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桃果实成熟期基因的SSR标记与定位

作　者: 宋立琴
导　师: 张立彬；张吉军
学　校: 河北科技师范学院
专　业: 果树学
关键词: 桃 果实成熟期 SSR 分子标记 基因定位 BSA
分类号: S662.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 126次
引　用: 2次
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内容摘要


桃果实不耐贮运,成熟期成为影响桃供应期的重要因素。因此,定位控制桃果实成熟期的基因对桃分子标记辅助育种工作具有重要意义。本研究以我国北方主栽品种大久保桃的自交后代作为定位群体,通过集群分离分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA)对桃果实成熟期基因进行SSR标记定位研究,主要研究结果如下：1.对来自桃的165对SSR引物在早/晚熟等基因池间进行多态性引物的筛选,并对表现出差异的引物进一步在混池单株中进行扩增验证,获得差异表现较稳定的引物有3对,分别为：BPPCT015、UDP97-402和UDP96-003。2.用这3对多态性引物在100个随机后代中进行扩增,对扩增的基因型与果实成熟期表现型进行单标记方差分析,其中BPPCT015、UDP97-402、UDP96-003各自标记的不同基因型的成熟期之间差异均达到极显著水平。利用FsLinkageMap 2.0遗传作图软件绘制出这3个标记的连锁图,其相对排列顺序为：BPPCT015、UDP97-402和UDP96-003,相邻标记间的遗传距离分别为13.2cM和21.0 cM。参考已有的核果类分子遗传图,3个标记均位于第4号连锁群上。进一步利用FsQtlMap数量性状定位软件将控制桃果实成熟期的一个主效基因定位在BPPCT015和UDP97-402之间,其LOD值为13.35,遗传值为0.623。该位点单基因的效应值为15 d。3.将位于果实成熟期两侧的标记BPPCT015、UDP97-402在88个不同成熟期的桃品种中进行验证,发现所标记出的基因型与果实成熟期表现型之间有较好的对应关系,其中BPPCT015在果实发育期<75 d和>120 d的品种中符合度分别为82%、84%；UDP97-402在果实发育期<75 d和>120 d的品种中符合度分别为92%、47%。这说明标记BPPCT015对桃的早熟、晚熟性状具有较高的鉴别能力,UDP97-402对桃早熟性状具有高鉴别能力。本试验中桃成熟期的基因定位结果对桃成熟期分子标记辅助育种具有重要的应用价值。

全文目录


摘要  5-6
ABSTRACT  6-10
第一章 前言  10-21
  1.1 分子标记技术在桃上应用  10-18
    1.1.1 种质亲缘关系的演化鉴定  11-12
    1.1.2 种质资源的遗传多样性分析  12-13
    1.1.3 遗传连锁图谱构建  13-14
    1.1.4 基因定位研究  14-18
  1.2 桃果实成熟期研究进展  18-20
    1.2.1 桃果实成熟期遗传规律  18-19
    1.2.2 桃果实成熟期的分子标记研究  19-20
  1.3 本研究的目的及意义  20-21
第二章 材料与方法  21-27
  2.1 试验材料  21-23
    2.1.1 研究群体  21-23
    2.1.2 药品与试剂  23
  2.2 试验方法  23-27
    2.2.1 桃果实成熟期的标示与划分  23
    2.2.2 桃基因组DNA提取、纯化  23-24
    2.2.3 DNA完整性、浓度及纯度的检测  24
    2.2.4 早/晚熟基因池的构建  24
    2.2.5 SSR-PCR扩增体系及反应程序  24-25
    2.2.6 SSR-PCR反应产物的检测  25-26
    2.2.7 局部连锁图绘制及基因定位  26
    2.2.8 基因定位结果的验证  26-27
第三章 结果与分析  27-35
  3.1 大久保桃及其自交后代果实成熟期的分布  27
  3.2 试验材料果实发育期分布  27-28
  3.3 SSR分析  28-30
    3.3.1 基因组DNA的检测  28
    3.3.2 SSR引物在早/晚熟基因池中的筛选  28
    3.3.3 SSR引物在随机群体中扩增结果  28-30
  3.4 桃果实成熟期基因定位  30-32
    3.4.1 单标记方差分析  30-31
    3.4.2 局部连锁图的绘制  31
    3.4.3 基因定位  31-32
  3.5 BPPCT015、UDP97-402在大久保桃自交后代的扩增符合度分析  32-33
  3.6 BPPCT015、UDP97-402在88个不同成熟期品种中的验证  33-35
第四章 讨论  35-37
  4.1 研究数量性状筛选引物的方法  35
  4.2 本研究结果与前人研究结果的比较  35-36
  4.3 本研究结果在桃分子辅助育种实践中的应用前景  36-37
第五章 结论  37-38
参考文献  38-44
发表论文和参加科研情况  44-45
附录  45-49
缩略语  49-50
致谢  50

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 核果类 > 桃
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