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葫芦科和景天属植物的DNA条形码通用序列研究

作　者: 李妮
导　师: 陈科力
学　校: 湖北中医药大学
专　业: 中药学
关键词: DNA条形码葫芦科景天属 psbA-trnH ma tK rbcL ITS2
分类号: S567
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的：评价几个热点DNA条形码候选序列对葫芦科、景天属植物的鉴别能力。方法：使用ITS2.rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对葫芦科、景天属植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、种内和种间的变异、barcoding gap,以及采取BLAST 1和nearest Distance等方法评价不同序列的鉴定能力。结果：ITS2序列对葫芦科33个属,90个物种,182个样本进行分析,其鉴定成功率较高,在属水平为100.0%,在物种水平为88.5%；psbA-trnH序列对201个样本进行分析,其鉴定成功率在属的水平为93.0%,在物种水平为73.1%,但它可以补充部分ITS2不能分析的物种区域。ITS2序列在采集的景天属几种药用植物中扩增成功率为100%,其种间与种内变异差异显著、barcoding gap较psbA-trnH、rbcl序列具有更明显的优势,而且纳入网上48个样品33个种的数据后鉴定成功率仍达到100%。结论：ITS2和psbA-trnH是适合葫芦科植物鉴别的一个较好的DNA条形码序列组合。ITS2序列能够准确鉴定景天属药用植物,并将其与常见混伪品区别开,ITS2被推荐为景天属首选的DNA条形码序列。

全文目录

中文摘要  4-5
Abstract  5-7
前言  7-9
第一部分葫芦科植物DNA条形码序列筛选  9-19
  1. 试验材料  9
  2. 试验方法  9-11
  3. 结果  11-15
  4. 讨论  15-19
第二部分景天属植物DNA条形码序列筛选  19-31
  1. 试验材料  19
  2. 试验方法  19-21
  3. 结果  21-28
  4. 讨论  28-31
结语  31-32
参考文献  32-36
文献综述  36-59
  参考文献  52-59
附录  59-62
研究生在读期间完成的论文  62-63
致谢  63

葫芦科和景天属植物的DNA条形码通用序列研究

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