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坛紫菜微卫星的分离及其在紫菜遗传多样性研究中的应用

作　者: 姚继承
导　师: 陈奕欣；方文珍
学　校: 厦门大学
专　业: 动物学
关键词: 坛紫菜微卫星遗传标记
分类号: S917.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2004年
下　载: 139次
引　用: 3次
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内容摘要

坛紫菜是一种营养价值很高的海藻,在福建省有悠久的栽培历史。运用分子生物学技术分析坛紫菜种质资源的遗传多样性,寻找相关的分子标记,可以指导培育实践,加快育种进程。本实验首先构建了部分坛紫菜小片段基因组文库,从中筛选到1500左右个阳性克隆,在215个阳性克隆中筛选到4个微卫星位点。选择其中的2个微卫星位点ATN4和GAN5以及从GeneBank里搜索的江蓠的3个微卫星位点AJ512812、AJ512806和AJ512804对9个紫菜样品(LYG、RD、CS、GL1、DXY、BBD、JJS、NH和LSD)进行PCR扩增。5个微卫星位点共检测到31个DNA条带,其中条带最多的位点是AJ512812,有12条;条带最少的位点是AJ512804,只有1条带,其它位点扩增的条带数在4～8之间。在所有的31条带种有26条具有多态性,占条带总数的83.9%。根据微卫星检测的结果,采用类间平均链锁法(Between groups linkage)对各样品间的Nei氏遗传相似系数进行聚类分析。分析结果显示野生坛紫菜样品NH、JJS和LSD之间的遗传相似系数最高,达到96.8%;坛紫菜各样品间的遗传相似系数在58.1%～96.8%之间,不同海区、栽培样品与野生样品之间存在很大的遗传差异。这表明坛紫菜的种质资源遗传多样性丰富,将为坛紫菜的良种选育奠定基础。从聚类树状图可以看出,9个紫菜样品共聚成两大类,坛紫菜样品NH、JJS和LSD首先聚为一类,再和其它4种坛紫菜样品聚集,条斑紫菜样品LYG和RD先聚在一起,最后与坛紫菜样品相聚。不同海区的两种养殖坛紫菜CS和GL1之间的遗传距离甚至大于坛紫菜与条斑紫菜之间的遗传距离,说明地理环境不同会造成紫菜在遗传上的较大差异,有时甚至大于种间的遗传距离。5个微卫星位点在9个紫菜样品中共扩增出6个特异性条带。条斑紫菜

全文目录

中文摘要  9-11
英文摘要  11-13
一、前言  13-25
  1 遗传标记技术概述  13-14
  2 微卫星的简介  14-18
  3 微卫星分析的一般流程  18-20
  4 微卫星标记的应用  20-22
  5 分子标记技术在紫菜研究中的应用  22-23
  6 本课题的研究目的及意义  23-25
二、材料与方法  25-39
  1 实验材料  25-26
  2 实验仪器  26-27
  3 药品及试剂  27-29
  4 实验方法  29-39
三、结果与分析  39-56
  1 部分小片段基因组文库的构建及阳性克隆的筛选  39-42
  2 含有微卫星的阳性克隆的筛选及分析  42-48
  3 微卫星引物的设计与合成  48-49
  4 微卫星分析  49-56
四、讨论  56-64
  1 坛紫菜部分小片段基因组文库的构建及阳性克隆的筛选  56-58
  2 含有微卫星的阳性克隆的筛选  58-59
  3 微卫星分析  59-64
小结与展望  64-65
参考文献  65-74
攻读硕士期间发表的论文和参加的课题  74-75
致谢  75-76
附录  76

坛紫菜微卫星的分离及其在紫菜遗传多样性研究中的应用

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