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橙色珍贵束丝放线菌发酵生产抗癌药物安丝菌素P-3的研究

作　者: 林锦霞
导　师: 钟建江
学　校: 华东理工大学
专　业: 生物化工
关键词: 安丝菌素P-3(AP-3) 发酵工程铵离子异丁醇橙色珍贵束丝放线菌
分类号: R915
类　型: 博士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

美登醇是一类具有良好抗癌活性的大环内酯类化合物,在美国已进入二期临床。安丝菌素是由橙色珍贵束丝放线菌(Actinosynnema pretiosum)合成的美登醇类抗癌药物,其中安丝菌素P-3(AP-3)的活性最为显著。由于其重要的药理活性,近年来安丝菌素成为国内外研究的一个热点。尽管关于菌种筛选、培养基优化及途径调控以提高AP-3产量有一些报道,目前的低生产率及高生产成本仍然是制约其产业化的瓶颈之一。至今关于环境因子对AP-3的积累过程及其生物合成基因表达等的影响尚缺乏深入研究,了解和掌握相关信息对生产实践中有效提高其产量具有重要意义。本研究首先采用文献报道的培养基进行AP-3的发酵试验,结果表明其产量很低,仅1-2 mgL-1。通过应用Plackett-Burman设计和折叠Plackett-Burman设计进行发酵筛选,得到一组AP-3产量为12.9 mgL-1的培养基,并从单因素实验观察到异丁醇和铵离子对AP-3产量分别具有正效应和负效应。进一步应用中心组合设计及响应面分析,优化得到AP-3的发酵培养基为(gL-1)：葡萄糖5、甘油40、酵母提取物10、玉米滤液20、碳酸钙5、磷酸氢二钾0.5、七水合硫酸亚铁0.002、异丁醇3。在上述发酵培养基的基础上,采用转速220 rpm,装液量60 mL/250 mL,接种量1.64×109CFUL-1的发酵条件,培养96h获得AP-3产量为68.2 mgL-1,生产率达17.1 mgL-ld-1,该生产率高于至今文献报道的水平。并且,基于摇瓶发酵的初始KLα,在实验室小型规模进行了放大探索,在3-L反应器、96h获得AP-3产量为52 mgL-1。在上述培养基优化过程中观察到铵离子的去除能提高AP-3产量,但铵离子作为常用氮源及含氮物质的中间代谢物,往往在发酵过程中积累；因此,结合抗生素的生物合成途径并从蛋白质组学的角度研究其影响机制可为铵离子抑制的解除、后续培养基选择及代谢途径改造等提供重要信息。由此,对添加(37 mM)和不添加铵离子的发酵过程进行了分析,结果表明铵离子抑制菌体生长速度,促进胞外异丁酸的代谢。从酶活性的检测数据观察到铵离子在整个发酵过程中提高缬氨酸代谢的第一个酶缬氨酸脱氢酶的活性,而不像其它抗生素发酵体系中报道的抑制作用。转录分析表明大部分AP-3生物合成基因的转录水平受铵离子抑制,与产量变化一致。进一步应用双向电泳考察蛋白质组的响应,在pH3-5.6且PAGE浓度为13.5%的双向电泳条件下获得约1600个蛋白质点,质谱鉴定得到12个差异表达1.5倍以上的蛋白质,包括3-磷酸-甘油醛脱氢酶(下调2倍)、脂肪酸合成酶(上调1.7倍)、及负责丝氨酸生物合成的3-磷酸甘油酸脱氢酶(上调3.9倍)等。这些结果显示铵离子影响脂肪酸和丝氨酸的生物合成,并调节AP-3生物合成基因的转录水平。已有文献表明异丁醇可作为AP-3的侧链异丁酰-辅酶A的前体,我们的实验也表明添加异丁醇可有效提高AP-3的产量,因此,本学位论文结合异丁醇的代谢及AP-3的生物合成途径又探索了其影响机制。首先考察了异丁醇添加条件对AP-3产量的影响,结果表明在第0h添加36 mM的异丁醇效果最显著,与不添加相比,发酵96h的AP-3产量提高了3.4倍。分析胞内辅酶A的积累动态,观察到添加异丁醇可以促进乙酰-辅酶A和丙二酰-辅酶A的积累,暗示异丁醇影响其它延伸单元的供应。对酶活性检测表明异丁醇分别在对数期和产素期提高异丁醇脱氢酶和缬氨酸脱氢酶的酶活性近2倍,且于36h组合添加缬氨酸可提高AP-3产量35%(82.3 mgL-1)。同时对AP-3生物合成途径及异丁酰-辅酶A代谢途径的基因转录分析,观察到其表达水平与抗生素的产量变化一致,其中AP-3侧链添加的基因asml9、调节基因asm40及异丁酰-辅酶A变构酶基因及甲基丙二酸半醛脱氢酶基因的转录水平在异丁醇条件下显著上调,后者暗示异丁醇可能改变异丁酰-辅酶A的代谢分布。进一步对蛋白质组研究表明,在异丁醇存在时,与细胞氧化还原状态相关的过氧化氢酶及LysR调节因子的蛋白表达水平均上调。此外,为进一步研究asml9和asm40对异丁醇的响应,对其基因工程菌株进行了发酵,观察到asml9的高表达可耐受更高浓度的异丁醇；asm40的基因缺失菌株在不添加异丁醇时其产量与野生型无显著差别,但添加异丁醇的AP-3产量则提高了20%,表明异丁醇的添加与asm40转录水平的激活具有相似的效应。上述结果表明异丁醇促进AP-3生物合成前体CoA的供应,并影响氧化还原相关的基因和蛋白的表达水平。本研究通过对环境因子的考察,发现铵离子影响脂肪酸及丝氨酸生物合成途径并抑制AP-3生物合成基因的转录水平；异丁醇不但促进AP-3前体CoA的供应,还影响与胞内氧化还原水平相关的基因转录及蛋白质表达。这些信息不但为AP-3发酵操作及其生物合成途径的改造提供了有益信息,还可为其它大环内酯类抗生素的发酵提供借鉴。

