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广西肋壳钉螺和光壳钉螺与邻省钉螺亲缘关系研究

作　者: 杨芳芳
导　师: 黎学铭
学　校: 广西医科大学
专　业: 病原生物学
关键词: 钉螺细胞色素氧化酶1 系统进化树亲缘关系
分类号: R184
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的了解广西肋壳和光壳钉螺形态学及细胞色素氧化酶1 (Cytochrome Oxidase 1,CO1)基因的差异性,探讨广西钉螺与邻省钉螺的亲缘关系。方法采用单纯抽样法采集广西残存钉螺地区中的肋壳钉螺(横县)和光壳钉螺(罗城和靖西县)。使用放大镜和螺旋测微器,计数和测量3地钉螺的螺层数、壳高、壳宽、次螺层体长和外唇厚等参数。提取3地钉螺的基因组DNA,选取线粒体基因CO1作为分子标记,PCR扩增目的基因,采用双向测序法对PCR产物进行测序。采用ClustalX和DNASTAR软件对广西肋壳和光壳钉螺的CO1基因排序,比较广西两种基因序列的同源性。登录GenBank,选用云南大理、四川绵竹、湖南岳阳、湖北汉阳四地钉螺的CO1基因序列。采用ClustalX和DNASTAR软件对广西两种钉螺和邻省钉螺的CO1基因排序,比较上述基因序列的同源性。采用拟钉螺标准株CO1基因序列作为外源性参考基因,Kimura双参数法计算遗传距离,Mega3.1软件中非加权组平均法(UPGMA)、邻接法(NJ)和最小进化法(ME)构建系统发生树,比较广西两种钉螺与邻省钉螺的亲缘关系。结果广西罗城、靖西光壳钉螺和横县肋壳钉螺的螺层数(圈)分别为为5.65±0.33、5.49±0.40和5.58±0.48;壳宽(mm)分别为6.75±0.37、6.59±0.26和6.75±0.38;壳高(mm)分别为3.38±0.52、3.07±0.35和3.18±0.36;次螺层体长(mm)分别为1.40±0.22、1.50±0.19和1.43±0.27;外唇厚(mm)分别为0.51±0.13、0.56±0.14和0.50±0.19。广西靖西光壳钉螺与横县肋壳钉螺CO1基因的遗传距离为0.0505,同源性为95%;广西靖西光壳钉螺与罗城光壳钉螺CO1基因的遗传距离为0.0416,同源性为96%;广西横县肋壳钉螺与罗城光壳钉螺CO1基因的遗传距离为0.0154,同源性为98%。广西横县肋壳钉螺与湖南岳阳、湖北汉阳、四川绵竹、云南大理钉螺的遗传距离分别为0.0102、0.0171、0.1401和0.1421,CO1基因的同源性分别为99%、98%、87%和86%;广西靖西光壳钉螺与湖南岳阳、湖北汉阳、四川绵竹、云南大理钉螺的遗传距离分别为0.0451、0.0505、0.1382和0.1421,CO1基因的同源性分别为95%、95%和88%、87%;广西罗城光壳钉螺与湖南岳阳、湖北汉阳、四川绵竹、云南大理钉螺的遗传距离分别为0.0068、0.0154、0.1362和0.1421,CO1基因的同源性分别为99%、98%、88%和86%。结论广西光壳和肋壳钉螺的外形参数相似,CO1基因差异性较小,遗传距离较小,同源性较高,亲缘关系较近。广西肋壳和光壳两种钉螺与湖南、湖北钉螺遗传距离较小,同源性较高,亲缘关系较近。广西肋壳和光壳两种钉螺与四川、云南钉螺遗传距离较大,同源性较低,亲缘关系较远。

全文目录

摘要  4-6
ABSTRACT  6-9
英文缩略词  9-10
前言  10-12
材料与方法  12-20
结果  20-41
讨论  41-48
结论  48-49
参考文献  49-54
附录  54-93
综述: 湖北钉螺分类方法的研究进展  93-106
  参考文献  102-106
致谢  106-107
硕士期间发表的文章  107

广西肋壳钉螺和光壳钉螺与邻省钉螺亲缘关系研究

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