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青岛近海岸特征环境中海洋异养细菌的鉴定及其分布特征的研究

作　者: 周宏霞
导　师: 李筠
学　校: 中国海洋大学
专　业: 海洋生物学
关键词: 海洋异养细菌 Biolog鉴定 ARDRA 16SrDNA鉴定 生理生化鉴定
分类号: Q93-33
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
下　载: 290次
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内容摘要


青岛近海洁净海区、养殖密集区、工业区分离了428株菌,通过Biolog方法对其进行了鉴定,对结果进行比较分析发现洁净海水特有的种群为聚簇37。养殖密集区来源于海水中的特有种群为:聚簇7、聚簇49;来源于底泥中特有种群为:聚簇11、聚簇14;海水、底泥中都特有的种群为:聚簇18、聚簇47。工业区来源于底泥且为该区所特有的种群为聚簇36;海水、底泥中均有分布的特有种群为聚簇16、聚簇22。ARDRA方法分析青岛近海岸特征环境中的异养细菌,采用RsaI和HhaI分别进行酶切,结果显示:RsaI酶切后产生9种带型,HhaI酶切后产生11种带型。且与Biolog结果大体一致。经16SrDNA分析和生理生化鉴定得出:D1233与D4058为塔氏弧菌(Vibrio tasmaniensis);D4051和D1234为灿烂弧菌(Vibrio splendidus);D5050为Vibrio alginolyticus。D2113、D6084、D3038、D2096为Oceanimonas doudoroffi。D1103、D1134为Acinetobacter johnsonii。D3044、D3043为Erythrobacter aquimaris。D4042为Rhodovirga aquimarina。D3052、D3055、D3057、D3047、D4012、D4041、D3048、D3054为噬纤维菌属,并且为同一种。D7038可确定为橙色假交替单胞菌(Pseudoalteromonas citrea)。D5044为假单胞菌属(Pseudomonas)。其中D1233、D1234来自聚簇37;D7038来自聚簇7,D5050来自聚簇49,D3043、D3044来自聚簇11,D5044来自聚簇14,D2096、D2113、D3038、D6084来自聚簇47;D3047、D3048、D3052、D4041、D4042、D4012、D3047、D4012、D3054来自聚簇45。D4051、D4058来自聚簇36;D1103、D1134来自聚簇16;D2001、D2042来自聚簇22。通过以上多种方法的运用,最后得出青岛近海岸的异氧细菌的分布特征:其中洁净区的特征类群为属于Vibrio,工业区的特征类群属于Vibrio和Acinetobacter,养殖密集区的特征类群属于Vibrio、Pseudoalteromonas、

全文目录


中文摘要  6-8
英文摘要  8-10
前言  10-27
  1 海洋微生物多样性的概念  10-11
  2 海洋微生物多样性研究发展状况  11-13
  3 海洋微生物多样性资源的开发利用  13-15
    3.1 研究开发有经济价值的海洋生物活性物质  13-14
    3.2 海洋生物材料的研究开  14
    3.3 海洋微生物极端酶资源  14-15
    3.4 海洋污染环境的生物修复  15
  4 细菌分类与鉴定的发展状况  15-19
    4.1 传统的分类方法  15-16
    4.2 数值鉴定和自动化鉴定等  16-19
  5 细菌多样性分析  19-22
    5.1 变性梯度凝胶电泳（DGGE）或温度梯度凝胶电泳（TGGE.）  19-20
    5.2 随机扩增DNA 多态性分析（RAPD）  20
    5.3 单链构象多态性法（SSCP）  20-21
    5.4 扩增性片断长度多态性（AFLP）  21
    5.5 限制性片断长度多态性（RFLP）  21-22
  6 本研究的目的和意义  22-23
  参考文献  23-27
第一章 BIOLOG-GN 方法对青岛近岸特征环境中异养细菌多样性的研究  27-33
  1 材料与方法  27-29
    1.1 样品采集  27
    1.2 培养基  27-28
    1.3 样品处理  28-29
    1.4 细菌的BIOLOG 鉴定  29
  2 结果与讨论  29-32
  参考文献  32-33
第二章 ARDRA 方法对青岛近海岸细菌多样性分析  33-42
  1 材料与方法  33-37
    1.1 菌株来源  33
    1.2 培养基  33-34
    1.3 试剂  34
    1.4 仪器  34
    1.5 引物设计及合成  34
    1.6 细菌染色体DNA 的提取  34-35
    1.7 PCR 扩增16SrDNA 基因  35-36
    1.8 16SrDNA 的酶切  36-37
  2 结果  37-39
    2.1 16SrDNA 的酶切电泳图  37-38
    2.2 16SrDNA 的酶切电泳图的分析  38-39
  3 讨论  39-40
  参考文献  40-42
第三章 16SrDNA 序列分析青岛近岸特征环境中异养细菌  42-59
  1 16SrDNA 基因的克隆  42-45
    1.1 材料与方法  42-45
    1.2 结果  45
  2.16SrDNA 的克隆  45-57
    2.1 材料与方法  46-50
    2.2 扩增后的16SrDNA序列的测定  50-51
    2.3 16SrDNA 序列分析与比较  51
    2.4 结果  51-57
  3 讨论  57-58
  参考文献  58-59
第四章 青岛近海岸特征环境中异养细菌的生理生化鉴定  59-69
  1 材料与方法  59
    1.1 菌株来源  59
    1.2 培养基  59
    1.3 细菌培养基  59
    1.4 细菌鉴定  59
  2 结果  59-66
    2.1 弧菌属的鉴定结果  60-61
    2.2 海单胞菌属的鉴定结果  61-62
    2.3 假单胞菌属的鉴定结果  62-63
    2.4 不动杆菌属的鉴定结果  63
    2.5 不确定属菌株的鉴定结果  63-64
    2.6 噬纤维菌属的鉴定结果  64-66
  3 讨论  66-68
  参考文献  68-69
第五章 青岛近岸特征环境中异养细菌的分布特征  69-72
  参考文献  70-72
结论  72-73
致 谢  73

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