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实时荧光RT-PCR快速检测高致病性禽流感病毒(HPAIV)H5亚型

作 者: 赖平安
导 师: 汪明
学 校: 中国农业大学
专 业: 预防兽医学
关键词: 高致病性禽流感病毒 H5亚型 实时荧光RT-PCR 检测
分类号: S854.43
类 型: 博士论文
年 份: 2005年
下 载: 531次
引 用: 3次
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内容摘要


为提高检测HPAIVH5亚型的敏感性,缩短检测时间,降低禽肉产品储存成本,本项目利用实时荧光RT-PCR的高敏感性和反应体系的封闭性建立了实时荧光RT-PCR检测方法以进一步提高检测方法的敏感性和特异性。根据HPAIV H5血凝素(HA)基因保守区序列,合成了70对引物和4条探针,经过引物、探针筛选优化、反应体系、无机离子浓度、反转录酶筛选及浓度优化、Taq酶浓度优化等一系列的试验,建立了直接从禽肉组织中快速检测高致病力禽流感病毒H5亚型的实时荧光RT-PCR方法。以4株H5亚型高致病力禽流感病毒的感染性尿囊液经稀释后进行荧光RT-PCR检测,敏感性达10-6~10-7;对鸡肉或鸭肉中可能存在的鸡传染性贫血因子、鸡传染性法氏囊病毒、传染性支气管炎病毒(H120、H52、肾型传支)、新城疫强毒和疫苗毒、H9亚型禽流感病毒、鸭瘟病毒、鸭传染性肝炎病毒进行检测,结果均为阴性。表明:建立的检测方法敏感性高、特异性强。与国际标准方法一国际兽疫局(OIE)确定的鸡胚病毒分离相比,将检测时间从原来最短需要21天大大缩短为4小时。 用分离的4株HPAIV H5分别感染SPF鸡20只、肉鸡、肉鸭各30只,感染后7天内,肉鸡全部死亡,SPF鸡5天内死亡率80-90%,肉鸭在试验观察的23天内,死亡率6.7%(2/30),绝大部分未表现临床症状。对死亡的肉鸡、SPF鸡和肉鸭的心、肝、脾、肺、肾、气管、直肠、骨髓、胸肌、腿肌、翅肌分别采样进行荧光RT-PCR检测和鸡胚病毒分离对比试验。SPF鸡肌肉组织荧光RT-PCR检测的敏感性为10-4,鸡胚病毒分离的敏感性为10-4~10-5,内脏器官荧光RT-PCR检测的敏感性为10-3~10-5,鸡胚病毒分离为10-3~10-5;肉鸡肌肉悬液荧光RT-PCR检测的敏感性为10-3~10-4,鸡胚病毒分离的敏感性为10-4~10-5,内脏器官荧光RT-PCR检测的敏感性为10-2~10-5,鸡胚病毒分离的敏感性为10-3~10-6;死亡鸭肌肉组织荧光RT-PCR检测的敏感性为10-2~10-4,鸡胚病毒分离的敏感性为10-2~10-3,各脏器荧光RT-PCR检测的敏感性为原倍~10-4,鸡胚病毒分离的敏感性为阴性~10-4。经统计学分析,两种检测方法敏感性差异不显著。对人工感染HPAIV H5未表现出临床症状的鸭分别在不同时间扑杀,取肌肉组织和脏器进行荧光RT-PCR检测,同时进行鸡胚病毒分离对比实验,结果为:感染后3天,鸭组织脏器中病毒量高用两种方法基本都能检出;感染后9—15天,组织脏器中病毒量逐渐减少,有的脏器已检不出病毒:至感染后23天,组织脏器中病毒量有所增加。 对自然感染高致病力禽流感病毒H5亚型死亡鸭肌肉组织及内脏器官进行荧光RT-PCR检测和鸡胚病毒分离,不同的个体检测结果差异较大,但两种检测方法对相同样品检测的敏感性差异不显著(P>0.05)。

全文目录


符号与缩略语  6-7
中文摘要  7-8
英文摘要  8-10
第一章 引言  10-21
  1.1 国内外研究概况  10-18
  1.2 研究的目的意义  18-19
  1.3 研究内容  19-21
第二章 实时荧光RT-PCR快速检测高致病性禽流感病毒H5亚型方法的建立  21-36
  2.1 前言  21
  2.2 材料与方法  21-32
  2.3 结果与分析  32-34
  2.4 讨论  34
  2.5 小结  34-36
第三章 实时荧光RT-PCR对人工感染HPAIV H5 的SPF鸡、肉鸡、肉鸭肌肉组织和各脏器中病毒的检测  36-47
  3.1 前言  36
  3.2 材料与方法  36-39
  3.3 结果与分析  39-44
  3.4 讨论  44-46
  3.5 小结  46-47
第四章 HPAIV H5自然发病鸭场不同检样实时荧光RT-PCR的检测  47-53
  4.1 前言  47
  4.2 材料与方法  47-48
  4.3 结果与分析  48-51
  4.4 讨论  51-52
  4.5 小结  52-53
第五章 实时荧光RT-PCR检测HPAIV H5方法的实际应用  53-59
  5.1 前言  53
  5.2 材料与方法  53
  5.3 结果与分析  53-57
  5.4 小结及讨论  57-59
结论  59-60
创新点  60-61
参考文献  61-68
致谢  68-69
附录  69-76
  附录Ⅰ.高致病性禽流感病毒株的标准  69-70
  附录Ⅱ.实时荧光RT-PCR检测图  70-75
  附录Ⅲ.禽流感病毒H5亚型血凝素基因  75-76
个人简介  76

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医临床医学 > 兽医诊断学 > 实验室诊断法
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