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大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)抗甲霜灵菌株生物学特性及AFLP分析
作 者: 国莉玲
导 师: 左豫虎
学 校: 黑龙江八一农垦大学
专 业: 植物病理学
关键词: 大豆疫霉菌 抗甲霜灵菌株 生物学特性 AFLP 多态性 SCAR
分类号: S435.651
类 型: 硕士论文
年 份: 2014年
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内容摘要
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本研究以大豆疫霉野生菌株Pmg1为亲本,采用药剂驯化法获得抗甲霜灵菌株。初步研究抗药菌株的抗性水平、抗性的稳定性、菌落生长速率、菌落形态、游动孢子囊和卵孢子产生能力等生物学特性,并利用光学显微镜观察其菌丝、游动孢子囊和卵孢子的形态。应用64对引物组合对筛选到的抗药菌株及其野生亲本的基因组DNA进行AFLP分析。取得以下研究结果:1.获得5株抗甲霜灵菌株Pmg1-Mtr1、Pmg1-Mtr2、Pmg1-Mtr3、Pmg1-Mtr4、Pmg1-Mtr5,抗性水平在野生亲本的3793.7-5773.9倍之间。2.抗药菌株的抗药性可在菌丝阶段稳定遗传;抗性菌株的第一代、第二代、第三代游动孢子单孢株仍具有不同程度的抗性。3.与野生菌株Pmg1相比,抗药菌株的菌落生长速率有明显降低;菌丝、游动孢子囊和卵孢子在形态上与野生菌株相比没有明显变化,但抗药菌株游动孢子囊和卵孢子的产量有显著降低。4. AFLP分析共获得1087条条带,其中328条具有多态性,多态性百分比为30.17%,遗传相似系数为82%。差异片段E2M18152的延长序列与致病疫霉T30-4果糖二磷酸醛缩酶mRNA编码区序列的同源性为93%。5.根据3个较长差异片段的序列设计3对SCAR特异引物,并未在抗药菌株和野生亲本间扩增到具有长度多态性的片段,故没有成功地将AFLP标记转化为SCAR标记,但通过序列比对发现抗药菌株和野生亲本之间存在不同单碱基。以上研究结果表明,大豆疫霉菌对甲霜灵容易产生抗性,抗药菌株在菌丝阶段抗药性的保持对甲霜灵没有表现依赖性,且可在游动孢子后代遗传。抗药菌株除抗药性提高、游动孢子囊和卵孢子产生能力下降外,其它生物学性状没有发生显著变化。抗药菌株在分子水平上确实发生了变化,导致了多态性条带的出现,且抗药菌株与野生亲本在DNA水平上的差异在整个基因组上的分布是随机的,而这些差异可能与菌株抗性的形成有关。
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全文目录
摘要 4-6 Abstract 6-8 目录 8-11 第一章 文献综述 11-32 1.1 大豆疫霉根腐病 11-16 1.1.1 大豆疫霉病概述 11-14 1.1.2 大豆疫霉菌的遗传变异研究进展 14-16 1.2 卵菌抗药性研究进展 16-21 1.3 分子标记技术概述 21-30 1.3.1 限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP) 22-23 1.3.2 随机扩增多态性 DNA 技术(RAPD) 23 1.3.3 简单序列重复(SSR) 23-24 1.3.4 单核苷酸多态性(SNP) 24 1.3.5 特异性序列扩增(SCAR) 24-25 1.3.6 扩增片段长度多态性(AFLP) 25-30 1.4 研究的内容和目的意义 30-32 1.4.1 研究内容 30 1.4.2 目的和意义 30-32 第二章 大豆疫霉菌抗甲霜灵菌株的筛选及部分生物学特性研究 32-44 2.1 材料与方法 32-35 2.1.1 供试菌株 32-33 2.1.2 试剂 33 2.1.3 培养基 33 2.1.4 仪器 33 2.1.5 野生菌株对甲霜灵的敏感性测定 33 2.1.6 抗甲霜灵菌株的诱导筛选 33 2.1.7 抗甲霜灵菌株的抗性水平测定 33-34 2.1.8 抗药菌株的抗药性稳定性检测 34 2.1.9 大豆疫霉抗性菌株对甲霜灵抗性在游动孢子后代的遗传 34 2.1.10 抗药菌株的生长速率及菌落、菌丝形态 34-35 2.1.11 游动孢子囊、卵孢子产生能力和形态观察 35 2.2 结果与分析 35-42 2.2.1 野生型菌株对甲霜灵的敏感性测定 35-36 2.2.2 抗甲霜灵菌株的诱导 36 2.2.3 抗甲霜灵菌株的抗性水平测定 36-37 2.2.4 抗药菌株的稳定性检测 37-39 2.2.5 大豆疫霉抗药菌株对甲霜灵抗性在游动孢子后代的遗传 39-40 2.2.6 抗药菌株的生长速率及菌落、菌丝形态 40-41 2.2.7 游动孢子囊、卵孢子产生能力和形态观察 41-42 2.3 讨论 42-44 第三章 大豆疫霉菌抗甲霜灵突变菌株的 AFLP 分析 44-68 3.1 材料与方法 44-46 3.1.1 供试菌株 44 3.1.2 试剂 44-45 3.1.3 培养基 45 3.1.4 接头及引物 45-46 3.1.5 仪器 46 3.2 试验方法 46-55 3.2.1 大豆疫霉野生菌株和抗药菌株基因组 DNA 的获取 46-48 3.2.2 AFLP 反应体系 48-50 3.2.3 AFLP-变性凝胶电泳 50-51 3.2.4 数据统计及多态性分析 51 3.2.5 差异条带的克隆 51-54 3.2.6 差异条带测序及引物设计 54 3.2.7 抗药突变体与野生菌相关基因的比对 54-55 3.3 结果与分析 55-65 3.3.1 大豆疫霉菌基因组 DNA 提取与质量分析 55-56 3.3.2 大豆疫霉菌野生菌株与抗甲霜灵菌株 AFLP 指纹图谱分析 56-59 3.3.3 差异条带的回收及检测 59-60 3.3.4 差异条带的克隆 60-61 3.3.5 差异条带的测序结果及设计引物 61-63 3.3.6 AFLP 标记向 SCAR 标记的转换 63-65 3.4 讨论 65-68 3.4.1 AFLP 多态性分析 65 3.4.2 差异片段分析 65-66 3.4.3 关于 SCAR 标记转化 66-68 第四章 结论 68-70 4.1 大豆疫霉菌抗甲霜灵菌株的筛选及部分生物学特性研究 68 4.2 AFLP 多态性及相关差异片段分析 68-69 4.3 SCAR 标记的转化 69-70 参考文献 70-80 致谢 80-82 个人简历 82
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 经济作物病虫害 > 油料作物病虫害 > 大豆病虫害
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