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甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究

作　者: 安添午
导　师: 刘孟洲
学　校: 甘肃农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 微卫星遗传标记遗传多样性猪
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
下　载: 39次
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内容摘要

采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的9对微卫星引物,检测了甘肃省7个猪品种(系):地方猪种合作猪、培育品系华特A系和B系及四个外引品种杜洛克、长白、大约克夏和皮特兰,共计273个样品的基因型。通过计算等位基因频率、遗传杂合度、多态信息含量、奈氏标准遗传距离,分析品种(系)内和品种(系)间的遗传变异。采用邻近结合法及非加权组对算术平均法,进行聚类分析。以期从分子水平来揭示现阶段甘肃省猪种资源的丰富度和遗传差异,从而为甘肃猪种资源的保护、开发利用、科学选育和合理杂交等提供理论依据。结果表明:1.在9个微卫星座位中,所有位点共检测到131个等位基因,每个位点有8个以上等位基因,说明9个微卫星位点都具有较高的多态性。2.7个甘肃省猪品种(系)的9个位点的平均杂合度都较高,在0.7427～0.8109之间,皮特兰最小,大约克夏最大。平均多态信息含量(PIC)在0.6820～0.7807之间,均表现为高度多态,说明群体内变异性大。对于外引品种而言选育的潜力大,而对于华特A系、B系与合作猪而言,已经导入外源基因,需要近一步纯化基因。皮特兰猪由于在甘肃省数量较少,遗传基础较窄,所以杂合度相对较低。3.7个甘肃省猪品种(系)间的DA遗传距离和DS遗传距离得到了一致的结果:华特B系与大约克夏遗传距离较小,合作猪与其他6个猪品种(系)间的遗传距离较大。4.根据奈氏遗传距离及奈氏标准遗传距离,绘制了甘肃省7品种(系)猪的UPGMA及NJ聚类图,结果显示:两个国外品种大约克和杜洛克聚为一类,引进品种长白和培育品系华特B系聚为一类,地方品种合作猪另成一类。两种方法的聚类一致。在奈氏遗传距离绘制的UPGMA聚类图中,华特A系单独聚为一类,皮特兰和大约克夏、杜洛克、华特B系和长白聚为一类。5.甘肃省猪种资源已引入了一定程度的外源基因,基因的纯化和遗传多样性保护已受到严重威胁。

全文目录

摘要  4-5
Summary  5-8
第一部分文献综述  8-28
  1 甘肃省猪种资源介绍  8-14
    1.1 外引品种  9-11
    1.2 培育品种（系）  11-12
    1.3 地方品种  12-14
  2 畜禽遗传多样性  14-23
    2.1 遗传多样性概述及其意义  14-15
    2.2 畜禽遗传多样性的现状  15-17
    2.3 保种理论与方法研究  17-19
    2.4 家畜遗传多样性的评估方法  19-23
  3 微卫星标记在动物遗传资源多样性评估中的研究与应用  23-28
    3.1 微卫星标记的概念及其类型  23-24
    3.2 微卫星的形成机制  24
    3.3 微卫星的功能与作用  24
    3.4 微卫星的特点  24-26
    3.5 微卫星在畜禽群体遗传结构和遗传多样性方面的研究进展  26-28
第二部分试验研究  28-53
  1 研究目的、意义及创新  28
  2 试验材料  28-31
    2.1 材料来源  28
    2.2 样品的采集  28
    2.3 主要仪器及设备  28-29
    2.4 主要工具酶和试剂  29
    2.5 常规试剂的配制  29-31
  3 试验方法  31-34
    3.1 基因组DNA 的提取及检测  31
    3.2 基因组DNA 的PCR 扩增  31-33
    3.3 电泳分离基因型  33-34
  4 统计分析  34-36
    4.1 统计软件  34
    4.2 等位基因频率  34
    4.3 杂合度  34-35
    4.4 多态信息含量  35
    4.5 Nei 氏标准遗传距离  35
    4.6 聚类分析  35-36
  5 结果与分析  36-45
    5.1 DNA 提取结果的琼脂糖检测  36
    5.2 PCR 扩增产物的检测结果  36-37
    5.3 PCR 扩增产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱  37
    5.4 微卫星多态位点的等位基因及其频率  37-41
    5.5 杂合度（H）和多态信息含量（PIC）  41-42
    5.6 各品种（系）间的遗传距离及聚类结果  42-45
  6 讨论  45-52
    6.1 样本含量  45-46
    6.2 微卫星位点数目的选择  46
    6.3 基因组DNA 的提取  46-47
    6.4 PCR 影响因素分析及其条件优化  47-49
    6.5 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳  49-50
    6.6 带型的判别  50
    6.7 品种遗传多态性、遗传距离、聚类分析和选育背景的关系  50-52
  7 结论  52-53
致谢  53-54
参考文献  54-58
作者简介  58-59
导师简介  59-60

甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究

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