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羊栖菜养殖品系DNA指纹分析及遗传变异的研究
作 者: 吕慧
导 师: 段德麟
学 校: 中国科学院研究生院(海洋研究所)
专 业: 海洋生物学
关键词: 羊栖菜 DNA指纹图谱 种群遗传分析 RAPD(Random amplified polymorphic DNA) ISSR(Inter-simple sequence repeat) SCAR(Sequence characterized amplified region)
分类号: S968.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
羊栖菜是重要的大型经济海藻之一,在食品、医药、化工领域都有广泛应用。本研究对羊栖菜养殖生产中常见的品系“鹿丰1号”及另外2种品系进行了DNA指纹分析及遗传变异的研究,构建了遗传指纹图谱,分析了不同种群的遗传关系,为羊栖菜的种质鉴定及遗传选育提供了理论依据。运用RAPD分子标记技术,对5个羊栖菜的种群中共125个个体进行了分析,从300个引物中筛选出12条随机扩增引物共扩增135个位点,多态位点比率为84.4%。从中选择了4个多态性位点,构建了5种羊栖菜DNA指纹图谱,并获得了“鹿丰1号”SCAR标记。另外,进行了5种羊栖菜种群的遗传背景的分析,结果表明“鹿丰1号”与品系2可以明显的与野生种群分开。根据Dice常数计算所得的5个种群的遗传距离在0.1116-0.2563之间。运用ISSR分子标记技术,对5个种群的125个羊栖菜个体进行分析,通过90条引物的筛选,获得10条ISSR引物,扩增出92个位点,多态位点比率为67.4%。5个种群的遗传距离在0.0863-0.1454之间。本研究以铜藻作为外群,通过2种遗传标记分析,证明铜藻与5种羊栖菜种群的遗传距离均远远大于其种群之间的遗传距离;另外,“鹿丰1号”不同年份的种群之间的遗传距离均为其中的最小值,相关结果对羊栖菜遗传选育和种质鉴定等有参考价值。
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全文目录
摘要 4-5 Abstract 5-9 一 文献综述 9-16 1.1 羊栖菜生物学特征 9-10 1.2 羊栖菜的化学及医药应用 10-11 1.3 羊栖菜组织培养研究进展 11 1.4 羊栖菜的养殖及育苗 11-12 1.5 马尾藻属遗传选育的研究 12-13 1.6 分子标记技术在马尾藻研究中的应用 13-14 1.7 分子标记方法的评价 14-15 1.8 研究目的及意义 15-16 二 羊栖菜养殖品系的RAPD 遗传多样性分析 16-25 2.1 材料与方法 16-21 2.1.1 试剂和仪器 16-17 2.1.2 DNA 提取 17-18 2.1.3 DNA 纯度和浓度测定 18-19 2.1.4 RAPD 反应体系 19-20 2.1.5 引物筛选 20 2.1.6 数据分析 20-21 2.2 结果与分析 21-24 2.3 小结 24-25 三 羊栖菜RAPD 指纹图谱的建立及SCAR 标记 25-33 3.1 材料与方法 25-29 3.1.1 材料 25 3.1.2 试剂 25 3.1.3 试剂的配制 25 3.1.4 RAPD 反应条件 25 3.1.5 目的片段的回收 25-26 3.1.6 感受态细胞的制备 26-27 3.1.7 与载体的连接 27 3.1.8 转化 27 3.1.9 阳性克隆的检测 27-28 3.1.10 测序分析 28 3.1.11 SCAR 引物的设计与验证 28-29 3.2 SCAR 标记的筛选与验证结果 29-30 3.3 指纹图谱的建立 30-31 3.4 小结 31-33 四 羊栖菜养殖品系的ISSR 分析 33-40 4.1 材料与方法 33-35 4.1.1 材料 33 4.1.2 试剂和仪器 33 4.1.3 DNA 提取 33 4.1.4 ISSR 反应体系 33-34 4.1.5 引物筛选 34-35 4.1.6 数据分析 35 4.2 结果与分析 35-39 4.3 小结 39-40 五 结论 40-41 六 参考文献 41-46 硕士期间已完成的文章 46-47 致谢 47
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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产养殖技术 > 各种海产动植物养殖 > 藻类养殖
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