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肾结核尿液蛋白指纹图谱诊断模型的研究

作　者: 张照勇
导　师: 张立东
学　校: 新疆医科大学
专　业: 外科学
关键词: 肾结核 SELDI-TOF-MS 蛋白质组学诊断模型
分类号: R527.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的：检测肾结核患者尿液中蛋白质指纹图谱,筛选特异性蛋白标记物,构建肾结核早期诊断模型并分析其临床意义。方法：收集新疆医科大学第一附属医院2010年7月-2010年12月经手术病理证实的肾结核患者术前尿液标本25例,作为病例组；健康体检者15例及非肾结核其他泌尿系疾病患者8例的尿液标本作为对照组。采用SELDI-TOF-MS蛋白芯片技术进行尿液蛋白图谱检测,将筛选出的差异蛋白用ZUCI-PDAS软件包数据分析系统进行处理。运用遗传算法(genetic arithmetic, GA)结合支持向量机(support vector machine, SVM)运算建立肾结核尿液蛋白指纹图谱诊断模型,并用盲法验证其诊断价值。结果：比较肾结核组及对照组尿液蛋白指纹图谱时共筛选出87个差异蛋白峰(P＜0.05)。选取M/Z为11837,11721,4748,11926,4769,1513共6个特异性蛋白标记物用于构建诊断模型。留一法交叉验证该诊断模型的灵敏度为84.62%,特异度为84.62%,约登指数为0.692,阳性预测值为84.62%,阴性预测值为84.62%,留一法盲法验证该诊断模型的灵敏度为83.33%,特异度为80.00%,约登指数为0.633,阳性预测值为83.33%,阴性预测值为80.00%。结论：SELDI-TOF-MS蛋白芯片技术结合生物信息学可以检测肾结核患者尿液蛋白指纹图谱,筛选出了特异性的蛋白标记物,并建立了肾结核早期诊断模型且有较好的诊断价值。

全文目录

摘要  7-8
ABSTRACT  8-10
前言  10-11
资料与方法  11-16
  1.研究对象  11-13
    1.1 标本来源  11
    1.2 主要试剂及配制方法  11-12
    1.3 主要仪器  12-13
  2.方法  13-16
    2.1 尿液标本的收集和制备  13
    2.2 实验分组  13
    2.3 IMAC-Cu-30蛋白质芯片的制备  13-14
    2.4 参数设置、芯片检测和数据采集  14
    2.5 生物学分析  14-15
    2.6 统计学方法  15-16
结果  16-20
讨论  20-28
小结  28-29
致谢  29-30
参考文献  30-34
综述  34-42
  参考文献  39-42
攻读硕士学位期间发表的学术论文  42-43
导师评阅表  43

肾结核尿液蛋白指纹图谱诊断模型的研究

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