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特殊氢方法预测丙氨酸-α-多肽构象的稳定性

作　者: 王潇伟
导　师: 王长生
学　校: 辽宁师范大学
专　业: 无机化学
关键词: 密度泛函理论非键相互作用特殊氢原子特殊氢方法
分类号: O629.72
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
下　载: 23次
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内容摘要

本文定义了丙氨酸多肽中的特殊氢原子并提出了特殊氢方法，采用密度泛函理论B3LYP方法，对丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子进行了计算，对构象中与特殊氢原子有关的主要非键相互作用进行分析，确定了相应的参数。使用特殊氢方法得到的参数来快速预测多肽构象的相对稳定性，得到了满意的结果。本文结果进一步证明了特殊氢原子在决定丙氨酸-α-多肽构象稳定性方面的重要地位。 1)以丙氨酸-α-多肽的稳定构象为研究对象，明确提出了特殊氢方法，在已有参数的基础上，引入了新参数并确定了相互作用参数的数值。 2)使用特殊氢方法及相应参数来预测丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子共239个稳定构象的稳定性，进而将之应用于预测丙氨酸-α-多肽分子构象稳定性，得到了满意的结果。

全文目录

中文摘要  4-5
前言  5-18
第一章特殊氢方法中非键相互作用参数的确立  18-25
  1．1 简介  18-19
  1．2 丙氨酸-α-多肽中的特殊氢原子及其有关的非键相互作用  19-20
  1．3 特殊氢方法及七种非键相互作用参数  20-23
  1．4 使用七种参数预测丙氨酸-α-四肽构象的相对稳定性  23-25
第二章丙氨酸-α-五肽中新参数的确立及对分子构象稳定性的预测  25-30
  2．1 丙氨酸-α-五肽构象分子中三种新参数的确立  25-28
  2．2 使用特殊氢方法的十种参数预测五肽分子构象的稳定性  28-30
第三章对于丙氨酸-α-二～五肽分子构象,本文与参考文章中参数的对比分析  30-33
  3．1 两文中参数数值的比较  30-31
  3．2 运用参数所得结果的分析比较  31-33
第四章丙氨酸-α-六肽中新参数的确立及对多肽分子构象稳定性的预测  33-56
  4．1 丙氨酸-α-六肽构象分子中二种新参数的确立  33-35
  4．2 用特殊氢方法的十二种参数预测六肽分子构象的稳定性  35-37
  4．3 特殊氢方法预测丙氨酸-α-多肽分子构象的稳定性  37-46
  4．4 丙氨酸-α-多肽分子构象的二面角分析  46-48
  4．5 结果分析及展望  48-56
参考文献  56-63
英文摘要  63-64
致谢  64-65

特殊氢方法预测丙氨酸-α-多肽构象的稳定性

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