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水稻抗白叶枯病新基因Xa32(t)的精细定位
作 者: 闫影
导 师: 刘丕庆;赵开军
学 校: 广西大学
专 业: 作物遗传育种
关键词: 水稻 白叶枯病 精细定位 Xa32(t)
分类号: S511
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
下 载: 24次
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内容摘要
水稻(Oryza. sativa)是重要的粮食作物,在全球的粮食生产中占有着重要作用。白叶枯病(Bacterial Blight, BB)是世界水稻生产中最严重的病害之一,一般造成水稻减产20%—30%,严重时甚至绝收。它是由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌变种(Xanthomonas oryzae pv. oryzae)引起的。目前,生产中一般采取化学防治和种植抗病品种防治病害的发生。但是,化学防治成效不大而且会对环境造成破坏。经实践证明,种植抗病品种是防治病害发生最环保、有效的途径。通过多菌系接种后调查发现材料C4064内存在一个不同于其他抗白叶枯病基因的新基因,目前将该基因定命名为Xa32(t)。郑崇珂等对其进行了系统研究,将此基因定位在水稻11染色体长臂末端2.0cM范围内。本研究是在前面研究的基础上对Xa32(t)基因进行精细定位,获得如下结果:1、多菌系鉴定:通过多菌接种系鉴定及抗谱比较,证明了C4064内含有一个抗白叶枯病新基因,同时验证了之前研究的正确性。2、Xa32(t)基因的精细定位:运用分离集团分析法(BSA),利用CAPS等分子标记对Xa32(t)基因进行精细定位。对F4、F5和F6多个分离群体进行遗传连锁分析,利用7个与Xa32(t)基因连锁的分子标记,将该基因进一步定位于水稻11号染色体长臂末端0.14cM范围内,物理距离为113Kb。3、交换单株分离后代的鉴定:对已筛选出交换单株后代分离株接种鉴定,其全部为感病。4、培育近等基因系:通过杂交和回交的手段将抗病基因转育到感病亲本JG30(金刚30)的遗传背景下,目前近等基因系已培育至BC6F1代。
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全文目录
摘要 4-5 Abstract 5-9 1 前言 9-26 1.1 水稻抗白叶枯病研究 9-19 1.1.1 白叶枯病菌无毒基因 9-12 1.1.2 水稻白叶枯抗病基因 12-18 1.1.3 水稻与白叶枯病菌的互作 18-19 1.2 几种常见的分子标记定位方法 19-22 1.2.1 RFLP(Restriction fragment length polymorphi sm,限制性片段长度多性 19-20 1.2.2 RAPD(Random-amplified polymorphic DNA,随即扩增多态性) 20 1.2.3 AFLP(Amplified fragment length polymorphism,扩增片段长度多态性) 20 1.2.4 SSR(Simple sequence repeats,简单序列重复) 20-21 1.2.5 EST(Expressed sequence tags,表达序列标签) 21 1.2.6 CAPS(Cleaved amplified polymorphic sequence,酶切扩增多态性序列) 21-22 1.2.7 SNP(Single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性) 22 1.3 基因克隆方法 22-24 1.3.1 图位克隆 22-23 1.3.2 同源序列法 23 1.3.3 转座子标签法 23 1.3.4 蛋白质组学技术 23-24 1.3.5 基因芯片技术 24 1.3.6 mRNA差别显示技术 24 1.4 水稻白叶枯抗病基因在育种中的应用 24-25 1.5 本研究的目的和意义 25-26 2 材料与方法 26-39 2.1 材料 26-35 2.1.1 水稻材料 26 2.1.2 水稻白叶枯病菌 26-27 2.1.3 分子标记引物 27-35 2.2 方法 35-39 2.2.1 接种调查 35 2.2.2 DNA的提取 35-36 2.2.3 引物设计 36 2.2.4 PCR反应 36-37 2.2.5 PCR产物电泳检测 37-38 2.2.6 特异性片段的回收 38 2.2.7 测序 38 2.2.8 限制性酶切反应 38-39 3 结果与分析 39-49 3.1 作图群体构建 39-40 3.2 标记的筛选和开发 40-42 3.3 分离群体感病单株分子检测 42-47 3.4 测序结果分析 47-48 3.5 Xa32基因遗传图谱的构建 48-49 3.6 Xa32基因物理图谱的构建 49 4 讨论 49-51 4.1 野生稻抗病基因的鉴定 49-50 4.2 Xa32(t)的精细定位 50-51 4.2.1 抗病基因的成簇分布 50 4.2.2 生物信息学分析技术的应用 50-51 4.3 下一步工作计划 51 5 结论 51-52 致谢 52-53 参考文献 53-58 附录 58-59 攻读学位期间发表论文情况 59
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 禾谷类作物 > 稻
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