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新疆良种驴DGAT2基因部分序列PCR-SSCP多态性与生产性状相关性分析
作 者: 王颜颜
导 师: 王金富;托乎提·阿及德
学 校: 石河子大学
专 业: 基础兽医学
关键词: 新疆良种驴 DGAT2基因 PCR-SSCP 多态性 生产性状
分类号: S822
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
DGAT是脂肪合成代谢中的关键酶之一,它与脂类在脂肪细胞中的沉积、血浆中三酰甘油的调节、肌肉中能量代谢以及畜禽卵母细胞的形成等有密切的关系。研究证明,DGAT基因是影响畜禽肉质性状、产奶性状和体脂性状的重要候选基因,己成为进行分子标记辅助育种主要因素之一,对筛选和鉴定影响新疆良种驴的肉质、产奶等生产性状,具有重要的理论意义和应用价值。本实验采用PCR-SSCP技术,对新疆和田和喀什良种驴的DGAT2基因的多态性进行了检测,对不同SSCP带型的DNA片段进行测序,分析了新疆良种驴的遗传多样性及多态性位点与生产性状的关系,为其合理保护、开发和利用提供了科学依据。实验结果如下:(1) PCR-SSCP技术检测结果分析检测了新疆和田和喀什良种驴DGAT2基因第3、4、5内含子和第5、6外显子的多态性,仅发现第3内含子存在多态性现象,有两种等位基因分别命名为A和B,存在AA和AB两种基因型,没有检测到BB基因型,其中AA基因型为优势基因型。纯合子AA型有两条带,杂合子AB有四条带。基因型频率AA>AB,基因型频率为0.6964(0.3036)。测序结果表明:AB型与AA型相比存在A→G的碱基突变。(2) DGAT2基因第3内含子多态性与体尺性状的相关性分析DGAT2基因第3内含子多态性与体尺性状有极显著或显著的相关性。和田良种驴AA与AB基因型个体相比,体高和胸围差异极显著(P<0.01),体长差异显著(P<0.05),AB型体高、胸围和体长高于AA型。喀什良种驴AA与AB基因型个体相比,体高差异显著(P<0.05),AB型体高、胸围和体长高于AA型,但体长和胸围差异不显著(P>0.05)。实验群体中喀什良种驴在体高、体长和胸围高于和田良种驴,差异极显著(P<0.01)。(3) DGAT2基因第3内含子多态性与屠宰性状的相关性分析和田良种驴AA和AB基因型个体的体重、胴体重、屠宰率及净肉重差异不显著(P>0.05),只有净肉率差异极显著(P<0.01),但这几项测定值均是AB型高于AA型。喀什良种驴AA和AB基因型个体的体重、胴体重、屠宰率、净肉重及净肉重差异都不显著(P>0.05),但这几项测定值中,除AB型的净肉率高于AA型,其余均是AA型高于AB型。和田良种驴的屠宰率和净肉率高于喀什良种驴,差异极显著(P<0.01)。(4) DGAT2基因第3内含子多态性与奶产量的相关性分析DGAT2基因内含子3多态性位点与和田和喀什良种驴的奶产量没有显著的相关性,AB基因型平均日产奶量与整个泌乳期的产奶总量高于AA基因型,但是都没有达到显著水平。
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全文目录
摘要 5-6 ABSTRACT 6-8 目录 8-10 中英文对照表 10-11 绪论 11-12 第一篇 文献综述 12-22 1 新疆养驴业的历史、现状及发展途径 12-15 1.1 新疆驴的起源 12-15 2 良种驴种群的产生及其特点 15-16 2.1 良种驴的产生 15 2.2 良种驴品种特点 15-16 3 DGAT2基因研究概况 16-19 3.1 DGAT基因概述 16 3.2 DGAT基因的定位与结构 16-17 3.3 DGAT基因的功能与作用 17-18 3.4 DGAT基因的遗传多态性 18-19 3.5 DGAT基因研究前景 19 4 PCR-SSCP研究概况 19-22 4.1 PCR-SSCP原理 19-20 4.2 PCR-SSCP技术发展及应用前景 20-22 第二篇 试验研究 22-43 1 材料与方法 22-30 1.1 材料 22-24 1.2 方法 24-27 1.3 聚合酶链式反应(PCR) 27-28 1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测 28-29 1.5 PCR产物回收测序 29-30 1.6 序列测定 30 1.7 数据统计分析 30 2 结果与分析 30-37 2.1 基因组DNA样品的检测 30 2.2 DGAT2基因PCR-SSCP多态性检测 30-35 2.3 DGAT2基因内含子3PCR-SSCP多态性与驴生产性状的相关性分析 35-37 3 讨论 37-43 3.1 基因组DNA的制备 37-38 3.2 影响PCR扩增的因素 38 3.3 影响PCR-SSCP的因素 38-39 3.4 DGAT2基因第3内含子基因型、等位基因频率分析 39-40 3.5 DGAT2基因第3内含子PCR-SSCP多态性对良种驴体尺性状的影响 40-41 3.6 DGAT2基因第3内含子多态性与新疆良种驴屠宰性状的相关性 41 3.7 DGAT2基因第3内含子多态性与新疆良种驴产奶量的相关性 41-43 总体结论 43 创新点 43-44 参考文献 44-50 附录 50-52 致谢 52-53 作者简介 53-54 石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表 54
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 驴、骡
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