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西藏光核桃果实性状分析及遗传多样性研究

作　者: 谭江平
导　师: 廖明安
学　校: 四川农业大学
专　业: 果树学
关键词: 光核桃果实性状 SRAP标记遗传多样性居群遗传结构
分类号: S664.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
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内容摘要

本研究以西藏地区野生光核桃为材料,分析其主要果实性状,并用SRAP标记对材料进行了遗传多样性分析。研究结果如下：1.西藏光核桃果实的多样性水平较高,不仅外观变异较大,可溶性固形物含量高、可滴定酸含量高、维生素C含量高和果实带皮硬度大,而且部分样品糖酸的组合表现出风味浓郁的良好趋势。在18个果实性状中,性状等级划分方面,带皮硬度和风味级别最多,达到5个,单果质量和可溶性糖级别最少,仅为1个；变异系数方面,14个性状变异系数达到20%以上,其中果肉颜色的变异系数最大。2.采用正交设计,从dNTPs、Mg2+.引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素5个水平来优化SRAP-PCR反应体系。结果表明,光核桃25μL反应体系的最佳组分包括2.5μL10×buffer、0.35mmol/L dNTPs、1.5mmol/L Mg2+、0.4μmol/L引物、20ng模板DNA和2.5U Taq DNA聚合酶。3.选用20对引物组合对70份光核桃材料进行SRAP扩增,共得到376条清晰可辨的条带,其中多态性条带338条,多态性条带比高达89.89%。UPGMA聚类分析结果显示了各材料间存在一定的亲缘关系。平均相似系数为0.78,变化范围在0.59—0.95之间,47和57号材料的相似系数为0.59,二者的遗传距离最大,亲缘关系较远,7与9号材料的遗传距离较小,遗传相似系数为0.95。4.利用SRAP标记对来自西藏境内的4个光核桃自然居群的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析和评价。在居群水平上,多态位点百分率(PPB)为63.96%,Nei’s基因多样性(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.1943和0.2955。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为89.89%,Nei’s基因多样性(H)和Shannon信息指数(Ⅰ)分别为0.2460和0.3839。居群间的遗传分化系数(Gst)为0.1709,居群间的基因流(Nm)为1.2130。光核桃遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较小,居群间的基因交流程度较高。5.4个居群间的遗传距离为0.0217—0.1003,对居群进行聚类分析得到,林芝居群和昌都居群聚为1组,拉萨居群和日喀则居群均单独为1组。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-7
縮写词  7-10
1 前言  10
2 文献综述  10-16
  2.1 光核桃研究概况  10-12
    2.1.1 光核桃的资源概况  11
    2.1.2 光核桃的生物学特性  11
    2.1.3 光核桃的生理生化研究  11-12
    2.1.4 光核桃在分类地位中的探讨  12
  2.2 SRAP分子标记及其在园艺植物中的应用  12-16
    2.2.1 SRAP标记  13
    2.2.2 SRAP分子标记应用于园艺植物上的研究进展  13-16
3 研究目的与意义  16
4 材料与方法  16-23
  4.1 材料  16-17
  4.2 主要试剂  17
  4.3 主要仪器  17-18
  4.4 方法  18-22
    4.4.1 果实性状观测方法及数据标准化  18-20
    4.4.2 SRAP标记方法  20-22
  4.5 数据分析  22-23
5 结果与分析  23-42
  5.1 利用果实性状研究西藏光核桃的遗传多样性  23-30
    5.1.1 光核桃果实形态特征的多样性  23-27
    5.1.2 光核桃果实品质特征的多样性  27-29
    5.1.3 光核桃果实性状的变异情况  29-30
  5.2 光核桃SRAP反应的体系优化与引物筛选  30-34
    5.2.1 基因组DNA的提取结果  30-31
    5.2.2 直观分析法评分  31-32
    5.2.3 各因素对PCR反应影响的差异分析  32
    5.2.4 因素内各水平对PCR结果的影响  32-34
    5.2.5 多态性引物组合的筛选  34
  5.3 利用SRAP技术研究西藏光核桃的遗传多样性  34-42
    5.3.1 SRAP扩增的多态性  34-37
    5.3.2 居群遗传多样性与遗传变异  37-38
    5.3.3 居群间的遗传关系  38-39
    5.3.4 西藏光核桃群体相似系数分析  39
    5.3.5 聚类分析  39-42
6 讨论  42-46
  6.1 光核桃果实性状的多样性分析  42
  6.2 SRAP分子标记技术体系的建立  42-44
    6.2.1 各因素对分子标记技术反应体系的影响  42-43
    6.2.2 正交设计在SRAP-PCR反应体系优化中的应用  43-44
  6.3 基于SRAP标记的光核桃遗传多样性的分析  44-46
    6.3.1 光核桃的遗传多样性与遗传结构  44-45
    6.3.2 光核桃居群遗传多样性的意义  45
    6.3.3 保护生物学意义  45-46
7 结论  46-47
  7.1 光核桃在果实性状上具有丰富的遗传多样性  46
  7.2 建立和优化了SRAP-PCR反应体系  46
  7.3 光核桃植物具有丰富的遗传多样性  46
  7.4 光核桃居群的遗传多样性高、遗传分化小、基因交流高  46-47
8 主要创新点及进一步研究的内容  47-49
参考文献  49-54
致谢  54-55
硕士期间发表论文情况  55

西藏光核桃果实性状分析及遗传多样性研究

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