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天山山间盆地两大盐湖放线菌多样性及聚酮合酶基因多样性研究
作 者: 贾晓宇
导 师: 张利莉
学 校: 塔里木大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 巴里坤盐湖 七角井盐湖 免培养方法 可培养方法 聚酮合酶多样性
分类号: Q93-3
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
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嗜盐放线菌是目前进行潜在新物种和新产物发掘研究的良好材料,嗜盐放线菌能产生胞外多糖及其它聚合物,蛋白含量极高,也产生大量的抗生素、维生素等。嗜盐放线菌将是筛选新的生物活性物质,特别是新抗生素的重要资源菌。我国西部地区有大面积的盐湖和盐碱地,尤其是新疆、青海等地区存在丰富的高盐环境,该研究以新疆哈密境内巴里坤、七角井两大盐湖土样为研究对象,通过构建16SrRNA基因克隆文库,对两大盐湖免培养放线菌多样性进行分析。此研究可以全面挖掘盐湖微生物的物种资源,从而客观认识盐湖环境微生物的物种多样性及差异,同时也可以积累有用的物种资源信息,为盐渍化环境的生态修复,极端环境放线菌资源的保护和利用提供前提和保障。(1)该文对两大盐湖土壤总DNA进行16SrDNA基因扩增,构建16SrDNA基因文库,并对文库中的插入片段进行RFLP(限制性片段长度多态性,Restriction Fragment Length Polymorphism)分析并测序。结果表明:巴里坤盐湖232个克隆、七角井盐湖176个克隆均分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae);优势放线菌分别为放线菌亚纲Iamiaceae的Iamia.假诺卡氏科的拟无枝酸菌属(Amycolatopsis);分别有81.0%,58.3%的克隆序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,极有可能代表着放线菌新的类群。(2)可培养采用不同盐浓度的8种选择性培养基分离放线菌,巴里坤盐湖和七角井盐湖分别分离到20、35株放线菌,巴里坤盐湖20株嗜盐放线菌分属在6个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)、涅斯捷连科氏菌属(Nesterenkonia)、放线多孢菌属(Actinopolyspora)、纤维单胞菌属(Cellulomonas)和分支杆菌属(Mycobacterium);七角井盐湖35株嗜碱放线菌分属7个属,以链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)为主,其他的为糖单孢菌属(Saccharomonospora)、糖多孢菌属(Saccharopolyspora)、考克氏菌属(Kocuria)、短状杆菌属(Brachybacterium)、放线多孢菌属(Actinopolyspora)。(3)对已获得纯培养的55株菌株进行聚酮合酶基因的筛选,检测结果得出阳性率为43.6%,其中链霉菌属和拟诺卡氏菌属是具有聚酮合酶基因主要的菌源。以上结果表明天山山间盆地两大盐湖中放线菌具有较高的多样性,并蕴藏着丰富的聚酮合酶基因类型,值得深入研究和开发。
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全文目录
摘要 6-7 Abstract 7-9 第一章 文献综述 9-20 1.1 极端环境中放线菌的研究 9-10 1.2 微生物多样性研究概况 10-16 1.2.1 可培养方法研究 11-12 1.2.2 免培养方法研究 12-16 1.3 嗜盐放线菌的分离 16-17 1.4 放线菌聚酮合酶基因研究概况 17-18 1.5 论文的设计思路 18-20 1.5.1 前言 18 1.5.2 设计思路 18 1.5.3 研究方案 18-19 1.5.4 技术路线 19-20 第二章 天山山间盆地两大盐湖免培养放线菌多样性研究 20-32 2.1 材料及方法 20-23 2.1.1 材料 20 2.1.2 方法 20-23 2.2 结果与分析 23-30 2.2.1 两大盐湖免培养放线菌物种多样性分析 23-30 2.3 讨论 30-32 第三章 天山山间盆地两大盐湖可培养放线菌多样性研究 32-41 3.1 材料与方法 32-35 3.1.1 分离培养方法 32-33 3.1.2 初步鉴定放线菌种类 33-35 3.2 结果与分析 35-39 3.2.1 两大盐湖可培养放线菌物种多样性 35-39 3.3 讨论 39-41 第四章 两大盐湖聚酮合酶基因多样性研究 41-46 4.1 材料与方法 41-43 4.1.1 两大盐湖可培养放线菌聚酮合酶基因多样性分析研究 41 4.1.2 实验用试剂 41 4.1.3 菌株DNA的提取 41-43 4.2 结果与分析 43-46 4.2.1 两大盐湖放线菌聚酮合酶基因图谱分析 43-44 4.2.2 结果与分析 44-46 第五章 结论与讨论 46-50 5.1 结论 46 5.2 讨论 46-49 5.3 展望 49-50 参考文献 50-54 致谢 54-55 作者简介 55
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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物研究与微生物实验
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