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36个石榴品种的SRAP遗传多样性研究
作 者: 涂勋良
导 师: 邓群仙
学 校: 四川农业大学
专 业: 果树学
关键词: 石榴 SRAP 遗传多样性
分类号: S665.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
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石榴(Punica granatum L.),石榴科(Punicaceae)石榴属(Punica L.)落叶灌木或小乔木果树,它集生态、经济、社会效益、观赏与保健功能于一身。分子标记是研究植物遗传多样性和和遗传分化的有效工具。SRAP标记具有简单、快速和稳定的优点,被广泛应用于遗传多样性分析。本研究在完成供试石榴材料基因组DNA提取的基础上,采用SRAP标记方法对采自四川省凉山彝族自治州会理县海潮石榴母本园的36个石榴品种进行遗传多样性分析。主要研究结果如下:1.建立适用于石榴基因组DNA提取的方法:选用经硅胶干燥保存的石榴嫩叶材料,采用改良CTAB法,在液氮研磨过程中加入PVP30和Vc,以防止酚类物质氧化;裂解细胞核前加入STE溶液,采用低速离心收集沉淀,可有效地将细胞核与多糖、多酚类次生物质分开;酚/氯仿/异戊醇反复抽提2-3次,最终获得了高质量的石榴基因组DNA。2. SRAP反应体系为20μL,上、下游引物各1μL,模板DNA2μL,1U Taq Polymerase,0.5mmol/L dNTP each,3.0mmol/L Mg2+。SRAP-PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,35℃退火1min,72℃延伸1min,循环5次;94℃变性1min,50℃退火1min,72℃延伸1min,循环35次;最后72℃延伸5min,4℃保存。3.获得了36个石榴品种的SRAP标记的特异性位点:从100对SRAP随机引物中筛选出30对引物对36个石榴品种基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出5868个位点,DNA片段大小分布在100bp-2000bp之间,其中4032个多态性位点,多态性比率为98.04%。不同引物扩增的多态性也存在较大的差异,扩增的多态性位点为78至251不等,平均每对引物扩增出134.4个多态性位点。4.利用聚类分析,在阈值为0.77处可将36个石榴品种划分成八大类。三白甜石榴和豫大籽石榴聚为第Ⅰ类;黑籽甜石榴和突尼斯软籽石榴聚为第Ⅱ类;净皮甜石榴、天红蛋石榴、马牙石榴聚为第Ⅲ类;红牡丹石榴单独聚为第Ⅳ类;天红甜石榴、小青皮石榴、大青皮石榴、玉石子石榴、红皮石榴(山东枣庄)、薄皮石榴聚为第V类;以色列酸石榴、以色列软籽石榴、大红甜石榴、黑籽酸石榴、河阴软籽石榴聚为第Ⅶ类;红皮石榴(新疆叶城)单独聚为第Ⅷ类;其余16个品种共同聚在第Ⅵ类。
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全文目录
摘要 4-6 Abstract 6-8 缩写词表 8-12 前言 12-13 1 文献综述 13-24 1.1 石榴种质资源研究概况 13-16 1.1.1 石榴种质资源调查、收集和保存 13-14 1.1.2 石榴种质资源分类研究 14 1.1.3 石榴优良品种选育研究 14-15 1.1.4 石榴遗传规律研究 15-16 1.2 遗传多样性、遗传标记及其在石榴研究中的应用 16-24 1.2.1 形态学标记 17 1.2.2 细胞学标记 17-18 1.2.3 生化标记 18-19 1.2.4 分子标记 19-24 1.2.4.1 RFLP标记 20 1.2.4.2 RAPD标记 20-22 1.2.4.3 AFLP标记 22-23 1.2.4.4 ISSR标记 23 1.2.4.5 SRAP标记 23-24 2 研究目的与意义 24-25 3 材料与方法 25-30 3.1 供试材料 25-26 3.2 主要仪器 26 3.3 主要试剂 26-27 3.3.1 试剂来源 26 3.3.2 主要试剂 26-27 3.4 方法 27-30 3.4.1 部分形态学性状调查 27 3.4.2 基因组DNA的提取和检测 27-28 3.4.2.1 基因组DNA的提取 27-28 3.4.2.2 DNA浓度及质量检测 28 3.4.3 SRAP反应 28-30 3.4.3.1 SRAP反应体系的建立 28 3.4.3.2 SRAP引物筛选 28 3.4.3.3 SRAP扩增 28 3.4.3.4 扩增产物的电泳分析 28-29 3.4.3.5 数据统计 29-30 4 结果与分析 30-36 4.1 36个石榴品种部分形态学性状调查 30-31 4.2 多态性分析 31-33 4.3 遗传相似性分析 33-34 4.4 聚类分析 34-35 4.5 主成分分析 35-36 5 讨论 36-45 5.1 石榴基因组DNA的提取 36-43 5.2 石榴遗传多样性评价 43 5.3 石榴种质资源的亲缘关系 43-44 5.4 石榴种质资源的开发利用 44-45 6 结论 45 6.1 石榴DNA提取 45 6.2 石榴SRAP反应体系 45 6.3 石榴SRAP标记的特异性扩增位点 45 6.4 石榴SRAP标记聚类结果 45 7 主要创新点 45-46 8 进一步研究工作 46-47 参考文献 47-51 致谢 51
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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 杂果类 > 石榴
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