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代谢调控因子PGC-1α和SIRT1基因多态性与2型糖尿病的关联研究
作 者: 朱疏影
导 师: 刘英
学 校: 中国协和医科大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 2型糖尿病 单核苷酸多态性 PGC-1α基因 SIRT1基因 基因-基因交互作用
分类号: R587.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
研究背景近二十年2型糖尿病(type 2 diabetes,T2D)患病率迅速增加,已成为全世界的主要健康问题之一。作为一种复杂性状疾病,其发生发展受遗传和环境因素共同作用。已有很多研究提示,过氧化物酶增殖激活物受体辅助激活因子1α(peroxisomeproliferators activated receptorγcoactivator-1,PGC-1α)和沉默信息调节子2同系物1(silent information regulations 2 homolog 1,SIRT1)是两个调控机体代谢的重要因子,在不同的组织中,它们通过各自独立的途径或者通过相互作用的方式参与许多重要代谢反应,与胰岛素抵抗和T2D关系密切。本研究应用以人群为基础的病例对照研究方法,以PGC-1α和SIRT1为候选基因,分析其基因多态性与中国汉族人群T2D遗传易感的关联性,并且进一步研究这两个基因对T2D的发生是否具有交互作用。研究方法以T2D患者和非糖尿病受试者为研究对象开展病例对照研究,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymorphism,PCR-RFLP)法检测PGC-1α和SIRT1基因的单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)。应用SPSS 11.5软件包分析数据。PHASE2.1构建单倍型。采用Haploview软件计算两个多态性位点间连锁不平衡系数(D’)和r~2值,用PS(Power and Sample Size Calculations Version 2.1.30)计算研究所能达到的统计学效力。以双侧P<0.05为具有统计学显著性差异。研究结果1.PGC-1α基因多态性与T2D的相关性本研究选择6个SNPs(rs131313226、rs7656250、rs2970856、rs8192678、rs3774923、rs3736265)在595例T2D病例组和495例非DM照组中进行基因分型。单位点分析没有发现与T2D关联的SNP。单倍型分析显示6个位点组成的单倍型H3(C-T-T-G-C-G)频率在T2D病例组与对照组中具有显著差异(8.1%vs.4.6%,P=0.001,OR=1.80,95%CI 1.24-2.63),P值经多重比较校正后仍具有统计学显著差异(Pc=0.007)。2.SIRT1基因多态性与T2D的相关性对SIRT1基因3个多态性位点rs3740051、rs1885472和rs4746720在589例T2D病例组和476例对照组中分型,其等位基因和基因型频率在T2D病例组和非DM对照组中均无显著差异。3位点组成的单倍型H3(A-C-T)在病例组的频率显著高于对照组(17.9%vs.13.8%,P=0.012,OR=1.36,95%CI 1.06-1.73)。经Bonferroni多重比较校正后单倍型H3在两组中的频率仍具有显著性差异(Pc=0.048)。临床表型分析显示携带单倍型H3的受试者BMI和空腹甘油三脂水平显著低于其它单倍型携带者。3.PGC-1α和SIRT1基因多态性与T2D相关性的交互作用用多因子降维法(MDR)、logistic回归和单纯病例分析三种方法均没有检测到有统计学意义的交互作用。研究结论本研究结果提示PGC-1α基因单倍型C-T-T-G-C-G和SIRT1基因单倍型A-C-T可能是中国汉族人群T2D发生的危险因素。两基因对T2D的发病风险不存在明显的交互作用。
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全文目录
中文摘要 4-6 英文摘要 6-8 一.前言 8-14 二.研究目的和对象 14-16 1.研究设计 14 2.研究目的 14 3.研究对象 14-16 三.实验内容和技术路线 16-17 1.实验内容 16 2.技术路线 16-17 四.实验方法 17-26 1.实验材料 17-18 2.基因组DNA提取 18-19 3.基因多态性检测 19-26 五.统计学分析 26-27 六.研究结果 27-43 1.PGC-1α基因多态性与T2D的相关性 27-34 2.SIRT1基因多态性与T2D的相关性 34-40 3.PGC-1α基因与SIRT1基因的交互作用 40-43 七.讨论 43-51 1.结果小结 43 2.PGC-1α基因多态性与T2D 43-45 3.SIRT1基因与T2D的关联 45-47 4.PGC-1α基因与SIRT1基因的交互作用 47-48 5.环境因素对研究T2D遗传易感性的影响 48-49 6.研究意义 49 7.存在的问题 49-51 参考文献 51-57 文献综述 57-64 参考文献 64-67 英文名词及缩写 67-69 致谢 69-70
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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 胰岛疾病 > 糖尿病
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