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腐烂茎线虫种内不同群体形态及遗传分析
作 者: 黄健
导 师: 林茂松
学 校: 南京农业大学
专 业: 植物病理学
关键词: 腐烂茎线虫 ITS1-PCR-RFLP 测序 基因型 形态测量
分类号: S432.45
类 型: 硕士论文
年 份: 2008年
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内容摘要
甘薯茎线虫病是农业上生产的重要病害,其病原腐烂茎线虫(Ditylenchusdeswuctor)为我国禁止进境植物检疫性有害生物。腐烂茎线虫最初是在马铃薯上发现的,并导致马铃薯腐烂,但在我国主要危害甘薯的生产,也可以侵染当归,盆栽接种试验表明也可以侵染花生。本实验以来自国内的13个腐烂茎线虫群体和1个荷兰的鳞球茎茎线虫群体为研究材料,做了以下几方面的研究:对来自国内的13个腐烂茎线虫群体和1个荷兰的鳞球茎茎线虫群体进行了ITSl区的扩增和5种限制性内切酶RsaⅠ、HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和AluⅠ的限制性片段长度多态性(RFLP)分析,发现13个腐烂茎线虫群体存在两种不同的酶切图谱,两种图谱在RsaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ和AluⅠ4种酶的酶切位点上存在差异,而鳞球茎茎线虫群体的RFLP图谱与腐烂茎线虫的RFLP图谱相比则在5种限制性内切酶的酶切位点上都存在差异。根据RFLP酶切图谱的差异,可以将腐烂茎线虫的13个群体分为A和B两个基因型。A基因型包括DeSD1、DeSD2、DeSD3和DeJS1四个群体,B基因型包括DeAH1、DeAH2、DeHB1、DeHB2、DeJS2、DeSX、DeSD4、DeTJ1和DeTJ2九个群体。对ITS1区的序列进行比对,发现A基因型4个群体的差异在1%~4%之间,B基因型9个群体的差异在0~1%之间,腐烂茎线虫种内不同基因型群体之间的差异在29%~30%之间,鳞球茎茎线虫与腐烂茎线虫种间的差异在39%~48%之间。对4个腐烂茎线虫群体和1个鳞球茎茎线虫群体进行了形态测计,发现腐烂茎线虫两个基因型群体间除雌虫在4个形态测计值c值、尾长、V值和V’值存在显著差异外,在其他形态测计值上无显著差异。ITS1区的RFLP图谱和序列比对以及形态测计数据都表明中国的腐烂茎线虫群体存在两个基因型。
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全文目录
摘要 6-7 ABSTRACT 7-9 前言 9-10 上篇 文献综述 10-22 第一章 腐烂茎线虫概述 11-14 1 腐烂茎线虫的经济重要性 11 2 腐烂茎线虫的形态描述 11 3 腐烂茎线虫的分类地位 11 4 腐烂茎线虫在全世界及我国的分布 11-12 5 腐烂茎线虫的寄主范围 12-13 6 腐烂茎线虫的危害症状 13 7 腐烂茎线虫的生物学特性 13-14 第二章 植物寄生线虫的分类鉴定方法 14-22 1 形态学特征分类鉴定 14 1.1 光学显微镜技术 14 1.2 电子显微镜技术 14 2 鉴别寄主反应鉴定 14-15 3 分子鉴定 15-20 3.1 同工酶分析 15-16 3.2 DNA技术 16-20 4 特异引物的应用 20-22 4.1 基于rDNA-ITS区域上的特异性引物 20 4.2 基于基因组DNA的特异性引物 20-22 下篇 研究内容 22-41 第一章 腐烂茎线虫的遗传分析 23-32 1 材料与方法 24-26 1.1 材料 24-25 1.2 实验方法 25-26 2 结果与分析 26-30 2.1 PCR扩增 26-27 2.2 RFLP分析 27-29 2.3 PCR扩增产物序列比对 29-30 3 讨论 30-32 第二章 腐烂茎线虫不同群体形态的研究 32-41 1 材料与方法 33-35 1.1 线虫种群 33 1.2 实验方法 33-35 2 结果与分析 35-38 3 讨论 38-41 全文结论 41-43 参考文献 43-47 附录 二种茎线虫核糖体ITS区序列比较结果 47-55 致谢 55
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 植物病害及其防治 > 侵(传)染性病害 > 线虫病
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