学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

MicroRNA在鼻咽癌中的表达研究

作　者: 李婷
导　师: 李瑶
学　校: 复旦大学
专　业: 遗传学
关键词: microRNA 鼻咽癌表达谱芯片差异表达聚类分析
分类号: R739.63
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 92次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

microRNA是最近研究发现的一类长度约为19～25个核苷酸的非编码单链小RNA分子,其通过与靶基因的3’端非翻译区互补配对结合的方法,从而调控内源基因的表达。miRNA作为生物体生长发育的重要调控基因,其主要研究方向是探明miRNAs与疾病的关系,尤其是miRNA与肿瘤的关系。虽然近年来对miRNA的研究越来越广泛,但多集中于肺癌、前列腺癌、乳腺癌、结肠直肠癌等较为常见和广泛的癌症。因为鼻咽癌的地区分布极不平衡,具有明显的种族聚集性和地域性,因此目前国外对其的研究还不是很深入。鼻咽癌是一种上皮源性恶性肿瘤,绝大多数属于低分化鳞状细胞癌,恶性程度高,早期易发生淋巴结和全身远处转移,具有相当高的死亡率。据世界卫生组织估计,鼻咽癌80%发生于中国,尤其高发于中国广西及广东地区。因此我们意在探索性的研究miRNA在鼻咽癌发生发展中的调控作用。我们利用Illumina microRNA表达谱芯片,对8例鼻咽咽癌组织样本和4例正常组织样本进行了miRNA表达谱分析。运用Illumina BeadStudio软件读取芯片数据,完成芯片数据归一化及筛选修补处理后,利用SAM软件及Cluster软件进行差异基因分析及聚类分析。我们筛选出了41条在鼻咽癌组织和正常组织中差异表达的miRNA,其中包括6条上调基因(miR-135b, miR-18a, miR-106b等)和35条下调基因(miR-34b, miR-34c, miR-10b, let-7, miR-449, miR-497等)。为了验证芯片结果的可靠性,我们应用定量RT-PCR的方法检测了差异表达基因miR-34、let-7g以及非差异表达基因miR-30c的表达情况,RT-PCR结果与芯片结果吻合。同时,我们还发现这些差异表达miRNA的聚类结果能够较好的与病人的临床分期联系起来。我们通过Targetscan数据库,对差异表达miRNA的靶基因进行预测,并将预测结果输入GenMAPP软件进行生物学通路分析。在通路分析中,大部分靶基因富集度高的通路都涉及到信号转导及与癌症发生相关的通路,例如EGFR-1信号通路,MAPK信号通路等等。其中,小GTP酶介导的信号转导通路最为显著。同时,Wnt信号通路的显著性,则与我们实验室过去在鼻咽癌cDNA表达谱的研究结果相吻合。继续深入研究这些差异miRNA在生物学通路中的调控作用,以及寻找与鼻咽癌发生发展进程相关的临床诊断标记物,则是我们未来的努力的方向。

全文目录

中文摘要  4-5
英文摘要  5-7
英文缩略词  7-8
第一节前言  8-28
  1. 基因芯片  8-15
  2. microRNA  15-22
  3. 鼻咽癌  22-27
  4. 本研究所要解决的问题  27-28
第二节材料与方法  28-34
  1. 材料与试剂  28-29
  2. 病人资料  29
  3. 实验方法  29-34
第三节结果与讨论  34-59
  1. 鼻咽癌组织和正常组织总RNA提取及质量鉴定结果  34
  2. 鼻咽癌microRNA表达谱芯片扫描  34-36
  3. 鼻咽癌组织的差异基因筛选  36-45
  4. 荧光定量RT-PCR验证鼻咽癌Vs正常组织中的差异基因  45-48
  5. 鼻咽癌样本非监督聚类分析  48-50
  6. 差异microRNA的靶基因预测分析  50-59
第四节总结  59-60
参考文献  60-64
攻读硕士学位期间发表的论文  64-65
致谢  65-66

MicroRNA在鼻咽癌中的表达研究

内容摘要

全文目录

相似论文