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新疆核桃种质资源遗传多样性分析

作　者: 李超
导　师: 罗淑萍
学　校: 新疆农业大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 核桃(Juglans regia L.) 遗传多样性 ISSR PAPD SCAR
分类号: S664.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

核桃(Juglans regia L.)系胡桃科核桃属,是重要的营养坚果。但由于近年来核桃产业不断发展以及优良品种的盲目推广,一些适应性强的野生种逐渐消失,基因资源遭受破坏,物种有单一化发展的趋势。因此,利用遗传标记技术对核桃资源遗传多样性及遗传结构进行研究,为资源的保护与利用提供理论依据显得尤为必需和迫切。本研究采用ISSR和RAPD标记技术,对分布在哈密、鄯善、吐鲁番、巩留、霍城、温宿6个居群共163份核桃样品的遗传多样性和遗传结构进行分析,较系统地揭示了不同居群在遗传多样性水平上的差异及物种的遗传分化情况；并将筛选出一个与核桃早实特性相关的RAPD标记转化为SCAR标记。主要结果如下：1.从100条ISSR引物中筛选出13条,对163份核桃样品进行扩增,共检测位点117个,其中多态位点98个,多态位点百分率(PPL)为83.76%,Nei’s遗传多样度(H)为0.3010,Shannon’s信息指数(Ⅰ)为0.4182。不同居群遗传多样性水平上差异较大,温宿居群遗传多样性水平较高,巩留居群遗传多样性水平较低,居群之间产生了较大的遗传分化(Gst为0.6425),并且存在较小的基因流(Nm为0.2782)。AMOVA分析表明居群间遗传变异占70.55%,居群内变异占29.45%。UPGMA聚类与Mantel检测显示6个居群具有较高的遗传相关性,其相关系数(r)值为0.6144。2.从200条RAPD引物中筛选出18条,对163份核桃样品进行扩增,共检测位点192个,其中多态位点有154个,多态位点百分率(PPL)为80.21%,Nei’s遗传多样度(H)为0.3185,Shannon’s信息指数(1)为0.4830。不同居群遗传多样性水平上的差异也较大,温宿居群遗传多样性水平较高,巩留居群遗传多样性较低。在居群间产生了较大的遗传分化(Gst为0.5095),并且存在较小基因流(Nm为0.4814)。AMOVA分析表明在居群间核桃遗传变异占52.00%,居群内变异占48.00%。UPGMA聚类与Mantel检测显示6个居群具有较高的遗传相关性,其相关系数(r)值为0.5307。3.ISSR和]RAPD两种标记技术分析结果具有较高的相似性,表明新疆核桃居群遗传多样性水平较高。4.筛选出一个与核桃早实特性相关的RAPD标记,并成功转化为SCAR标记。

新疆核桃种质资源遗传多样性分析

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