关极显著；MCW0258和MCW0200与胸肌率相关显著，MCW0200与胸肌率相关极显著；MCW0177和MCW0258与腿肌率显著相关，其中MCW0258与腿肌率呈极显著相关，表明以上微卫星标记可作为进一步QTL定位和标记辅助选择研究的参考。

全文目录

摘要  4-5
1 文献综述  5-15
  1.1 家禽育种的遗传标记  5-13
    1.1.1 形态学标记  5-7
    1.1.2 生化学标记  7
    1.1.3 细胞学标记  7-8
    1.1.4 生理学标记  8-10
    1.1.5 血型标记  10-11
    1.1.6 DNA分子标记  11-13
  1.2 家禽屠宰性状的研究现状  13-14
    1.2.1 应用数量遗传学方法对家禽屠宰性能的研究  13-14
    1.2.2 应用分子遗传标记对家禽屠宰性能的研究  14
  1.3 本试验研究的目的和意义  14-15
2 试验材料和方法  15-19
  2.1 试验材料  15-16
    2.1.1 试验群体及性能测定  15
    2.1.2 主要仪器设备  15-16
    2.1.3 主要试剂及配制  16
  2.2 试验方法  16-19
    2.2.1 血样的采集  16
    2.2.2 微卫星引物的选择与合成  16-18
    2.2.3 DNA的抽提  18
    2.2.4 PCR扩增  18
    2.2.5 PCR产物检测  18-19
  2.3 统计分析  19
    2.3.1 等位基因频率  19
    2.3.2 多态信息含量  19
    2.3.3 群体的杂合度  19
    2.3.4 标记基因型与屠宰性能的相关分析  19
3 结果与分析  19-43
  3.1 微卫星的优化及多重PCR组合的筛选  19-20
  3.2 多重PCR产物电泳结果  20-23
  3.3 微卫星标记多态性  23-25
  3.4 标记的多态性与屠宰性状相关关系  25-27
  3.5 显著相关的标记位点各基因型间比较分析  27-43
  3.6 屠宰性状间的相关分析  43
4 讨论  43-47
  4.1 多重PCR体系的构建及反应条件的优化  43-44
  4.2 微卫星标记及其多态性  44-45
    4.2.1 微卫星标记的选择  44
    4.2.2 微卫星标记的多态性  44
    4.2.3 无效等位基因  44-45
  4.3 微卫星标记与屠宰性状的相关  45
  4.4 屠宰性状间的表型相关  45-47
5 结论  47-48
6 参考文献  48-55
7 Abstract  55-57
8 致谢  57

微卫星标记多态性与丝羽乌骨鸡屠宰性能的相关分析

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