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野生哺乳动物寄生线虫的分类学和派氏异尖线虫群体遗传结构分析
作 者: 明珠
导 师: 张路平
学 校: 河北师范大学
专 业: 动物学
关键词: 哺乳动物 线虫 分类 新种 派氏异尖线虫 群体遗传结构 变性梯度凝胶电泳
分类号: Q953
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 46次
引 用: 1次
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内容摘要
本论文实验包括两个部分,第一部分利用光镜和扫描电镜(SEM)技术对几种野生哺乳动物寄生线虫进行了分类鉴定,共描述线虫3种,包括1新种和2新记录种;第二部分基于线粒体DNA(mtDNA)细胞色素c氧化酶第I亚基基因部分序列(pcox1)及烟酰胺脱氢酶(NADH)第I亚基基因部分序列(pnad1),首次应用聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)的方法对黄海海域鱼类寄生派氏异尖线虫Anisakis pegreffii群体遗传结构进行了分析。主要结果如下:1.几种野生哺乳动物寄生线虫的分类学研究天津锥尾线虫,新种Subulura (Murisubulura) tanjinensis sp. nov.采自天津蓟县五道眉老鼠Eutamias sibiricus的肠道内,隶属于蛔目Ascaridida,锥尾科Subuluridae。该新种与鼠锥尾亚属Murisubulura其它种相比较,其唇叶结构、副引带存在与否以及尾乳突的数目均与本亚属其它种有明显区别,因此定名为一新种。长颈鹿小单齿线虫Monodontella giraffae Yorke et Maplestone, 1926采自天津动物园长颈鹿Giraffa camelopardalis肝胆管内,隶属于圆线目Strongylata ,钩口科Ancylostomidae。本次所采标本主要特征与原始描述基本相同,但通过扫描电镜首次观察到该种线虫具有窄的侧翼,并对交合刺和生殖锥的详细结构进行了描述;同时对小单齿属Monodontella的分类地位进行了讨论。该种线虫在我国为首次报道,为我国新记录种。凯氏原圆线虫Protostrongylus (Pulmostrongylus) kamenskyi Schulz, 1930采自新疆雪兔Lepus timidus Linnaeus肺内,隶属于圆线目Strongylata,原圆科Protostrongylidae。本实验首次观察到凯氏原圆线虫P. (P.) kamenskyi镰刀形角质化副引带结构,补充了Schulz(1930)的原始描述。该种线虫在我国为首次报道,为我国新记录种。2.黄海鱼类派氏异尖线虫群体遗传结构分析首次利用PCR-DGGE结合序列分析的方法对黄海鱼类派氏异尖线虫A. pegreffii1433个样品的pcox1和pnad1进行了分析,共涉及19个种群(Ga, Ar, Ch, Ha, De, La, Mu, Lu, Au, Ze, Cl, Ps, Tr, Sa, Co, Pn, Lo, Clu, Sc),得到14种单倍型(Hap1-14)。mtDNA pcox1区序列长均为384bp,共有13个多态位点,其中1处颠换和12处转换。相应的pnad1区序列长均为357bp,有9个多态位点,其中2处颠换和7处转换。所有种群共享的Hap1和2个体数量最多(>80%),表明各种群间具有高水平基因交流。利用MEGA4.1软件的邻接法(Neighbor-Joining)聚类分析显示,Hap13单独形成1支,而其它13种单倍型又明显聚类为2支:一支包括Hap2,3,4,5,7,8,9,10,14;另一支包括Hap1,6,11,12。Arlequin3.1软件计算显示19个种群核苷酸组成基本一致(G+C<A+T)。分子方差分析(AMOVA)计算派氏异尖线虫A. pegreffii种群间的遗传分化系数Fst = 0.00904(P<0.05),种群内个体间遗传变异明显大于种群间遗传变异,说明黄海派氏异尖线虫种群内部遗传多态性较高。Ga与Au, Ps;Mu与Au, Ps的遗传分化系数Fst值在0.16369-0.20464之间,并且Fst的P检验都表现显著差异(P<0.05),表明Ga与Au, Ps;Mu与Au, Ps的遗传分化程度较高。大部分种群间的遗传分化系数处于0-0.15之间,表明这些种群间仅有较弱或中等程度的分化。还有一些种群间遗传分化系数为负数,并且Fst的P检验没有出现显著差异(P>0.05),表明这些种群间没有遗传分化。总体结果表明,黄海派氏异尖线虫19个种群之间遗传分化程度不高,可推断出黄海派氏异尖线虫不存在宿主特异性。
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中图分类: > 生物科学 > 动物学 > 动物遗传学
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