全文目录

摘要  5-7
Abstract  7-12
本论文常用英文缩略语说明  12-13
第一章绪论  13-26
  1.1 抗生素的发酵生产  13-20
    1.1.1 发酵培养基的组成与优化  13-18
    1.1.2 发酵过程的控制  18-20
  1.2 安丝菌素  20-24
    1.2.1 生物活性  20-21
    1.2.2 生物合成途径  21-23
    1.2.3 安丝菌素P-3的发酵  23-24
  1.3 立题意义  24-25
  1.4 主要研究内容  25-26
第二章安丝菌素P-3发酵条件的考察  26-43
  2.1 前言  26
  2.2 材料与方法  26-29
  2.3 结果与讨论  29-41
    2.3.1 发酵条件对AP-3产量的影响  29-39
    2.3.2 实验室规模反应器发酵生产AP-3  39-41
  2.4 小结  41-43
第三章铵离子对安丝菌素P-3生物合成的影响  43-68
  3.1 前言  43
  3.2 材料与方法  43-52
  3.3 结果与讨论  52-67
    3.3.1 铵离子对AP-3产量的影响  52-55
    3.3.2 铵离子对酶活性的影响  55-57
    3.3.3 铵离子对AP-3生物合成基因转录水平的影响  57-59
    3.3.4 铵离子对蛋白质组表达的影响  59-67
  3.4 小结  67-68
第四章异丁醇添加对安丝菌素P-3生物合成的影响  68-94
  4.1 前言  68-69
  4.2 材料与方法  69-72
  4.3 结果与讨论  72-92
    4.3.1 异丁醇对AP-3产量的影响  73-77
    4.3.2 异丁醇对代谢物积累的影响  77-79
    4.3.3 异丁醇对酶活性的影响  79-80
    4.3.4 组合添加缬氨酸提高AP-3产量  80-81
    4.3.5 异丁醇对其代谢途径及AP-3生物合成基因转录水平的影响  81-86
    4.3.6 异丁醇对蛋白质组表达的影响  86-89
    4.3.7 AP-3生物合成基因的突变株对异丁醇的响应  89-92
  4.4 小结  92-94
第五章结论与展望  94-96
  5.1 结论  94-95
  5.2 展望  95-96
参考文献  96-108
致谢  108-109
附录  109-118
攻读博士期间撰写的论文及专利  118

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