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福建省HIV-1耐药基因变异现况及MSM HIV-1感染者流行毒株亚型分析研究

作　者: 谢美榕
导　师: 严延生
学　校: 福建医科大学
专　业: 流行病学与卫生统计学
关键词: 艾滋病人类免疫缺陷病毒 1 型耐药基因变异亚型男男性接触者
分类号: R512.91
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 61次
引　用: 2次
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内容摘要

本研究采用基因型耐药性检测的方法,对2008至2010年福建省接受艾滋病抗病毒治疗的患者的CD4+T淋巴细胞计数和病毒载量水平进行监测,评价患者的免疫状态和病毒抑制状况,并对治疗半年以上病毒载量高于1000copies/ml的患者血液样本采用RT-PCR方法扩增pol区蛋白酶和反转录酶基因,扩增阳性片段测序后使用Contig Express软件拼接编辑,序列提交至斯坦福大学HIV耐药数据库获得耐药解释信息。通过对样本的耐药突变位点及频率、耐药种类及程度的分析了解福建省抗病毒治疗人群HIV耐药毒株的发生状况及水平。同时为了解HIV耐药毒株是否发生传播,选择近年研究显示传播性耐药发生的最主要的高危人群——MSM人群为研究对象,参考耐药毒株监测方案,选取2007~2010年福建省艾滋病监测系统发现的尚未开展抗病毒治疗的部分MSM感染者为研究对象,分析原发性耐药基因突变情况。此外,同时研究该人群样本的gag p17-24基因区、env C2-V5或gp41基因区,结合pol基因区序列资料与流行病资料进行研究,阐明HIV-1流行毒株在福建省MSM HIV-1感染人群中的基因亚型分布。治疗病例的病毒载量检测结果显示,福建省艾滋病病人的总体治疗效果良好,2008年至2010年病毒抑制率分别为88.8%(111/125),84.4%(173/205)和90.3%(270/299)。CD4+T淋巴细胞检测结果显示,治疗病例的免疫状态随着治疗时间延长逐渐恢复,但随后由于耐药出现等原因导致的治疗失败,而出现下降趋势。病毒抑制失败病例的基因耐药检测结果显示25例对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)和核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)出现低度以上程度的耐药。4例对部分蛋白酶抑制剂(PIS)中高度耐药。病毒抑制失败病例的耐药率为69.4%(25/36)。相对治疗人群的较高的耐药突变发生率,福建省近期感染且尚未开展抗病毒治疗的MSM HIV-1感染者的耐药基因突变率显著较低。50例研究样本中仅5例出现PIS相关位点突变,仅一例数据库解释为对NFV中度耐药,10例样本出现NNRTIs和NRTIS的耐药相关突变,仅1例解释为对NNRTIs的潜在低度耐药。亚型结果显示,所研究的福建省治疗病人中同时存在B、C两种亚型和CRF01_AE、CRF12_BF2种重组毒株,其中以CRF01_AE亚型为主,占80.6%(29/36)。MSM人群的亚型类别也存在多样化特点,同时存在CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型,也以CRF01_AE亚型为主,占研究对象的60%(30/50)。三个基因区系统进化树结构相似。基因距离分析显示env区基因变异显著大于gag和pol区,B亚型毒株基因距离最长,提示B亚型毒株在福建MSM人群中流行时间最长。MSM人群的各区基因离散率相对我省其他一般人群较小,说明HIV-1在福建省MSM人群中的流行时间相对较短,需警惕HIV-1在该人群中快速传播的风险。

全文目录

英文缩略词表  4-5
中文摘要  5-7
英文摘要  7-10
第一部分福建省HIV-1耐药基因变异现况研究  10-51
  前言  10-12
  实验材料  12-14
  实验方法  14-22
  结果  22-47
    1 福建省艾滋病抗病毒治疗患者耐药基因现况  22-42
    2 福建省MSM HIV-1 感染者原发性耐药基因变异现况  42-47
  讨论  47-49
  结论  49-51
第二部分福建省MSM HIV-1 感染者流行毒株亚型分析  51-69
  前言  51-53
  材料方法  53-55
  结果  55-66
  讨论  66-68
  结论  68-69
参考文献  69-73
综述  73-82
  参考文献  78-82
致谢  82

福建省HIV-1耐药基因变异现况及MSM HIV-1感染者流行毒株亚型分析研究

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