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运用细胞和多种分子遗传学技术行丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症病人的诊断

作　者: 周明星
导　师: 邬玲仟
学　校: 中南大学
专　业: 遗传学
关键词: 丙二酸辅酶A脱羧酶丙二酸尿 MLYCD 代谢异常性脑病错义突变复合杂合缺失 RT-PCR 基因芯片 MLPA
分类号: R596
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

背景：丙二酰辅酶A脱羧酶(Malonyl Coenzyme A decarboxylase, MCD)缺乏症(OMIM 248360)是极其罕见的常染色体隐性遗传代谢性疾病,亦称丙二酸尿症(malonic aciduria)。1984年Brown首报了该疾病,1999年K.A.Sacksteder, D.R.FitzPatrick, Jim Gao三人分别克隆了导致MCD缺乏症的MLYCD基因,迄今为止,全世界共报导32例病例包括23种不同的基因突变(见附表1),其临床表现多变：常见有中枢神经系统异常如儿童早期智障,发育迟缓,癫痫,张力减退,脑部器质性病变；腹泻,呕吐,肥厚型心肌病等,甚至导致新生儿死亡。其他少见症状有身材矮小,嗜睡,厌食,胃肠炎,听力障碍,面容畸形等。实验室检查常见尿有机酸代谢异常(如丙二酰尿,甲基丙二酰尿),低血糖,代谢性酸中毒,酮症酸中毒,乳酸血症等。国内暂无该疾病的研究报导。目的：运用细胞和多种分子遗传学方法对1例丙二酰辅酶A脱羧酶(MCD)缺乏症患者及其家系进行研究,为患者及其家庭提供准确的诊断和遗传咨询,为临床上MCD缺乏患者的基因诊断提供指导。方法：①对患者行尿有机酸代谢筛查；②对患者行常规细胞遗传学分析；③对患者及其父母外周血和患者皮肤gDNA的MLYCD基因的5个外显子及其侧翼序列行PCR扩增并测序；④对患者及其父母外周血和患者皮肤cDNA的MLYCD基因行PCR扩增并测序；⑤对患者外周血gDNA行全基因组拷贝数基因芯片检测；⑥对患者及其父母外周血gDNA的MLYCD基因行MLPA检测；⑦对50个无关个体的外周血gDNA针对发现的MLYCD基因的新错义突变位点行PCR扩增并测序；结果：1、患者尿有机酸代谢筛查结果：09年8月24日发现尿丙二酸增高；09年9月24日复查示尿丙二酸更增高,甲基丙二酸轻度增高；2、患者外周血淋巴细胞染色体G带、高分辨核型发现550-850条带阶段无异常。3、gDNA的MLYCD基因测序,患者存在c.920T>G(p. Leu307Arg)杂合错义突变,父亲存在杂合错义突变c.920T>G(p. Leu307Arg)和杂合同义SNP(c.732G>A;p. ser266ser),母亲存在杂合错义SNP(c.776G> C;p. Gly259A1a);4、cDNA的MLYCD基因测序,患者存在纯合父源错义突变c.920T>G(p. Leu307Arg),母亲存在纯合错义SNP(c.776G>C;p. Gly259Ala),父亲存在杂合错义突变c.920T>G(p. Leu307Arg)和杂合同义SNP(c.732G>A;p. ser266ser);5、基因芯片显示患者没有微缺失微重复异常；6、MLPA技术示患者及母亲gDNA的MLYCD基因皆存在Exonl杂合缺失,父亲正常。7、新错义突变在50个无关个体中未有发现。且通过与其他物种行序列同源比对(包括人,猩猩,牛,大鼠,小鼠),发现该错义突变位点皆为保守T。结论：1.患者父源MLYCD基因存在c.920T>G(p. Leu307Arg),为文献未报导的新突变,该新突变位点在不同物种中皆保守。2.患者母源MLYCD基因存在Exon 1缺失,且该链MLYCD基因不表达。3.确诊患者为MLYCD基因复合杂合突变,导致丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症。其父母确诊为MCD杂合子,再生育时必须行产前诊断。

全文目录

中文摘要  4-7
英文摘要  7-12
缩略词简表  12-13
实验仪器及所用试剂  13-18
前言  18-20
一、研究对象  20-21
二、研究方法  21-35
三、实验结果分析  35-50
四、讨论  50-52
五、结论  52-53
参考文献  53-55
综述  55-79
致谢  79

运用细胞和多种分子遗传学技术行丙二酰辅酶A脱羧酶缺乏症病人的诊断

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