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36个石榴品种的SRAP遗传多样性研究

作 者: 涂勋良
导 师: 邓群仙
学 校: 四川农业大学
专 业: 果树学
关键词: 石榴 SRAP 遗传多样性
分类号: S665.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
下 载: 42次
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内容摘要


石榴(Punica granatum L.),石榴科(Punicaceae)石榴属(Punica L.)落叶灌木或小乔木果树,它集生态、经济、社会效益、观赏与保健功能于一身。分子标记是研究植物遗传多样性和和遗传分化的有效工具。SRAP标记具有简单、快速和稳定的优点,被广泛应用于遗传多样性分析。本研究在完成供试石榴材料基因组DNA提取的基础上,采用SRAP标记方法对采自四川省凉山彝族自治州会理县海潮石榴母本园的36个石榴品种进行遗传多样性分析。主要研究结果如下:1.建立适用于石榴基因组DNA提取的方法:选用经硅胶干燥保存的石榴嫩叶材料,采用改良CTAB法,在液氮研磨过程中加入PVP30和Vc,以防止酚类物质氧化;裂解细胞核前加入STE溶液,采用低速离心收集沉淀,可有效地将细胞核与多糖、多酚类次生物质分开;酚/氯仿/异戊醇反复抽提2-3次,最终获得了高质量的石榴基因组DNA。2. SRAP反应体系为20μL,上、下游引物各1μL,模板DNA2μL,1U Taq Polymerase,0.5mmol/L dNTP each,3.0mmol/L Mg2+。SRAP-PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,35℃退火1min,72℃延伸1min,循环5次;94℃变性1min,50℃退火1min,72℃延伸1min,循环35次;最后72℃延伸5min,4℃保存。3.获得了36个石榴品种的SRAP标记的特异性位点:从100对SRAP随机引物中筛选出30对引物对36个石榴品种基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出5868个位点,DNA片段大小分布在100bp-2000bp之间,其中4032个多态性位点,多态性比率为98.04%。不同引物扩增的多态性也存在较大的差异,扩增的多态性位点为78至251不等,平均每对引物扩增出134.4个多态性位点。4.利用聚类分析,在阈值为0.77处可将36个石榴品种划分成八大类。三白甜石榴和豫大籽石榴聚为第Ⅰ类;黑籽甜石榴和突尼斯软籽石榴聚为第Ⅱ类;净皮甜石榴、天红蛋石榴、马牙石榴聚为第Ⅲ类;红牡丹石榴单独聚为第Ⅳ类;天红甜石榴、小青皮石榴、大青皮石榴、玉石子石榴、红皮石榴(山东枣庄)、薄皮石榴聚为第V类;以色列酸石榴、以色列软籽石榴、大红甜石榴、黑籽酸石榴、河阴软籽石榴聚为第Ⅶ类;红皮石榴(新疆叶城)单独聚为第Ⅷ类;其余16个品种共同聚在第Ⅵ类。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-8
缩写词表  8-12
前言  12-13
1 文献综述  13-24
  1.1 石榴种质资源研究概况  13-16
    1.1.1 石榴种质资源调查、收集和保存  13-14
    1.1.2 石榴种质资源分类研究  14
    1.1.3 石榴优良品种选育研究  14-15
    1.1.4 石榴遗传规律研究  15-16
  1.2 遗传多样性、遗传标记及其在石榴研究中的应用  16-24
    1.2.1 形态学标记  17
    1.2.2 细胞学标记  17-18
    1.2.3 生化标记  18-19
    1.2.4 分子标记  19-24
      1.2.4.1 RFLP标记  20
      1.2.4.2 RAPD标记  20-22
      1.2.4.3 AFLP标记  22-23
      1.2.4.4 ISSR标记  23
      1.2.4.5 SRAP标记  23-24
2 研究目的与意义  24-25
3 材料与方法  25-30
  3.1 供试材料  25-26
  3.2 主要仪器  26
  3.3 主要试剂  26-27
    3.3.1 试剂来源  26
    3.3.2 主要试剂  26-27
  3.4 方法  27-30
    3.4.1 部分形态学性状调查  27
    3.4.2 基因组DNA的提取和检测  27-28
      3.4.2.1 基因组DNA的提取  27-28
      3.4.2.2 DNA浓度及质量检测  28
    3.4.3 SRAP反应  28-30
      3.4.3.1 SRAP反应体系的建立  28
      3.4.3.2 SRAP引物筛选  28
      3.4.3.3 SRAP扩增  28
      3.4.3.4 扩增产物的电泳分析  28-29
      3.4.3.5 数据统计  29-30
4 结果与分析  30-36
  4.1 36个石榴品种部分形态学性状调查  30-31
  4.2 多态性分析  31-33
  4.3 遗传相似性分析  33-34
  4.4 聚类分析  34-35
  4.5 主成分分析  35-36
5 讨论  36-45
  5.1 石榴基因组DNA的提取  36-43
  5.2 石榴遗传多样性评价  43
  5.3 石榴种质资源的亲缘关系  43-44
  5.4 石榴种质资源的开发利用  44-45
6 结论  45
  6.1 石榴DNA提取  45
  6.2 石榴SRAP反应体系  45
  6.3 石榴SRAP标记的特异性扩增位点  45
  6.4 石榴SRAP标记聚类结果  45
7 主要创新点  45-46
8 进一步研究工作  46-47
参考文献  47-51
致谢  51

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 杂果类 > 石榴
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