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昆明市甲状腺患者与猪群输血传播病毒的分子流行病学研究
作 者: 刘畅
导 师: 井申荣
学 校: 昆明理工大学
专 业: 微生物学
关键词: 输血传播病毒 甲状腺 流行率 基因分型
分类号: R581
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
输血传播病毒是在1997年用RDA (Representational differencr analysis)方法对一名58岁的日本输血患者进行血清检测时,发现这种非甲乙丙丁戊型的未知肝炎,后来用病人名字命名为TTV (Torque teno virus),又称为辛型病毒。在全世界人口中正是由于它的基因组有高度异质性和多样性,在人和动物中流行率各不相同,目前国内进展中缺乏更多地区对人类输血传播病毒型别和流行率的研究数据报道,在其他物种上是否存在此病毒等工作做的不够,体内和体外的实验进展缓慢。本研究通过对昆明市甲状腺病人和猪群的输血传播病毒的流行病学和基因型别进行调查,评价分析本市这种病毒在特定疾病和其他物种中的流行率和基因类型情况。对于人输血传播病毒,提取甲状腺患者血清(包括甲状腺功能正常组、抗体指标升高组和甲亢组)中的病毒基因组,然后通过巢式PCR方式扩增目的基因片段。结果发现青年人感染率(7.69%)低于中老年人的感染率(21.66%),男性的流行率(20.14%)高于女性(10.56%),易感基因集中在基因1群中的G1型(17.8%)、G2型(44.4%)和G3型(15.6%)以及混合型感染(22.2%),未发现常见的G4型和G5型等其他类型。其中G2型的比例最大,混合感染的比例次之。病例显示中未发现某种疾病伴随着特定基因型或基因亚型。至于猪群的研究,对本市城区和郊县的屠宰场健康以及发病猪群的血清、粪便和组织等提取病毒基因组,同样用巢式PCR的方式扩增目的基因片段。结果显示已知的1型(5.5%)和2型(12%)的检出率都非常低,进一步发现幼猪的感染率明显低于成年猪群,在性别上无明显特点,不存在某种特定基因型感染。本研究结果证明了昆明市特定人群和猪群中存在此病毒感染,对于初步掌握昆明市特定人群和猪群的输血传播病毒流行病学和基因分型提供参考依据。
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全文目录
摘要 4-5 ABSTRACT 5-9 插图和附表清单 9-10 缩略语索引 10-11 第一章 绪论 11-23 1.1 输血传播病毒 11 1.2 输血传播病毒特征 11-14 1.2.1 人输血传播病毒基因组 12-13 1.2.2 人输血传播病毒序列变异性 13-14 1.3 人输血传播病毒鉴定和分型方法 14-15 1.4 人输血传播病毒流行率 15-17 1.4.1 亚洲地区的人类输血传播病毒基因型 15-16 1.4.2 美洲、欧洲等地区的人输血传播病毒基因型 16-17 1.5 人输血传播病毒传播途径 17 1.6 人输血传播病毒和疾病的关系 17-18 1.7 人输血传播病毒细胞嗜性 18-19 1.8 猪输血传播病毒基因组结构 19-20 1.9 猪输血传播病毒基因分型 20 1.10 猪输血传播病毒流行率 20-21 1.11 猪输血传播病毒传播途径 21 1.13 本研究的目的意义 21-23 第二章 人输血传播病毒UTR和N22基因扩增和序列分析 23-47 2.1 材料和方法 23-32 2.1.1 材料 23-25 2.1.2 实验方法 25-32 2.2 实验结果 32-42 2.2.1 人输血传播病毒UTR和N22区域巢式PCR结果 32-34 2.2.2 重组质粒UTR-PCR2.1和N22--PCR2.1酶切鉴定 34-35 2.2.3 测序结果 35-36 2.2.4 流行率和基因型别统计结果 36-42 2.3 讨论 42-46 2.4 小结 46-47 第三章 猪输血传播病毒1型和2型基因扩增和序列分析 47-60 3.1 材料和方法 47-53 3.1.1 材料 47-49 3.1.2 实验方法 49-53 3.2 实验结果 53-55 3.2.1 昆明市猪群输血传播病毒1型和2型PCR扩增情况 53-54 3.2.2 昆明地区猪群输血传播病毒类型分布情况 54-55 3.3 目前报道的猪输血传播病毒全长序列建立进化树 55-56 3.4 昆明市猪群输血传播病毒1型和2型的序列建立进化树 56-57 3.5 讨论 57-59 3.6 小结 59-60 第四章 全文总结 60-61 第五章 展望 61-62 致谢 62-63 参考文献 63-67 附录A 67
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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 甲状腺疾病
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