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羊栖菜养殖品系DNA指纹分析及遗传变异的研究

作 者: 吕慧
导 师: 段德麟
学 校: 中国科学院研究生院(海洋研究所)
专 业: 海洋生物学
关键词: 羊栖菜 DNA指纹图谱 种群遗传分析 RAPD(Random amplified polymorphic DNA) ISSR(Inter-simple sequence repeat) SCAR(Sequence characterized amplified region)
分类号: S968.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 58次
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内容摘要


羊栖菜是重要的大型经济海藻之一,在食品、医药、化工领域都有广泛应用。本研究对羊栖菜养殖生产中常见的品系“鹿丰1号”及另外2种品系进行了DNA指纹分析及遗传变异的研究,构建了遗传指纹图谱,分析了不同种群的遗传关系,为羊栖菜的种质鉴定及遗传选育提供了理论依据。运用RAPD分子标记技术,对5个羊栖菜的种群中共125个个体进行了分析,从300个引物中筛选出12条随机扩增引物共扩增135个位点,多态位点比率为84.4%。从中选择了4个多态性位点,构建了5种羊栖菜DNA指纹图谱,并获得了“鹿丰1号”SCAR标记。另外,进行了5种羊栖菜种群的遗传背景的分析,结果表明“鹿丰1号”与品系2可以明显的与野生种群分开。根据Dice常数计算所得的5个种群的遗传距离在0.1116-0.2563之间。运用ISSR分子标记技术,对5个种群的125个羊栖菜个体进行分析,通过90条引物的筛选,获得10条ISSR引物,扩增出92个位点,多态位点比率为67.4%。5个种群的遗传距离在0.0863-0.1454之间。本研究以铜藻作为外群,通过2种遗传标记分析,证明铜藻与5种羊栖菜种群的遗传距离均远远大于其种群之间的遗传距离;另外,“鹿丰1号”不同年份的种群之间的遗传距离均为其中的最小值,相关结果对羊栖菜遗传选育和种质鉴定等有参考价值。

全文目录


摘要  4-5
Abstract  5-9
一 文献综述  9-16
  1.1 羊栖菜生物学特征  9-10
  1.2 羊栖菜的化学及医药应用  10-11
  1.3 羊栖菜组织培养研究进展  11
  1.4 羊栖菜的养殖及育苗  11-12
  1.5 马尾藻属遗传选育的研究  12-13
  1.6 分子标记技术在马尾藻研究中的应用  13-14
  1.7 分子标记方法的评价  14-15
  1.8 研究目的及意义  15-16
二 羊栖菜养殖品系的RAPD 遗传多样性分析  16-25
  2.1 材料与方法  16-21
    2.1.1 试剂和仪器  16-17
    2.1.2 DNA 提取  17-18
    2.1.3 DNA 纯度和浓度测定  18-19
    2.1.4 RAPD 反应体系  19-20
    2.1.5 引物筛选  20
    2.1.6 数据分析  20-21
  2.2 结果与分析  21-24
  2.3 小结  24-25
三 羊栖菜RAPD 指纹图谱的建立及SCAR 标记  25-33
  3.1 材料与方法  25-29
    3.1.1 材料  25
    3.1.2 试剂  25
    3.1.3 试剂的配制  25
    3.1.4 RAPD 反应条件  25
    3.1.5 目的片段的回收  25-26
    3.1.6 感受态细胞的制备  26-27
    3.1.7 与载体的连接  27
    3.1.8 转化  27
    3.1.9 阳性克隆的检测  27-28
    3.1.10 测序分析  28
    3.1.11 SCAR 引物的设计与验证  28-29
  3.2 SCAR 标记的筛选与验证结果  29-30
  3.3 指纹图谱的建立  30-31
  3.4 小结  31-33
四 羊栖菜养殖品系的ISSR 分析  33-40
  4.1 材料与方法  33-35
    4.1.1 材料  33
    4.1.2 试剂和仪器  33
    4.1.3 DNA 提取  33
    4.1.4 ISSR 反应体系  33-34
    4.1.5 引物筛选  34-35
    4.1.6 数据分析  35
  4.2 结果与分析  35-39
  4.3 小结  39-40
五 结论  40-41
六 参考文献  41-46
硕士期间已完成的文章  46-47
致谢  47

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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产养殖技术 > 各种海产动植物养殖 > 藻类养殖
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